Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HBW1

Protein Details
Accession U5HBW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-186TEYSKDKYMKRKEAKYLRVFHydrophilic
437-459PEANSHKVKVGKKRKVENGDGDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-470VKVGKKRKVENGDGDGERKGEGLKKGK
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 12.5, nucl 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDTVIASPPRDPPSTSISILEATASTSTSAPRHASNDDAPAPVLPRHVIREGDNVLLRLPSTVVKTVKVTPSGTISLGKYGSFKASHLVGLPYGPTYEILDDGSLKIVPPQVVAEIEETEANNQEITATGAQSLTYDDINAFRSEGLSGRQIIEKQIQQHANFDKKTEYSKDKYMKRKEAKYLRVFTPIEPTVHNICEYNFEKQSAKIRELRPDTLSNMMNMANVRPGARLLVVEDVHGMVVSACVERMGGQGRLIIINDFDSPPDIHITESFNFPPSALEPIGSLHWGMTEPSWVPADLPLEISQAVLEKTKNSRDIAKIKRRKAAFELMENTRKDFFAGGFDGVILATPYEPLGVLDRLLPYIAGSAPIVIYSPHQATLSEAYQSLRTSPHFLSPTLSEPWLRKYQVLPGRCHPEMNGLGHGGFLLTTTRVFDNPEANSHKVKVGKKRKVENGDGDGERKGEGLKKGKLEGDGKGDGEEAAADPPLEGMGEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.34
4 0.3
5 0.29
6 0.27
7 0.24
8 0.16
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.13
15 0.13
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.25
20 0.26
21 0.3
22 0.3
23 0.36
24 0.35
25 0.33
26 0.31
27 0.28
28 0.28
29 0.24
30 0.23
31 0.18
32 0.19
33 0.22
34 0.26
35 0.27
36 0.27
37 0.34
38 0.34
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.26
44 0.23
45 0.16
46 0.15
47 0.13
48 0.14
49 0.2
50 0.21
51 0.22
52 0.26
53 0.31
54 0.34
55 0.35
56 0.33
57 0.29
58 0.32
59 0.32
60 0.3
61 0.28
62 0.24
63 0.23
64 0.23
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.15
139 0.18
140 0.21
141 0.22
142 0.23
143 0.3
144 0.33
145 0.32
146 0.37
147 0.41
148 0.44
149 0.41
150 0.39
151 0.34
152 0.31
153 0.35
154 0.35
155 0.35
156 0.32
157 0.41
158 0.48
159 0.54
160 0.62
161 0.67
162 0.71
163 0.73
164 0.76
165 0.78
166 0.79
167 0.8
168 0.79
169 0.76
170 0.67
171 0.66
172 0.6
173 0.5
174 0.48
175 0.4
176 0.32
177 0.27
178 0.28
179 0.23
180 0.23
181 0.23
182 0.16
183 0.14
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.24
191 0.33
192 0.29
193 0.31
194 0.34
195 0.36
196 0.42
197 0.45
198 0.46
199 0.41
200 0.39
201 0.37
202 0.34
203 0.32
204 0.23
205 0.21
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.12
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.14
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.26
303 0.32
304 0.41
305 0.49
306 0.56
307 0.61
308 0.63
309 0.69
310 0.66
311 0.63
312 0.59
313 0.58
314 0.5
315 0.48
316 0.48
317 0.47
318 0.52
319 0.48
320 0.45
321 0.36
322 0.32
323 0.26
324 0.22
325 0.16
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.05
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.07
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.07
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.18
368 0.17
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.19
378 0.2
379 0.26
380 0.26
381 0.26
382 0.28
383 0.27
384 0.3
385 0.28
386 0.28
387 0.23
388 0.23
389 0.29
390 0.33
391 0.32
392 0.3
393 0.29
394 0.38
395 0.43
396 0.47
397 0.46
398 0.47
399 0.54
400 0.52
401 0.51
402 0.42
403 0.43
404 0.41
405 0.39
406 0.33
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.23
411 0.15
412 0.1
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.14
421 0.17
422 0.21
423 0.22
424 0.29
425 0.33
426 0.35
427 0.38
428 0.37
429 0.39
430 0.41
431 0.46
432 0.5
433 0.55
434 0.62
435 0.68
436 0.76
437 0.81
438 0.83
439 0.84
440 0.82
441 0.77
442 0.75
443 0.68
444 0.6
445 0.51
446 0.43
447 0.35
448 0.26
449 0.22
450 0.2
451 0.26
452 0.32
453 0.37
454 0.41
455 0.45
456 0.47
457 0.52
458 0.49
459 0.46
460 0.45
461 0.42
462 0.38
463 0.35
464 0.32
465 0.25
466 0.22
467 0.17
468 0.11
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.07