Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GYP2

Protein Details
Accession U5GYP2    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-149AGLIPDPYLKKKKKKRRNPDPNVGFEASHydrophilic
220-243ERPVLRSKRMRIDPRKWGRRRVVFBasic
666-700HQELRDKLRGHARKRHREAVKKQSKSGKKGARTILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-139KKKKKKRRN
205-240PKARQARESRIKAALERPVLRSKRMRIDPRKWGRRR
672-697KLRGHARKRHREAVKKQSKSGKKGAR
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_mito 10, nucl 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MTTSTYKGKNKIPPSTEFIMTRLHISGLAPSVQAKDIVDRFATFGQVEGGVEGVDGLKVDANGDRKGYAFVNLHTTTHQLNKCISLLSGSLWKGHKLRIAPAKADYTKRLESERAIAADVAAGLIPDPYLKKKKKKRRNPDPNVGFEASHFELVSPENIDQHRGWTLDTTIPSAPIALFPLIVRPSHPIFPPAKPAPTSWTRETPKARQARESRIKAALERPVLRSKRMRIDPRKWGRRRVVFDRDQEEGQGFGVGVGTEIMRGYWECEEMEGSGMGEEVAWVYKAPDGTVRRREVISLGAARFGERTDRFTALLEGLNRPEGGAKIEAVHEEDKEVQEDDDSNAEPNDEDNLAGSPERPTKRLKSLSPPPYVPVAPRSLLYNEEDAFALLSTTREEAELKEARRMEKEAQLKVLMRLVEVEAEMDREDEDREKAEVQGTEGRKLPKVEGFANDDDDNDWGEVLRLRGGAKTSSDEGEDSSDDDTSDDEDEDESSDEEEEDAAVPPVASSSTKSAVEETSTVKRGMLKNMFKPKAGEASFSMLDGLDLELEELERTPSPPPQSHFNAGPSMSSASHQHRNTFVAPPTLGRSSRAWVGTAPTTPFFSFPSRAFEVRGTGEINEEEVKKMGMTMEKAEELKRESERNLAEGVNKFWAYESPEEFEKLHQELRDKLRGHARKRHREAVKKQSKSGKKGARTIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.62
4 0.54
5 0.46
6 0.42
7 0.37
8 0.34
9 0.28
10 0.23
11 0.19
12 0.18
13 0.2
14 0.17
15 0.17
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.15
22 0.2
23 0.21
24 0.23
25 0.23
26 0.21
27 0.23
28 0.23
29 0.24
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.04
42 0.04
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.11
48 0.15
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.21
54 0.2
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.28
59 0.28
60 0.29
61 0.27
62 0.29
63 0.26
64 0.32
65 0.33
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.31
70 0.29
71 0.26
72 0.19
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.18
77 0.22
78 0.23
79 0.28
80 0.28
81 0.31
82 0.33
83 0.3
84 0.38
85 0.42
86 0.46
87 0.44
88 0.46
89 0.51
90 0.51
91 0.53
92 0.49
93 0.46
94 0.45
95 0.45
96 0.45
97 0.39
98 0.37
99 0.37
100 0.37
101 0.31
102 0.28
103 0.25
104 0.21
105 0.19
106 0.16
107 0.11
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.07
115 0.15
116 0.25
117 0.34
118 0.45
119 0.56
120 0.68
121 0.77
122 0.86
123 0.91
124 0.92
125 0.95
126 0.95
127 0.96
128 0.93
129 0.88
130 0.83
131 0.73
132 0.62
133 0.5
134 0.46
135 0.35
136 0.28
137 0.21
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.12
143 0.11
144 0.14
145 0.15
146 0.18
147 0.17
148 0.19
149 0.2
150 0.19
151 0.19
152 0.16
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.1
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.28
178 0.36
179 0.35
180 0.36
181 0.34
182 0.34
183 0.35
184 0.38
185 0.42
186 0.38
187 0.44
188 0.44
189 0.5
190 0.56
191 0.56
192 0.58
193 0.6
194 0.58
195 0.58
196 0.61
197 0.64
198 0.68
199 0.66
200 0.61
201 0.58
202 0.57
203 0.5
204 0.49
205 0.44
206 0.4
207 0.37
208 0.37
209 0.42
210 0.42
211 0.45
212 0.46
213 0.46
214 0.49
215 0.56
216 0.62
217 0.63
218 0.7
219 0.76
220 0.8
221 0.85
222 0.81
223 0.81
224 0.8
225 0.79
226 0.79
227 0.77
228 0.75
229 0.71
230 0.73
231 0.67
232 0.6
233 0.51
234 0.44
235 0.35
236 0.25
237 0.18
238 0.12
239 0.08
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.12
275 0.16
276 0.23
277 0.3
278 0.32
279 0.33
280 0.33
281 0.33
282 0.28
283 0.26
284 0.22
285 0.19
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.13
292 0.15
293 0.12
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.2
300 0.15
301 0.17
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.13
345 0.15
346 0.16
347 0.2
348 0.24
349 0.32
350 0.38
351 0.38
352 0.41
353 0.5
354 0.57
355 0.57
356 0.53
357 0.47
358 0.44
359 0.41
360 0.33
361 0.26
362 0.2
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.13
386 0.17
387 0.17
388 0.21
389 0.23
390 0.24
391 0.26
392 0.28
393 0.25
394 0.28
395 0.33
396 0.3
397 0.3
398 0.31
399 0.3
400 0.28
401 0.28
402 0.2
403 0.14
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.2
426 0.2
427 0.21
428 0.24
429 0.25
430 0.25
431 0.26
432 0.26
433 0.22
434 0.24
435 0.24
436 0.24
437 0.27
438 0.26
439 0.28
440 0.26
441 0.23
442 0.2
443 0.18
444 0.16
445 0.1
446 0.09
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.13
466 0.11
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.1
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.16
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.18
506 0.2
507 0.22
508 0.22
509 0.21
510 0.26
511 0.27
512 0.34
513 0.39
514 0.41
515 0.48
516 0.58
517 0.6
518 0.55
519 0.55
520 0.49
521 0.49
522 0.43
523 0.36
524 0.28
525 0.31
526 0.3
527 0.27
528 0.25
529 0.15
530 0.14
531 0.12
532 0.1
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.1
544 0.15
545 0.2
546 0.25
547 0.27
548 0.33
549 0.39
550 0.43
551 0.44
552 0.42
553 0.4
554 0.36
555 0.33
556 0.28
557 0.24
558 0.19
559 0.18
560 0.2
561 0.23
562 0.31
563 0.32
564 0.34
565 0.34
566 0.38
567 0.39
568 0.4
569 0.36
570 0.32
571 0.31
572 0.3
573 0.32
574 0.33
575 0.31
576 0.28
577 0.27
578 0.26
579 0.31
580 0.3
581 0.26
582 0.22
583 0.26
584 0.26
585 0.27
586 0.27
587 0.23
588 0.25
589 0.24
590 0.24
591 0.23
592 0.24
593 0.25
594 0.24
595 0.29
596 0.31
597 0.31
598 0.33
599 0.31
600 0.31
601 0.29
602 0.3
603 0.24
604 0.2
605 0.21
606 0.19
607 0.2
608 0.19
609 0.18
610 0.17
611 0.16
612 0.16
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.15
617 0.17
618 0.19
619 0.22
620 0.25
621 0.26
622 0.28
623 0.29
624 0.27
625 0.31
626 0.32
627 0.32
628 0.31
629 0.37
630 0.38
631 0.36
632 0.35
633 0.31
634 0.33
635 0.31
636 0.32
637 0.3
638 0.28
639 0.26
640 0.24
641 0.26
642 0.25
643 0.27
644 0.28
645 0.26
646 0.28
647 0.3
648 0.3
649 0.3
650 0.3
651 0.28
652 0.29
653 0.29
654 0.31
655 0.37
656 0.45
657 0.51
658 0.47
659 0.5
660 0.56
661 0.62
662 0.67
663 0.69
664 0.72
665 0.75
666 0.82
667 0.86
668 0.85
669 0.87
670 0.89
671 0.9
672 0.9
673 0.85
674 0.84
675 0.85
676 0.84
677 0.81
678 0.82
679 0.8
680 0.78