Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H504

Protein Details
Accession U5H504    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-259ANYLDNLHQRKKKKRTRRPPVPNPFRDAPHydrophilic
362-390MREEMAGKKKRKKERERRKSEEGKRERAQBasic
486-514DGGEGGKKKKKAKKGKKSKQPQWMNITKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-112GKGKGKGKG
240-252RKKKKRTRRPPVP
367-409AGKKKRKKERERRKSEEGKRERAQAKEREKAVAVAVAGNAKRK
422-443KANKAAEKERKAVEKARLAKEK
490-504GGKKKKKAKKGKKSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
Amino Acid Sequences MNDSYTYSSDVEVHVIPQPSKPATWHRNVDIEDNDDDDDDDDDDDDDDASPRVPLATIDHDSTPRHQPRTTSGIGMGTPLFLLSSPAASPVQFGTWEGVGMDRGKGKGKGKGKEVVQIDLLDESSDEDQGITQGAMKVLSSESSSDDGVAIVVQGSSRRPLQRTAPLPVRPPTSDEDGELPDPATLGFAPSRSTYLGPTVGPSRAGPAASPSSVSPGFILRSRLGMHPTDANYLDNLHQRKKKKRTRRPPVPNPFRDAPPLPPALAARRSGSGSAILSMLDHLPIYHKAKSSTTTKRKGKRVGIYDDDDDEDGSATTTDSSEIDETCASFRGPPRQFIMNSEGGPVVELDWREETRVWEKEMREEMAGKKKRKKERERRKSEEGKRERAQAKEREKAVAVAVAGNAKRKASTLSLDERETIKANKAAEKERKAVEKARLAKEKAVLVKANNLRAGDKATTVMELTIHLSGTDFDQFSDTEDEEEEDGGEGGKKKKKAKKGKKSKQPQWMNITKLLQTRMNPQGCVVEAPETPRRDIGCEGTIRWTRWCDRRWNMEKNIFEPLGEGNELVVEEDSRLIYISALQLSIQIADKTLLRNLQKIQERIGAHSQIILMHYGLNSLYREMENAKQAAYREDTRLRLDNVPLAGPSAPRSVGIGEKQPEKEVIQMELLRVQSQSRCFMIAVNSVEEAVDWIEQLTYDISQKPYQRQKNMHIAALGTGEEKFASGSNLEDTYVKMLATLKSVTEPVAKAIVGHYPTIKELYDGWAKLPSGERKNMLVGIGRGSNVTGVATNRTIGAKLSETIYKIFSSEDPGMFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.22
4 0.23
5 0.28
6 0.28
7 0.29
8 0.32
9 0.38
10 0.42
11 0.51
12 0.55
13 0.54
14 0.59
15 0.6
16 0.61
17 0.54
18 0.49
19 0.41
20 0.36
21 0.32
22 0.25
23 0.23
24 0.18
25 0.15
26 0.12
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.12
43 0.18
44 0.21
45 0.24
46 0.26
47 0.28
48 0.31
49 0.34
50 0.4
51 0.41
52 0.43
53 0.43
54 0.44
55 0.48
56 0.53
57 0.51
58 0.43
59 0.38
60 0.35
61 0.33
62 0.31
63 0.24
64 0.17
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.06
69 0.09
70 0.07
71 0.09
72 0.08
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.2
92 0.26
93 0.29
94 0.36
95 0.43
96 0.48
97 0.51
98 0.57
99 0.54
100 0.56
101 0.54
102 0.48
103 0.42
104 0.36
105 0.31
106 0.24
107 0.22
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.06
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.1
144 0.15
145 0.2
146 0.22
147 0.27
148 0.33
149 0.42
150 0.45
151 0.51
152 0.54
153 0.53
154 0.57
155 0.57
156 0.55
157 0.46
158 0.45
159 0.41
160 0.39
161 0.35
162 0.32
163 0.3
164 0.28
165 0.27
166 0.24
167 0.21
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.09
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.15
183 0.17
184 0.15
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.14
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.16
206 0.19
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.22
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.22
223 0.24
224 0.29
225 0.35
226 0.43
227 0.53
228 0.63
229 0.7
230 0.75
231 0.83
232 0.87
233 0.92
234 0.94
235 0.95
236 0.95
237 0.96
238 0.96
239 0.89
240 0.85
241 0.77
242 0.68
243 0.62
244 0.53
245 0.45
246 0.39
247 0.36
248 0.28
249 0.26
250 0.25
251 0.25
252 0.26
253 0.23
254 0.2
255 0.2
256 0.21
257 0.2
258 0.19
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.07
271 0.11
272 0.15
273 0.17
274 0.19
275 0.2
276 0.22
277 0.27
278 0.33
279 0.39
280 0.45
281 0.53
282 0.6
283 0.66
284 0.73
285 0.78
286 0.78
287 0.76
288 0.74
289 0.71
290 0.67
291 0.62
292 0.55
293 0.48
294 0.4
295 0.32
296 0.24
297 0.17
298 0.11
299 0.08
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.09
317 0.12
318 0.21
319 0.22
320 0.25
321 0.28
322 0.31
323 0.32
324 0.33
325 0.36
326 0.29
327 0.27
328 0.25
329 0.22
330 0.17
331 0.17
332 0.14
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.13
342 0.17
343 0.19
344 0.21
345 0.23
346 0.24
347 0.28
348 0.3
349 0.29
350 0.24
351 0.25
352 0.27
353 0.32
354 0.4
355 0.41
356 0.46
357 0.53
358 0.62
359 0.7
360 0.77
361 0.78
362 0.82
363 0.87
364 0.9
365 0.89
366 0.9
367 0.9
368 0.88
369 0.87
370 0.83
371 0.8
372 0.72
373 0.72
374 0.66
375 0.61
376 0.59
377 0.57
378 0.57
379 0.55
380 0.53
381 0.46
382 0.43
383 0.38
384 0.31
385 0.23
386 0.16
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.12
397 0.11
398 0.13
399 0.15
400 0.2
401 0.23
402 0.23
403 0.24
404 0.23
405 0.23
406 0.22
407 0.19
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.19
412 0.21
413 0.27
414 0.33
415 0.36
416 0.38
417 0.38
418 0.41
419 0.39
420 0.42
421 0.4
422 0.4
423 0.44
424 0.47
425 0.5
426 0.48
427 0.47
428 0.44
429 0.42
430 0.37
431 0.32
432 0.27
433 0.21
434 0.28
435 0.29
436 0.29
437 0.27
438 0.25
439 0.23
440 0.22
441 0.24
442 0.17
443 0.14
444 0.12
445 0.11
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.07
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.08
477 0.14
478 0.18
479 0.23
480 0.32
481 0.39
482 0.5
483 0.6
484 0.68
485 0.74
486 0.82
487 0.87
488 0.89
489 0.94
490 0.92
491 0.91
492 0.9
493 0.86
494 0.84
495 0.8
496 0.73
497 0.66
498 0.59
499 0.52
500 0.45
501 0.4
502 0.34
503 0.28
504 0.32
505 0.36
506 0.36
507 0.32
508 0.3
509 0.29
510 0.26
511 0.25
512 0.19
513 0.13
514 0.12
515 0.16
516 0.22
517 0.21
518 0.21
519 0.23
520 0.23
521 0.23
522 0.24
523 0.23
524 0.21
525 0.21
526 0.21
527 0.26
528 0.29
529 0.28
530 0.29
531 0.29
532 0.31
533 0.37
534 0.41
535 0.44
536 0.48
537 0.57
538 0.63
539 0.68
540 0.7
541 0.7
542 0.67
543 0.59
544 0.58
545 0.47
546 0.39
547 0.31
548 0.24
549 0.18
550 0.16
551 0.14
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.04
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.1
578 0.11
579 0.13
580 0.17
581 0.17
582 0.21
583 0.23
584 0.3
585 0.36
586 0.36
587 0.37
588 0.38
589 0.38
590 0.39
591 0.42
592 0.35
593 0.29
594 0.28
595 0.25
596 0.2
597 0.19
598 0.15
599 0.1
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.11
610 0.13
611 0.17
612 0.19
613 0.19
614 0.19
615 0.2
616 0.21
617 0.23
618 0.25
619 0.25
620 0.26
621 0.31
622 0.33
623 0.35
624 0.39
625 0.39
626 0.37
627 0.36
628 0.34
629 0.3
630 0.28
631 0.23
632 0.2
633 0.18
634 0.15
635 0.16
636 0.14
637 0.13
638 0.12
639 0.13
640 0.13
641 0.17
642 0.18
643 0.23
644 0.25
645 0.3
646 0.32
647 0.32
648 0.33
649 0.3
650 0.32
651 0.26
652 0.24
653 0.23
654 0.23
655 0.22
656 0.24
657 0.24
658 0.2
659 0.19
660 0.19
661 0.19
662 0.21
663 0.24
664 0.21
665 0.22
666 0.21
667 0.23
668 0.24
669 0.26
670 0.24
671 0.22
672 0.21
673 0.2
674 0.19
675 0.17
676 0.14
677 0.09
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.1
687 0.13
688 0.16
689 0.22
690 0.27
691 0.35
692 0.45
693 0.53
694 0.6
695 0.65
696 0.69
697 0.76
698 0.74
699 0.68
700 0.58
701 0.5
702 0.42
703 0.35
704 0.27
705 0.17
706 0.13
707 0.1
708 0.09
709 0.08
710 0.08
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.09
715 0.11
716 0.12
717 0.13
718 0.13
719 0.13
720 0.15
721 0.15
722 0.13
723 0.12
724 0.14
725 0.14
726 0.17
727 0.17
728 0.15
729 0.17
730 0.18
731 0.18
732 0.2
733 0.19
734 0.18
735 0.2
736 0.19
737 0.17
738 0.17
739 0.22
740 0.19
741 0.2
742 0.2
743 0.19
744 0.21
745 0.23
746 0.22
747 0.17
748 0.16
749 0.21
750 0.26
751 0.25
752 0.24
753 0.27
754 0.27
755 0.29
756 0.35
757 0.38
758 0.39
759 0.45
760 0.46
761 0.44
762 0.47
763 0.46
764 0.4
765 0.35
766 0.29
767 0.27
768 0.26
769 0.24
770 0.21
771 0.2
772 0.18
773 0.14
774 0.13
775 0.11
776 0.11
777 0.15
778 0.16
779 0.16
780 0.17
781 0.18
782 0.18
783 0.17
784 0.19
785 0.17
786 0.17
787 0.2
788 0.22
789 0.23
790 0.24
791 0.25
792 0.21
793 0.19
794 0.2
795 0.18
796 0.22
797 0.25