Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GXV1

Protein Details
Accession U5GXV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-163DQDPTPPHKRGRGRSRANKKKNPSGATTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-158PHKRGRGRSRANKKKNP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MGRLQPPKKPTTSSQRTLSLPSPPPQSKTAISSSLLSPSSRPLSIGPATRIEPTATADETQAATTSPFISFRLPSPKPTSFSTTSTATTQASTSTASPTLSIRSSATATATATATATANLAAETSHSTTTQDQDQDQDPTPPHKRGRGRSRANKKKNPSGATTNRSKEHSPDVEEGEVQGDFDGLFVVDLQPSVVPEELLETPTVSEAHEHKNETAYERRRRQQAEDLEREEQAMRDFAHDVLATDDEHDHDDDHDDEEEESSEQEEEWHDEASLAKAIQGRIVDDSQAKVTGRYYKEADPSKSCVLCGEQGHSSRDCTHSQCFICAQVDADHEARNCPVSLVCSACGSRGHMARDCTAAHPVRGNYGARCTHCSSTLHLPTNCPSLWRIYDTRGAKPTKRKVILACANCGSNKDHFIDECPIPRGHPMKYVDNSAFNREALGDWAIGLPNRVGQRGGPTGSEAAAKRRGQPMAGDKRRTHERFDPADDDDWFASRRTDSGRRNAYHDSRDRNHGRSSLTDRLSYGDDRSSRSDSIDTRPSASSSSSKKHQQSQSGSESTPRGRRGSSQGGGGHIRFKNSTYDRFGGTPISGPESGRKDLRSTYDDDDRLQGGRDSGRDRGRDSGRDSGRDSGRDSGRDSGRDSGRDSGRDNSRRSTPNGNGRSGKRKSDPTGGGGSSGTPSLASRLGGLPTKPRYEGGYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.67
3 0.64
4 0.64
5 0.58
6 0.56
7 0.53
8 0.51
9 0.54
10 0.51
11 0.53
12 0.5
13 0.52
14 0.46
15 0.45
16 0.44
17 0.38
18 0.36
19 0.35
20 0.33
21 0.34
22 0.32
23 0.28
24 0.23
25 0.26
26 0.28
27 0.26
28 0.25
29 0.21
30 0.26
31 0.31
32 0.36
33 0.33
34 0.33
35 0.34
36 0.35
37 0.35
38 0.29
39 0.26
40 0.23
41 0.24
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.15
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.16
58 0.2
59 0.3
60 0.3
61 0.36
62 0.43
63 0.48
64 0.48
65 0.51
66 0.53
67 0.47
68 0.49
69 0.46
70 0.41
71 0.38
72 0.36
73 0.34
74 0.27
75 0.23
76 0.2
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.15
116 0.18
117 0.22
118 0.22
119 0.21
120 0.23
121 0.26
122 0.28
123 0.28
124 0.29
125 0.26
126 0.32
127 0.37
128 0.4
129 0.42
130 0.46
131 0.54
132 0.6
133 0.69
134 0.72
135 0.78
136 0.81
137 0.88
138 0.91
139 0.93
140 0.92
141 0.9
142 0.89
143 0.88
144 0.81
145 0.76
146 0.75
147 0.74
148 0.71
149 0.71
150 0.66
151 0.6
152 0.59
153 0.54
154 0.47
155 0.46
156 0.44
157 0.4
158 0.38
159 0.38
160 0.35
161 0.34
162 0.31
163 0.23
164 0.18
165 0.13
166 0.09
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.07
193 0.09
194 0.12
195 0.18
196 0.21
197 0.23
198 0.23
199 0.26
200 0.27
201 0.28
202 0.34
203 0.37
204 0.44
205 0.5
206 0.56
207 0.6
208 0.63
209 0.64
210 0.64
211 0.65
212 0.65
213 0.64
214 0.62
215 0.56
216 0.52
217 0.48
218 0.39
219 0.29
220 0.2
221 0.15
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.13
276 0.12
277 0.1
278 0.12
279 0.18
280 0.18
281 0.21
282 0.23
283 0.24
284 0.31
285 0.36
286 0.38
287 0.34
288 0.37
289 0.38
290 0.35
291 0.32
292 0.26
293 0.22
294 0.22
295 0.2
296 0.18
297 0.17
298 0.19
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.19
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.24
308 0.24
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.2
313 0.17
314 0.15
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.16
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.21
343 0.2
344 0.18
345 0.2
346 0.18
347 0.16
348 0.18
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.19
353 0.14
354 0.18
355 0.21
356 0.2
357 0.24
358 0.25
359 0.24
360 0.25
361 0.26
362 0.25
363 0.29
364 0.34
365 0.35
366 0.33
367 0.33
368 0.32
369 0.35
370 0.31
371 0.24
372 0.18
373 0.16
374 0.16
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.25
379 0.27
380 0.3
381 0.34
382 0.36
383 0.38
384 0.45
385 0.51
386 0.53
387 0.53
388 0.53
389 0.48
390 0.55
391 0.58
392 0.51
393 0.45
394 0.37
395 0.36
396 0.33
397 0.32
398 0.24
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.16
403 0.15
404 0.18
405 0.21
406 0.2
407 0.21
408 0.21
409 0.2
410 0.19
411 0.24
412 0.24
413 0.21
414 0.26
415 0.27
416 0.31
417 0.33
418 0.37
419 0.33
420 0.37
421 0.37
422 0.35
423 0.32
424 0.25
425 0.24
426 0.2
427 0.18
428 0.13
429 0.13
430 0.08
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.08
436 0.06
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.15
443 0.18
444 0.19
445 0.15
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.19
450 0.15
451 0.16
452 0.23
453 0.23
454 0.26
455 0.31
456 0.31
457 0.28
458 0.32
459 0.38
460 0.42
461 0.49
462 0.51
463 0.48
464 0.53
465 0.63
466 0.6
467 0.56
468 0.52
469 0.53
470 0.52
471 0.56
472 0.54
473 0.46
474 0.47
475 0.41
476 0.35
477 0.26
478 0.22
479 0.18
480 0.15
481 0.13
482 0.11
483 0.12
484 0.16
485 0.25
486 0.29
487 0.38
488 0.46
489 0.47
490 0.52
491 0.58
492 0.57
493 0.57
494 0.58
495 0.57
496 0.52
497 0.6
498 0.6
499 0.56
500 0.54
501 0.49
502 0.45
503 0.42
504 0.46
505 0.45
506 0.42
507 0.39
508 0.36
509 0.34
510 0.35
511 0.3
512 0.25
513 0.22
514 0.22
515 0.24
516 0.28
517 0.29
518 0.27
519 0.27
520 0.29
521 0.27
522 0.31
523 0.35
524 0.32
525 0.32
526 0.32
527 0.31
528 0.28
529 0.28
530 0.29
531 0.27
532 0.32
533 0.35
534 0.43
535 0.47
536 0.55
537 0.59
538 0.62
539 0.64
540 0.65
541 0.66
542 0.61
543 0.56
544 0.51
545 0.48
546 0.45
547 0.44
548 0.4
549 0.35
550 0.33
551 0.38
552 0.42
553 0.47
554 0.43
555 0.42
556 0.4
557 0.42
558 0.44
559 0.39
560 0.39
561 0.31
562 0.32
563 0.27
564 0.27
565 0.32
566 0.34
567 0.39
568 0.38
569 0.39
570 0.39
571 0.39
572 0.39
573 0.32
574 0.28
575 0.24
576 0.19
577 0.21
578 0.2
579 0.19
580 0.25
581 0.28
582 0.31
583 0.31
584 0.31
585 0.3
586 0.33
587 0.38
588 0.35
589 0.35
590 0.37
591 0.42
592 0.42
593 0.41
594 0.39
595 0.35
596 0.32
597 0.28
598 0.24
599 0.18
600 0.2
601 0.22
602 0.23
603 0.29
604 0.35
605 0.36
606 0.37
607 0.43
608 0.46
609 0.48
610 0.5
611 0.52
612 0.51
613 0.52
614 0.53
615 0.52
616 0.51
617 0.48
618 0.45
619 0.44
620 0.43
621 0.42
622 0.42
623 0.42
624 0.42
625 0.42
626 0.42
627 0.42
628 0.42
629 0.42
630 0.42
631 0.42
632 0.42
633 0.43
634 0.43
635 0.43
636 0.49
637 0.54
638 0.55
639 0.52
640 0.56
641 0.58
642 0.6
643 0.61
644 0.59
645 0.63
646 0.65
647 0.67
648 0.66
649 0.68
650 0.73
651 0.7
652 0.69
653 0.66
654 0.68
655 0.67
656 0.69
657 0.66
658 0.61
659 0.62
660 0.54
661 0.48
662 0.39
663 0.34
664 0.25
665 0.21
666 0.16
667 0.1
668 0.1
669 0.11
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.15
674 0.18
675 0.22
676 0.24
677 0.3
678 0.35
679 0.39
680 0.39
681 0.38