Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U5HA79

Protein Details
Accession U5HA79    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-124AIAAGTAKKGKNKKKKKKSKLSAAAAPSTHydrophilic
141-163VSVSTPKKASTKKKNGAKPAAGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-115AKKGKNKKKKKKSK
147-159KKASTKKKNGAKP
Subcellular Location(s) mito 7, cyto 6.5, extr 6, cyto_nucl 6, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MPPRLSKRQQREQAELDDLAASAVANTDLGDDGERASSSEKDEVGQEKHDDDTGAAAIANSGALGRTTAGFAALDLGDGDDDPDDDDDANDEPFTAIAAGTAKKGKNKKKKKKSKLSAAAAPSTTGMNDTDDSTAPVTPTVSVSTPKKASTKKKNGAKPAAGTPKSNPDDLDEIDRALAELASKGGPSLAAIQAQQQNSQLDKRFETIKGVFSFDTKLLDGDAELRKFFGSKIIQHTAPAPRSQHHARFANNPHHSTSIKRTASYLANPEPGWLPAAGVLKLETYVGSEAKNDRSGDWWTYVHTPEYKIAQMGFLEVLQQADGNRLYSILQSQPYHIDTHLQLAEMLNQQGDLTGSSQHLARALYAMSAPLPPSFTSGSFRLSYNRIENRAFFIALARNVAIQTKRGTWRTATEWAKIALGCSGGMDPMGMLCFLDFLAPKSGQNEWLLSLLEELPKVYPNQPECQVDLYPGLAYAKALCLRQLHPKETSSDSVATKALASAILRFPAVVPLLLSTLGGNVPPALISHPRAQISGSYTTDPSYLTSLLASLYAHRSSPLWKDPSLLSWLTSTASSIVSSLNDLSNPNVVFSEKAWSAQHAWKTNQAPEGIIRALYLADVPSLRPYLPPSVTSNGEAMYSYDPLPPKGPNVTYYSDDYFQVLHSTSVGKRIRQQNATRTQAQRGGAAARGFAAQLAALLGIGQAGGAIDINDELRRELMDELAMLQGGGEVGQGGLPGGFPGIGEDTDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.59
3 0.49
4 0.4
5 0.32
6 0.24
7 0.17
8 0.11
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.23
30 0.28
31 0.28
32 0.3
33 0.29
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.24
38 0.19
39 0.18
40 0.14
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.17
89 0.2
90 0.27
91 0.37
92 0.47
93 0.56
94 0.67
95 0.76
96 0.81
97 0.9
98 0.94
99 0.96
100 0.96
101 0.96
102 0.96
103 0.93
104 0.9
105 0.83
106 0.77
107 0.66
108 0.55
109 0.44
110 0.34
111 0.25
112 0.18
113 0.13
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.16
130 0.19
131 0.25
132 0.27
133 0.3
134 0.36
135 0.43
136 0.53
137 0.58
138 0.67
139 0.7
140 0.77
141 0.82
142 0.85
143 0.86
144 0.81
145 0.73
146 0.72
147 0.72
148 0.65
149 0.59
150 0.52
151 0.53
152 0.49
153 0.46
154 0.36
155 0.3
156 0.31
157 0.3
158 0.33
159 0.23
160 0.21
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.12
165 0.11
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.16
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.29
187 0.29
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.32
194 0.29
195 0.3
196 0.28
197 0.29
198 0.27
199 0.25
200 0.26
201 0.2
202 0.2
203 0.14
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.13
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.17
218 0.2
219 0.28
220 0.32
221 0.32
222 0.32
223 0.37
224 0.37
225 0.35
226 0.34
227 0.29
228 0.26
229 0.33
230 0.39
231 0.4
232 0.41
233 0.43
234 0.42
235 0.49
236 0.54
237 0.58
238 0.56
239 0.52
240 0.46
241 0.45
242 0.43
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.35
247 0.34
248 0.33
249 0.33
250 0.36
251 0.35
252 0.33
253 0.26
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.11
277 0.13
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.19
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.19
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.12
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.19
371 0.23
372 0.26
373 0.26
374 0.26
375 0.27
376 0.28
377 0.27
378 0.24
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.15
392 0.2
393 0.21
394 0.22
395 0.21
396 0.25
397 0.27
398 0.34
399 0.32
400 0.29
401 0.29
402 0.28
403 0.28
404 0.24
405 0.2
406 0.12
407 0.1
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.06
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.1
445 0.12
446 0.16
447 0.18
448 0.22
449 0.26
450 0.27
451 0.28
452 0.29
453 0.26
454 0.22
455 0.19
456 0.16
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.14
468 0.16
469 0.26
470 0.31
471 0.32
472 0.33
473 0.34
474 0.35
475 0.36
476 0.36
477 0.29
478 0.27
479 0.24
480 0.23
481 0.22
482 0.18
483 0.15
484 0.13
485 0.1
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.07
512 0.09
513 0.12
514 0.17
515 0.21
516 0.22
517 0.22
518 0.22
519 0.22
520 0.24
521 0.26
522 0.23
523 0.2
524 0.2
525 0.21
526 0.21
527 0.18
528 0.15
529 0.12
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.15
544 0.21
545 0.27
546 0.27
547 0.27
548 0.29
549 0.29
550 0.31
551 0.32
552 0.27
553 0.2
554 0.17
555 0.17
556 0.16
557 0.15
558 0.13
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.11
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.18
579 0.14
580 0.16
581 0.16
582 0.18
583 0.22
584 0.27
585 0.33
586 0.34
587 0.36
588 0.41
589 0.44
590 0.46
591 0.45
592 0.4
593 0.34
594 0.3
595 0.32
596 0.25
597 0.21
598 0.16
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.15
612 0.21
613 0.22
614 0.25
615 0.27
616 0.3
617 0.32
618 0.32
619 0.3
620 0.23
621 0.22
622 0.19
623 0.16
624 0.14
625 0.13
626 0.13
627 0.16
628 0.17
629 0.18
630 0.21
631 0.2
632 0.22
633 0.27
634 0.27
635 0.27
636 0.31
637 0.33
638 0.34
639 0.37
640 0.37
641 0.32
642 0.31
643 0.28
644 0.24
645 0.2
646 0.19
647 0.15
648 0.12
649 0.11
650 0.14
651 0.14
652 0.23
653 0.26
654 0.27
655 0.35
656 0.44
657 0.52
658 0.58
659 0.65
660 0.66
661 0.72
662 0.76
663 0.76
664 0.71
665 0.68
666 0.64
667 0.57
668 0.49
669 0.41
670 0.37
671 0.33
672 0.3
673 0.24
674 0.19
675 0.18
676 0.16
677 0.13
678 0.11
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.04
695 0.05
696 0.06
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.12
704 0.12
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.09
711 0.08
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.07
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.11