Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HGG4

Protein Details
Accession U5HGG4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-258EVVVPKKKKKGPKGPSGPNPLSIKKKKKKPAIGTTNANAHydrophilic
326-351AGEGSGERAKRKRKRKRGSGVVAGVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-250PKKKKKGPKGPSGPNPLSIKKKKKKPA
268-274GKGKKRP
332-343ERAKRKRKRKRG
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRVKSYRKVMQMYQSSFKFREPYQLLVDAEFVNAIVAQKLDLQARLMDVLQGTLKPMITQCCMQVLYDLGPSGQPSVNLAKEFERRKCNHLKARPAEQCLTAMAGKDNPHRYVIATQSLTLRKHLRTVPGLPIVYLNRSVVLLESPSDQTMKKKLAMENAKLHVPSFELATLASQGSIPSTSNSTSLIDSYNSSNLTKASNDASTSTLPEEGVGKMEVVVPKKKKKGPKGPSGPNPLSIKKKKKKPAIGTTNANASDPSSGSGSGKGKKRPRSEDNSDLNQGTQSGFDRKKRRAENEAVVVTSSSRRGAERGVMALSVGTSEAGEGSGERAKRKRKRKRGSGVVAGVGTGAADKVDGGDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.72
3 0.7
4 0.65
5 0.6
6 0.56
7 0.53
8 0.48
9 0.39
10 0.44
11 0.4
12 0.41
13 0.4
14 0.44
15 0.41
16 0.37
17 0.38
18 0.28
19 0.24
20 0.19
21 0.14
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.08
29 0.11
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.14
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.18
51 0.21
52 0.21
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.16
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.28
72 0.35
73 0.39
74 0.45
75 0.45
76 0.52
77 0.61
78 0.66
79 0.69
80 0.71
81 0.75
82 0.72
83 0.79
84 0.78
85 0.73
86 0.65
87 0.56
88 0.48
89 0.38
90 0.34
91 0.24
92 0.18
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.22
97 0.26
98 0.25
99 0.25
100 0.25
101 0.26
102 0.27
103 0.27
104 0.27
105 0.23
106 0.23
107 0.26
108 0.31
109 0.29
110 0.3
111 0.31
112 0.26
113 0.3
114 0.32
115 0.32
116 0.33
117 0.35
118 0.36
119 0.37
120 0.36
121 0.31
122 0.31
123 0.27
124 0.23
125 0.21
126 0.16
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.12
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.23
144 0.25
145 0.33
146 0.39
147 0.41
148 0.43
149 0.42
150 0.4
151 0.36
152 0.34
153 0.25
154 0.2
155 0.15
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.11
208 0.13
209 0.2
210 0.26
211 0.33
212 0.41
213 0.46
214 0.53
215 0.61
216 0.69
217 0.72
218 0.76
219 0.79
220 0.81
221 0.84
222 0.85
223 0.75
224 0.71
225 0.66
226 0.6
227 0.6
228 0.59
229 0.62
230 0.62
231 0.7
232 0.73
233 0.79
234 0.84
235 0.84
236 0.86
237 0.86
238 0.84
239 0.8
240 0.73
241 0.69
242 0.59
243 0.49
244 0.37
245 0.28
246 0.21
247 0.15
248 0.14
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.15
253 0.19
254 0.24
255 0.3
256 0.37
257 0.44
258 0.53
259 0.61
260 0.66
261 0.71
262 0.74
263 0.76
264 0.78
265 0.77
266 0.75
267 0.69
268 0.6
269 0.51
270 0.42
271 0.34
272 0.24
273 0.18
274 0.14
275 0.19
276 0.25
277 0.32
278 0.4
279 0.47
280 0.56
281 0.63
282 0.68
283 0.68
284 0.71
285 0.72
286 0.72
287 0.67
288 0.58
289 0.5
290 0.42
291 0.34
292 0.28
293 0.21
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.18
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.22
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.15
307 0.1
308 0.07
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.12
318 0.14
319 0.21
320 0.28
321 0.39
322 0.48
323 0.59
324 0.68
325 0.75
326 0.85
327 0.89
328 0.93
329 0.94
330 0.94
331 0.93
332 0.87
333 0.8
334 0.68
335 0.57
336 0.45
337 0.34
338 0.24
339 0.14
340 0.08
341 0.04
342 0.04
343 0.04