FuNGI

U5H6Q8

Protein Details

Accession

U5H6Q8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-293	QGARRKKKDGAVKKRKRPMVS	Basic
300-322	DGGARRQKKTKSKKGVAGRRRAT	Basic
363-393	ADDDAGKSKRKKKVRTRKPLRKVKPEDDDAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-290	ARRKKKDGAVKKRKRP
302-331	GARRQKKTKSKKGVAGRRRATNGKARKKSR
368-386	GKSKRKKKVRTRKPLRKVK

Subcellular Location(s)

mito 11.5, cyto_mito 11.5, cyto 10.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MAPVASTSKAPATVKLTAAEKRLIEIGLAAPKGQITQAELLAKSNLTTQAVADAVNSILRKNLVQLLRTSTGSVEFRFIAKEEAKAMGAMDSDEKLVLDHIKDANNNGIWTKFLHNKTGLPRTTINKVLKTLEGRKVVKTVKSVKHPTRKIYMMSNIAPSVELTGGPWFTDNELDMEFVEALKKITLAYLTKQTRPRSYKTKNAQPNELPRFPLWPVSASPRLPRVRDVLDYITESGIAVSVELNDEHVESLLELMIYEGTVERILVQTPADQGARRKKKDGAVKKRKRPMVSSDEEDSDGGARRQKKTKSKKGVAGRRRATNGKARKKSRLDSTALDDDDDDDDDSDASADFDEDEERRSDADDDAGKSKRKKKVRTRKPLRKVKPEDDDASSVTNDSTSESSASDRDEDDEEEEERLAALRHQREGGVNDYVYRTIREYHPVIGWTDMPCGKCPVESFCCEPPRRFAQASAVSASRGSRRPGFLSSGRPKIGIELEGGMKGVGMIGGAGAAIGISTAKWGETKGVVGNGVAPVNPRDCQYFKKWLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.36
4	0.35
5	0.38
6	0.38
7	0.33
8	0.3
9	0.31
10	0.27
11	0.22
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.2
16	0.19
17	0.17
18	0.17
19	0.17
20	0.17
21	0.14
22	0.12
23	0.15
24	0.18
25	0.22
26	0.22
27	0.23
28	0.23
29	0.22
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.16
34	0.16
35	0.15
36	0.16
37	0.17
38	0.16
39	0.13
40	0.11
41	0.1
42	0.12
43	0.12
44	0.1
45	0.11
46	0.13
47	0.13
48	0.15
49	0.22
50	0.23
51	0.25
52	0.27
53	0.32
54	0.35
55	0.35
56	0.33
57	0.26
58	0.27
59	0.27
60	0.25
61	0.21
62	0.18
63	0.19
64	0.19
65	0.19
66	0.2
67	0.19
68	0.2
69	0.2
70	0.21
71	0.2
72	0.19
73	0.18
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.11
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.11
85	0.1
86	0.13
87	0.16
88	0.19
89	0.2
90	0.21
91	0.25
92	0.25
93	0.25
94	0.22
95	0.19
96	0.17
97	0.19
98	0.22
99	0.25
100	0.26
101	0.31
102	0.32
103	0.37
104	0.44
105	0.51
106	0.47
107	0.43
108	0.45
109	0.44
110	0.47
111	0.5
112	0.48
113	0.42
114	0.43
115	0.41
116	0.41
117	0.43
118	0.45
119	0.44
120	0.48
121	0.46
122	0.45
123	0.5
124	0.49
125	0.47
126	0.47
127	0.49
128	0.47
129	0.55
130	0.63
131	0.66
132	0.72
133	0.74
134	0.72
135	0.69
136	0.66
137	0.59
138	0.55
139	0.52
140	0.47
141	0.43
142	0.4
143	0.34
144	0.3
145	0.27
146	0.21
147	0.16
148	0.11
149	0.09
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.08
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.08
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.09
174	0.09
175	0.12
176	0.21
177	0.24
178	0.3
179	0.37
180	0.41
181	0.48
182	0.51
183	0.55
184	0.56
185	0.6
186	0.64
187	0.67
188	0.72
189	0.72
190	0.71
191	0.72
192	0.67
193	0.71
194	0.69
195	0.62
196	0.54
197	0.45
198	0.43
199	0.37
200	0.35
201	0.25
202	0.19
203	0.18
204	0.22
205	0.27
206	0.25
207	0.27
208	0.31
209	0.33
210	0.33
211	0.33
212	0.31
213	0.3
214	0.3
215	0.31
216	0.24
217	0.22
218	0.22
219	0.2
220	0.16
221	0.13
222	0.11
223	0.08
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.14
261	0.24
262	0.33
263	0.34
264	0.37
265	0.39
266	0.45
267	0.54
268	0.6
269	0.61
270	0.64
271	0.72
272	0.78
273	0.82
274	0.82
275	0.74
276	0.68
277	0.64
278	0.61
279	0.56
280	0.51
281	0.45
282	0.41
283	0.38
284	0.34
285	0.26
286	0.18
287	0.14
288	0.11
289	0.13
290	0.15
291	0.19
292	0.26
293	0.34
294	0.43
295	0.53
296	0.63
297	0.7
298	0.73
299	0.78
300	0.81
301	0.84
302	0.82
303	0.82
304	0.76
305	0.71
306	0.68
307	0.63
308	0.57
309	0.56
310	0.58
311	0.58
312	0.62
313	0.62
314	0.66
315	0.7
316	0.71
317	0.7
318	0.66
319	0.6
320	0.53
321	0.54
322	0.5
323	0.44
324	0.38
325	0.29
326	0.23
327	0.2
328	0.18
329	0.12
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.11
349	0.1
350	0.13
351	0.15
352	0.16
353	0.2
354	0.24
355	0.28
356	0.34
357	0.41
358	0.46
359	0.53
360	0.61
361	0.68
362	0.76
363	0.82
364	0.87
365	0.9
366	0.93
367	0.95
368	0.95
369	0.94
370	0.94
371	0.91
372	0.89
373	0.85
374	0.8
375	0.73
376	0.66
377	0.58
378	0.48
379	0.41
380	0.32
381	0.23
382	0.17
383	0.14
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.13
396	0.14
397	0.14
398	0.15
399	0.16
400	0.15
401	0.15
402	0.14
403	0.12
404	0.1
405	0.1
406	0.08
407	0.1
408	0.16
409	0.18
410	0.2
411	0.21
412	0.23
413	0.25
414	0.28
415	0.29
416	0.25
417	0.22
418	0.22
419	0.22
420	0.23
421	0.2
422	0.19
423	0.16
424	0.16
425	0.18
426	0.23
427	0.24
428	0.26
429	0.27
430	0.27
431	0.27
432	0.25
433	0.25
434	0.2
435	0.22
436	0.22
437	0.21
438	0.22
439	0.24
440	0.23
441	0.22
442	0.23
443	0.26
444	0.28
445	0.31
446	0.34
447	0.38
448	0.47
449	0.49
450	0.5
451	0.49
452	0.51
453	0.54
454	0.51
455	0.45
456	0.45
457	0.49
458	0.49
459	0.45
460	0.39
461	0.33
462	0.32
463	0.32
464	0.28
465	0.25
466	0.27
467	0.29
468	0.33
469	0.36
470	0.38
471	0.43
472	0.41
473	0.48
474	0.52
475	0.54
476	0.51
477	0.48
478	0.45
479	0.42
480	0.4
481	0.31
482	0.24
483	0.2
484	0.2
485	0.2
486	0.2
487	0.15
488	0.12
489	0.1
490	0.09
491	0.05
492	0.04
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.02
499	0.02
500	0.02
501	0.02
502	0.02
503	0.02
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.06
508	0.07
509	0.11
510	0.12
511	0.15
512	0.17
513	0.19
514	0.19
515	0.19
516	0.2
517	0.19
518	0.19
519	0.17
520	0.16
521	0.17
522	0.2
523	0.21
524	0.2
525	0.24
526	0.27
527	0.33
528	0.38
529	0.46

U5H6Q8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer