Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HDJ8

Protein Details
Accession U5HDJ8    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-137VSTTSSKTDKKKMKIHQTAADHydrophilic
153-178PEVILKPTKRVPNKVKNKGKERMIPPHydrophilic
518-538PSKLVPKTKRRVRSKASKSSDHydrophilic
813-852MHPPEPPTKSPKVKKPKAAAAKKTKKKKKDKAADASEEEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-174KPTKRVPNKVKNKGKER
248-251RRKK
386-413RKPTRDKVIREAAEIRREGWERERRRGE
524-532KTKRRVRSK
729-740KSTGRKVGRPRK
819-843PTKSPKVKKPKAAAAKKTKKKKKDK
922-928GSRRRRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MRSRSESPAELIEDSEPERARPGSASDEEDAPIASHSVRLDLGASTTSSEPNEPVPSTSTSVPKLLGRRIPPWERQRAAPLASTSSHMRKLSIESNSSSASYSMKRPYSTSIYRADVSTTSSKTDKKKMKIHQTAADLLSESASGSDHSPPKPEVILKPTKRVPNKVKNKGKERMIPPPSPVPSSPSSALDVMMDSSIEVYDLRSNTSESDQNSDSEGDLAPPVGSRLQLDRFKYEKPTKDDTLALKRRKKKVLLFPSVDPVVLPSRARVRLLDRCPLCDLYFSTSRSAEWKEGHLRTCALTKDYTSETVRVRVEQQILNLAAEAESRRLDPSRTLFDRMVGKGEGANAHIRVVTVVGVEVGDGAEWTKEGKEIGKMQTELEKGMRKPTRDKVIREAAEIRREGWERERRRGEEEAKKEWGQAQTPRATGVLKPESASSRQVFAGRIEGALGALGGSGLTQAPSKRRESQSDEGDVFLVDDSLDADQMMELPSTQLFAPSSLVENCAETNEIQAVAIPSKLVPKTKRRVRSKASKSSDSDSDTDEERLTRSLWSAAAGHDDEIIQEVVSPPPTRTRLSTHPVSPPSSPSSLLLLSTPEHDRLTPHRRRVEVQMDTPSTMDGSPTRALRSSMTALGLGRDDDISAASGTGGPDRPSRSVTDAMVIDDDDDAKSDSASDLGEGAWEDAIYNDGVMMWDGREEIGTLAVSDDGSSSSEEEPIAAVAKRSATKSTGRKVGRPRKASTPTSISSPSSSASSGPDEVTVYNSVNPPPGCPDYSSQPLETLRRQVKGFGFRVSKEKSVLVDQLIKVWIAMHPPEPPTKSPKVKKPKAAAAKKTKKKKKDKAADASEEEVVDERSLSAKMRESVLAHEAIYLKVLRYEPIFFDDIVALATGSKIKVAKAVLAKWLDDQCITFYTQDPTKGSRRRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.21
4 0.19
5 0.22
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.23
10 0.25
11 0.27
12 0.31
13 0.3
14 0.31
15 0.3
16 0.28
17 0.25
18 0.18
19 0.15
20 0.12
21 0.1
22 0.11
23 0.1
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.13
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.19
39 0.23
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.25
44 0.27
45 0.29
46 0.31
47 0.29
48 0.3
49 0.31
50 0.32
51 0.35
52 0.39
53 0.42
54 0.42
55 0.46
56 0.54
57 0.59
58 0.64
59 0.68
60 0.71
61 0.67
62 0.66
63 0.67
64 0.63
65 0.58
66 0.53
67 0.46
68 0.39
69 0.37
70 0.36
71 0.34
72 0.33
73 0.37
74 0.32
75 0.31
76 0.3
77 0.35
78 0.39
79 0.39
80 0.38
81 0.34
82 0.37
83 0.37
84 0.35
85 0.3
86 0.24
87 0.21
88 0.2
89 0.23
90 0.28
91 0.31
92 0.32
93 0.33
94 0.38
95 0.44
96 0.46
97 0.46
98 0.44
99 0.44
100 0.44
101 0.42
102 0.38
103 0.3
104 0.3
105 0.3
106 0.25
107 0.25
108 0.28
109 0.34
110 0.39
111 0.48
112 0.52
113 0.55
114 0.64
115 0.7
116 0.77
117 0.82
118 0.82
119 0.79
120 0.75
121 0.72
122 0.63
123 0.54
124 0.43
125 0.33
126 0.25
127 0.18
128 0.13
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.14
134 0.19
135 0.2
136 0.24
137 0.25
138 0.27
139 0.29
140 0.32
141 0.32
142 0.35
143 0.45
144 0.45
145 0.52
146 0.57
147 0.63
148 0.65
149 0.7
150 0.72
151 0.72
152 0.8
153 0.82
154 0.86
155 0.87
156 0.89
157 0.87
158 0.85
159 0.83
160 0.78
161 0.78
162 0.75
163 0.68
164 0.63
165 0.63
166 0.57
167 0.52
168 0.46
169 0.41
170 0.36
171 0.38
172 0.35
173 0.29
174 0.29
175 0.25
176 0.25
177 0.2
178 0.17
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.18
195 0.21
196 0.18
197 0.23
198 0.22
199 0.22
200 0.23
201 0.22
202 0.19
203 0.16
204 0.15
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.12
215 0.19
216 0.25
217 0.27
218 0.33
219 0.35
220 0.37
221 0.45
222 0.5
223 0.5
224 0.52
225 0.57
226 0.53
227 0.53
228 0.56
229 0.53
230 0.56
231 0.57
232 0.59
233 0.61
234 0.66
235 0.72
236 0.75
237 0.76
238 0.74
239 0.76
240 0.78
241 0.79
242 0.74
243 0.68
244 0.65
245 0.58
246 0.48
247 0.37
248 0.28
249 0.21
250 0.19
251 0.17
252 0.14
253 0.2
254 0.22
255 0.24
256 0.24
257 0.28
258 0.35
259 0.39
260 0.45
261 0.39
262 0.4
263 0.42
264 0.42
265 0.36
266 0.29
267 0.26
268 0.23
269 0.27
270 0.25
271 0.25
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.26
276 0.24
277 0.21
278 0.25
279 0.31
280 0.34
281 0.35
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.31
286 0.27
287 0.21
288 0.18
289 0.17
290 0.19
291 0.2
292 0.22
293 0.2
294 0.23
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.24
299 0.25
300 0.25
301 0.27
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.19
308 0.15
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.14
319 0.18
320 0.25
321 0.27
322 0.3
323 0.29
324 0.32
325 0.35
326 0.32
327 0.31
328 0.23
329 0.2
330 0.17
331 0.18
332 0.15
333 0.12
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.02
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.1
360 0.14
361 0.18
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.26
366 0.25
367 0.23
368 0.22
369 0.24
370 0.2
371 0.29
372 0.32
373 0.3
374 0.36
375 0.41
376 0.48
377 0.5
378 0.53
379 0.51
380 0.57
381 0.55
382 0.52
383 0.51
384 0.45
385 0.43
386 0.4
387 0.33
388 0.28
389 0.28
390 0.27
391 0.29
392 0.35
393 0.34
394 0.43
395 0.48
396 0.46
397 0.5
398 0.54
399 0.54
400 0.54
401 0.55
402 0.5
403 0.49
404 0.47
405 0.43
406 0.41
407 0.35
408 0.29
409 0.28
410 0.29
411 0.27
412 0.27
413 0.27
414 0.24
415 0.22
416 0.19
417 0.21
418 0.19
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.19
423 0.2
424 0.23
425 0.17
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.17
430 0.16
431 0.16
432 0.13
433 0.12
434 0.1
435 0.09
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.03
440 0.02
441 0.02
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.1
450 0.13
451 0.17
452 0.24
453 0.27
454 0.33
455 0.4
456 0.45
457 0.46
458 0.46
459 0.43
460 0.36
461 0.33
462 0.27
463 0.19
464 0.12
465 0.08
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.09
488 0.08
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.09
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.05
505 0.05
506 0.09
507 0.11
508 0.15
509 0.2
510 0.29
511 0.39
512 0.48
513 0.57
514 0.63
515 0.71
516 0.74
517 0.79
518 0.81
519 0.81
520 0.8
521 0.76
522 0.7
523 0.65
524 0.6
525 0.52
526 0.43
527 0.34
528 0.29
529 0.23
530 0.21
531 0.18
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.08
556 0.09
557 0.08
558 0.14
559 0.17
560 0.18
561 0.2
562 0.25
563 0.29
564 0.35
565 0.39
566 0.37
567 0.41
568 0.43
569 0.43
570 0.39
571 0.35
572 0.33
573 0.29
574 0.27
575 0.21
576 0.2
577 0.18
578 0.17
579 0.14
580 0.11
581 0.11
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.12
587 0.15
588 0.22
589 0.32
590 0.37
591 0.43
592 0.47
593 0.49
594 0.52
595 0.57
596 0.58
597 0.53
598 0.49
599 0.48
600 0.44
601 0.42
602 0.39
603 0.31
604 0.23
605 0.18
606 0.14
607 0.08
608 0.1
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.15
613 0.16
614 0.16
615 0.2
616 0.19
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.15
621 0.15
622 0.15
623 0.11
624 0.09
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.06
635 0.08
636 0.09
637 0.1
638 0.13
639 0.16
640 0.18
641 0.19
642 0.21
643 0.23
644 0.24
645 0.23
646 0.23
647 0.21
648 0.2
649 0.19
650 0.16
651 0.13
652 0.1
653 0.1
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.05
680 0.05
681 0.04
682 0.04
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.08
706 0.1
707 0.08
708 0.08
709 0.09
710 0.12
711 0.14
712 0.16
713 0.18
714 0.19
715 0.27
716 0.35
717 0.41
718 0.48
719 0.48
720 0.54
721 0.63
722 0.7
723 0.72
724 0.7
725 0.68
726 0.69
727 0.74
728 0.71
729 0.67
730 0.63
731 0.54
732 0.53
733 0.51
734 0.42
735 0.36
736 0.33
737 0.27
738 0.21
739 0.2
740 0.16
741 0.15
742 0.17
743 0.16
744 0.15
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.16
749 0.15
750 0.13
751 0.14
752 0.16
753 0.16
754 0.21
755 0.21
756 0.19
757 0.24
758 0.26
759 0.25
760 0.26
761 0.29
762 0.29
763 0.36
764 0.38
765 0.33
766 0.33
767 0.36
768 0.38
769 0.39
770 0.42
771 0.4
772 0.41
773 0.41
774 0.43
775 0.46
776 0.5
777 0.49
778 0.48
779 0.47
780 0.45
781 0.52
782 0.51
783 0.48
784 0.41
785 0.4
786 0.35
787 0.35
788 0.36
789 0.32
790 0.33
791 0.3
792 0.31
793 0.3
794 0.27
795 0.22
796 0.2
797 0.17
798 0.14
799 0.16
800 0.15
801 0.18
802 0.21
803 0.28
804 0.31
805 0.34
806 0.38
807 0.45
808 0.54
809 0.59
810 0.67
811 0.72
812 0.77
813 0.83
814 0.85
815 0.86
816 0.86
817 0.87
818 0.87
819 0.88
820 0.89
821 0.89
822 0.91
823 0.91
824 0.91
825 0.92
826 0.92
827 0.92
828 0.92
829 0.93
830 0.93
831 0.93
832 0.9
833 0.83
834 0.75
835 0.65
836 0.54
837 0.43
838 0.33
839 0.25
840 0.16
841 0.12
842 0.09
843 0.1
844 0.11
845 0.12
846 0.14
847 0.18
848 0.2
849 0.23
850 0.25
851 0.25
852 0.28
853 0.3
854 0.28
855 0.23
856 0.24
857 0.22
858 0.19
859 0.2
860 0.17
861 0.14
862 0.17
863 0.18
864 0.17
865 0.19
866 0.21
867 0.21
868 0.25
869 0.26
870 0.22
871 0.23
872 0.21
873 0.18
874 0.16
875 0.14
876 0.09
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.17
885 0.18
886 0.24
887 0.28
888 0.31
889 0.35
890 0.37
891 0.37
892 0.38
893 0.4
894 0.36
895 0.3
896 0.29
897 0.24
898 0.23
899 0.24
900 0.2
901 0.19
902 0.23
903 0.26
904 0.3
905 0.31
906 0.35
907 0.43
908 0.51