Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HA79

Protein Details
Accession U5HA79    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-124AIAAGTAKKGKNKKKKKKSKLSAAAAPSTHydrophilic
141-163VSVSTPKKASTKKKNGAKPAAGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-115AKKGKNKKKKKKSK
147-159KKASTKKKNGAKP
Subcellular Location(s) mito 7, cyto 6.5, extr 6, cyto_nucl 6, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MPPRLSKRQQREQAELDDLAASAVANTDLGDDGERASSSEKDEVGQEKHDDDTGAAAIANSGALGRTTAGFAALDLGDGDDDPDDDDDANDEPFTAIAAGTAKKGKNKKKKKKSKLSAAAAPSTTGMNDTDDSTAPVTPTVSVSTPKKASTKKKNGAKPAAGTPKSNPDDLDEIDRALAELASKGGPSLAAIQAQQQNSQLDKRFETIKGVFSFDTKLLDGDAELRKFFGSKIIQHTAPAPRSQHHARFANNPHHSTSIKRTASYLANPEPGWLPAAGVLKLETYVGSEAKNDRSGDWWTYVHTPEYKIAQMGFLEVLQQADGNRLYSILQSQPYHIDTHLQLAEMLNQQGDLTGSSQHLARALYAMSAPLPPSFTSGSFRLSYNRIENRAFFIALARNVAIQTKRGTWRTATEWAKIALGCSGGMDPMGMLCFLDFLAPKSGQNEWLLSLLEELPKVYPNQPECQVDLYPGLAYAKALCLRQLHPKETSSDSVATKALASAILRFPAVVPLLLSTLGGNVPPALISHPRAQISGSYTTDPSYLTSLLASLYAHRSSPLWKDPSLLSWLTSTASSIVSSLNDLSNPNVVFSEKAWSAQHAWKTNQAPEGIIRALYLADVPSLRPYLPPSVTSNGEAMYSYDPLPPKGPNVTYYSDDYFQVLHSTSVGKRIRQQNATRTQAQRGGAAARGFAAQLAALLGIGQAGGAIDINDELRRELMDELAMLQGGGEVGQGGLPGGFPGIGEDTDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.59
3 0.49
4 0.4
5 0.32
6 0.24
7 0.17
8 0.11
9 0.06
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.23
30 0.28
31 0.28
32 0.3
33 0.29
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.24
38 0.19
39 0.18
40 0.14
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.17
89 0.2
90 0.27
91 0.37
92 0.47
93 0.56
94 0.67
95 0.76
96 0.81
97 0.9
98 0.94
99 0.96
100 0.96
101 0.96
102 0.96
103 0.93
104 0.9
105 0.83
106 0.77
107 0.66
108 0.55
109 0.44
110 0.34
111 0.25
112 0.18
113 0.13
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.16
130 0.19
131 0.25
132 0.27
133 0.3
134 0.36
135 0.43
136 0.53
137 0.58
138 0.67
139 0.7
140 0.77
141 0.82
142 0.85
143 0.86
144 0.81
145 0.73
146 0.72
147 0.72
148 0.65
149 0.59
150 0.52
151 0.53
152 0.49
153 0.46
154 0.36
155 0.3
156 0.31
157 0.3
158 0.33
159 0.23
160 0.21
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.12
165 0.11
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.16
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.29
187 0.29
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.32
194 0.29
195 0.3
196 0.28
197 0.29
198 0.27
199 0.25
200 0.26
201 0.2
202 0.2
203 0.14
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.13
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.17
218 0.2
219 0.28
220 0.32
221 0.32
222 0.32
223 0.37
224 0.37
225 0.35
226 0.34
227 0.29
228 0.26
229 0.33
230 0.39
231 0.4
232 0.41
233 0.43
234 0.42
235 0.49
236 0.54
237 0.58
238 0.56
239 0.52
240 0.46
241 0.45
242 0.43
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.35
247 0.34
248 0.33
249 0.33
250 0.36
251 0.35
252 0.33
253 0.26
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.11
277 0.13
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.19
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.19
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.12
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.19
371 0.23
372 0.26
373 0.26
374 0.26
375 0.27
376 0.28
377 0.27
378 0.24
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.15
392 0.2
393 0.21
394 0.22
395 0.21
396 0.25
397 0.27
398 0.34
399 0.32
400 0.29
401 0.29
402 0.28
403 0.28
404 0.24
405 0.2
406 0.12
407 0.1
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.06
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.1
445 0.12
446 0.16
447 0.18
448 0.22
449 0.26
450 0.27
451 0.28
452 0.29
453 0.26
454 0.22
455 0.19
456 0.16
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.14
468 0.16
469 0.26
470 0.31
471 0.32
472 0.33
473 0.34
474 0.35
475 0.36
476 0.36
477 0.29
478 0.27
479 0.24
480 0.23
481 0.22
482 0.18
483 0.15
484 0.13
485 0.1
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.07
512 0.09
513 0.12
514 0.17
515 0.21
516 0.22
517 0.22
518 0.22
519 0.22
520 0.24
521 0.26
522 0.23
523 0.2
524 0.2
525 0.21
526 0.21
527 0.18
528 0.15
529 0.12
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.15
544 0.21
545 0.27
546 0.27
547 0.27
548 0.29
549 0.29
550 0.31
551 0.32
552 0.27
553 0.2
554 0.17
555 0.17
556 0.16
557 0.15
558 0.13
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.11
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.18
579 0.14
580 0.16
581 0.16
582 0.18
583 0.22
584 0.27
585 0.33
586 0.34
587 0.36
588 0.41
589 0.44
590 0.46
591 0.45
592 0.4
593 0.34
594 0.3
595 0.32
596 0.25
597 0.21
598 0.16
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.15
612 0.21
613 0.22
614 0.25
615 0.27
616 0.3
617 0.32
618 0.32
619 0.3
620 0.23
621 0.22
622 0.19
623 0.16
624 0.14
625 0.13
626 0.13
627 0.16
628 0.17
629 0.18
630 0.21
631 0.2
632 0.22
633 0.27
634 0.27
635 0.27
636 0.31
637 0.33
638 0.34
639 0.37
640 0.37
641 0.32
642 0.31
643 0.28
644 0.24
645 0.2
646 0.19
647 0.15
648 0.12
649 0.11
650 0.14
651 0.14
652 0.23
653 0.26
654 0.27
655 0.35
656 0.44
657 0.52
658 0.58
659 0.65
660 0.66
661 0.72
662 0.76
663 0.76
664 0.71
665 0.68
666 0.64
667 0.57
668 0.49
669 0.41
670 0.37
671 0.33
672 0.3
673 0.24
674 0.19
675 0.18
676 0.16
677 0.13
678 0.11
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.04
695 0.05
696 0.06
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.12
704 0.12
705 0.11
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.09
711 0.08
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.07
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.11