Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GXY1

Protein Details
Accession U5GXY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-238SDDSEPVKKKKKIVKKGSDGGSTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-169SKAKPKVVATKGRVPAKAKVTASKVGGMKKGKEKER
222-251KKKKKIVKKGSDGGSTKRKGQAKAGMVKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto 9.5, mito_nucl 9.333, cyto_mito 7.833, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029003  CENP-S/Mhf1  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0071821  C:FANCM-MHF complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF15630  CENP-S  
Amino Acid Sequences MPKDTTDDVALSRRSLKAGVWYTVAKLAEEAEMDGIKCAVSEHFVAALTEFVFQKTLSLAKDLERFANHAGRTAIMIDDVKLAVRHNEALYEAICTEALQRGLGLKDLRTIARPVAARGSVTKRTASTKLASTSKAKPKVVATKGRVPAKAKVTASKVGGMKKGKEKERMRDSDDDEGESLGEEDSDDPRLQSRRGSSEEHEDEEEDDDDSLLDSDDSEPVKKKKKIVKKGSDGGSTKRKGQAKAGMVKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.23
4 0.26
5 0.3
6 0.3
7 0.3
8 0.29
9 0.29
10 0.33
11 0.32
12 0.23
13 0.18
14 0.17
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.06
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.08
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.21
52 0.23
53 0.24
54 0.29
55 0.25
56 0.23
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.14
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.16
100 0.16
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.16
106 0.2
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.23
112 0.25
113 0.25
114 0.22
115 0.2
116 0.24
117 0.24
118 0.26
119 0.26
120 0.32
121 0.38
122 0.42
123 0.4
124 0.38
125 0.41
126 0.48
127 0.5
128 0.51
129 0.47
130 0.49
131 0.56
132 0.58
133 0.56
134 0.5
135 0.49
136 0.45
137 0.46
138 0.39
139 0.37
140 0.36
141 0.37
142 0.35
143 0.34
144 0.32
145 0.29
146 0.34
147 0.32
148 0.33
149 0.37
150 0.44
151 0.45
152 0.52
153 0.56
154 0.6
155 0.67
156 0.68
157 0.65
158 0.64
159 0.62
160 0.6
161 0.54
162 0.45
163 0.35
164 0.3
165 0.25
166 0.18
167 0.15
168 0.06
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.13
177 0.16
178 0.17
179 0.2
180 0.23
181 0.27
182 0.31
183 0.35
184 0.34
185 0.41
186 0.43
187 0.42
188 0.39
189 0.33
190 0.31
191 0.29
192 0.26
193 0.16
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.09
204 0.11
205 0.13
206 0.19
207 0.26
208 0.36
209 0.4
210 0.48
211 0.55
212 0.65
213 0.74
214 0.79
215 0.83
216 0.83
217 0.87
218 0.85
219 0.84
220 0.77
221 0.74
222 0.73
223 0.65
224 0.61
225 0.6
226 0.59
227 0.53
228 0.58
229 0.59
230 0.58
231 0.64