Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GXT9

Protein Details
Accession U5GXT9    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-97DGEGKSKKKLKVKKVKDPNAPKRPASBasic
222-244SGSGDKKKTSKSSRKQKDAAPAPHydrophilic
264-292VAPPPKKSPVSKKGKALPEEKPKSKKSKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-94GKSKKKLKVKKVKDPNAPKR
187-192KKRGRK
267-292PPKKSPVSKKGKALPEEKPKSKKSKH
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.166, cyto 12, nucl 11, cyto_mito 7.666, mito_nucl 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MSDKRQALANAYVELASSLTRAANAADSYARELGVAATPAQLEALVANPPNLPFYGAKHGSKAAAGSDDEEDGEGKSKKKLKVKKVKDPNAPKRPASAYIEFQNSVREKFRTAAPEATYQEILRQISGIWQAMPDAEKKHWNDITAEKTLEYEEAKKHYKPVEGAEAVAALPAVITVGKDGKEYTGKKRGRKSNAEKAAEAAHGLVDTNGNIDVATGGILASGSGDKKKTSKSSRKQKDAAPAPSESEESEADSDDSSEEEEEVAPPPKKSPVSKKGKALPEEKPKSKKSKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.09
4 0.07
5 0.07
6 0.06
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.13
14 0.14
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.06
30 0.05
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.12
38 0.11
39 0.13
40 0.12
41 0.15
42 0.24
43 0.28
44 0.29
45 0.3
46 0.31
47 0.29
48 0.28
49 0.25
50 0.17
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.08
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.19
64 0.26
65 0.33
66 0.41
67 0.5
68 0.57
69 0.66
70 0.75
71 0.8
72 0.84
73 0.87
74 0.89
75 0.91
76 0.91
77 0.9
78 0.85
79 0.75
80 0.69
81 0.62
82 0.57
83 0.51
84 0.44
85 0.37
86 0.36
87 0.38
88 0.33
89 0.3
90 0.32
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.25
98 0.23
99 0.24
100 0.27
101 0.26
102 0.31
103 0.3
104 0.31
105 0.28
106 0.23
107 0.22
108 0.2
109 0.18
110 0.12
111 0.11
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.11
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.16
125 0.17
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.26
131 0.29
132 0.25
133 0.24
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.24
146 0.26
147 0.25
148 0.26
149 0.28
150 0.25
151 0.25
152 0.21
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.1
157 0.03
158 0.03
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.03
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.15
170 0.18
171 0.25
172 0.34
173 0.39
174 0.45
175 0.55
176 0.62
177 0.64
178 0.72
179 0.74
180 0.75
181 0.8
182 0.76
183 0.67
184 0.59
185 0.52
186 0.42
187 0.33
188 0.22
189 0.12
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.22
216 0.31
217 0.41
218 0.51
219 0.59
220 0.7
221 0.79
222 0.85
223 0.84
224 0.81
225 0.81
226 0.79
227 0.76
228 0.69
229 0.6
230 0.53
231 0.5
232 0.45
233 0.34
234 0.27
235 0.19
236 0.18
237 0.17
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.11
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.21
255 0.27
256 0.33
257 0.41
258 0.49
259 0.53
260 0.62
261 0.68
262 0.75
263 0.78
264 0.81
265 0.8
266 0.75
267 0.75
268 0.76
269 0.78
270 0.78
271 0.78
272 0.78