Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HDT5

Protein Details
Accession U5HDT5    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-93SSPLPNGKGRPRRRSSTVRASTSHydrophilic
137-164APISNGQMRKDKRRRQSKLRRARASYELHydrophilic
394-421ADDEGPERPRRRRRRHIHHQPRKEVFIPBasic
514-538VDQVAKRKLAKRMKHKESRHALERFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-159RKDKRRRQSKLRRAR
401-415RPRRRRRRHIHHQPR
519-530KRKLAKRMKHKE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004331  SPX_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03105  SPX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51382  SPX  
Amino Acid Sequences MKYGKKYQETLQAPGIPEEWRQQAIEYRQLKKVINRVATELKDLGLTSDVLKDLLSQKSTSPTSTSASTNSSPLPNGKGRPRRRSSTVRASTSGHLSTSPTFAPSEDDKLEAAVRIESVADEEAVTWDSSEDSSHHAPISNGQMRKDKRRRQSKLRRARASYELAGDSSNPEPRIHIVFSSASSASISESSSGESSSSAHVRGQIGRHSSNRFTELHDSSEDDSSPARSADGGDLLPHQHHEHHHHRSKHHPHHVKAPTEGDDESANEEGTTTSSSSAHRAKIRFEGAGPQANALLKKMYGLEESDTEITEPDPEGQGEDEDEDHAKAMQELAEVELDFEPKRRRSDETLRTTVPVDQEHVEAMKKLSIDTEKSARRTSLVEQANERQATDADADDEGPERPRRRRRRHIHHQPRKEVFIPLNKDNEFLGLLAKALASLAALQLAQKQNFTTAVELLAREVSAVSSPNRPKSDLYIWRDIFSLWVEAQIFESARERDRGERSVEAVQEKLSWFVDQVAKRKLAKRMKHKESRHALERFIQLNVELLDMKKFQLANEEAARKILKKHDKRTALTASLGFPKFIAAASSLSASSSPDNPNSRVLTLPGFPSLPPRAPLNLYRHPPPHHSPIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.41
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.28
7 0.25
8 0.24
9 0.25
10 0.31
11 0.35
12 0.42
13 0.45
14 0.46
15 0.5
16 0.54
17 0.56
18 0.55
19 0.59
20 0.58
21 0.58
22 0.55
23 0.55
24 0.58
25 0.56
26 0.53
27 0.45
28 0.36
29 0.3
30 0.27
31 0.22
32 0.16
33 0.15
34 0.11
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.17
41 0.22
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.3
46 0.32
47 0.3
48 0.28
49 0.26
50 0.27
51 0.29
52 0.29
53 0.25
54 0.28
55 0.28
56 0.27
57 0.27
58 0.26
59 0.25
60 0.26
61 0.3
62 0.31
63 0.36
64 0.44
65 0.52
66 0.6
67 0.68
68 0.74
69 0.75
70 0.78
71 0.81
72 0.8
73 0.81
74 0.8
75 0.75
76 0.7
77 0.66
78 0.6
79 0.55
80 0.47
81 0.36
82 0.28
83 0.25
84 0.23
85 0.22
86 0.19
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.19
91 0.19
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.18
99 0.16
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.2
126 0.29
127 0.3
128 0.3
129 0.33
130 0.41
131 0.45
132 0.56
133 0.63
134 0.62
135 0.66
136 0.75
137 0.81
138 0.84
139 0.9
140 0.9
141 0.91
142 0.92
143 0.91
144 0.85
145 0.81
146 0.76
147 0.71
148 0.62
149 0.54
150 0.44
151 0.35
152 0.3
153 0.24
154 0.2
155 0.16
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.16
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.2
191 0.22
192 0.25
193 0.28
194 0.32
195 0.34
196 0.35
197 0.34
198 0.35
199 0.31
200 0.3
201 0.33
202 0.3
203 0.28
204 0.26
205 0.26
206 0.24
207 0.24
208 0.21
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.14
228 0.22
229 0.3
230 0.39
231 0.47
232 0.51
233 0.54
234 0.62
235 0.7
236 0.72
237 0.74
238 0.73
239 0.67
240 0.72
241 0.75
242 0.67
243 0.59
244 0.52
245 0.44
246 0.37
247 0.35
248 0.25
249 0.19
250 0.16
251 0.15
252 0.12
253 0.1
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.12
264 0.15
265 0.19
266 0.23
267 0.23
268 0.25
269 0.29
270 0.3
271 0.26
272 0.24
273 0.25
274 0.23
275 0.27
276 0.25
277 0.2
278 0.19
279 0.2
280 0.19
281 0.14
282 0.12
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.1
327 0.14
328 0.17
329 0.21
330 0.22
331 0.26
332 0.33
333 0.43
334 0.5
335 0.53
336 0.54
337 0.52
338 0.51
339 0.47
340 0.42
341 0.33
342 0.24
343 0.18
344 0.14
345 0.14
346 0.13
347 0.13
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.13
357 0.15
358 0.22
359 0.25
360 0.28
361 0.29
362 0.27
363 0.26
364 0.26
365 0.26
366 0.28
367 0.28
368 0.28
369 0.29
370 0.33
371 0.37
372 0.34
373 0.32
374 0.23
375 0.19
376 0.18
377 0.16
378 0.12
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.11
386 0.16
387 0.2
388 0.28
389 0.39
390 0.5
391 0.6
392 0.7
393 0.78
394 0.84
395 0.91
396 0.94
397 0.95
398 0.95
399 0.94
400 0.93
401 0.86
402 0.8
403 0.7
404 0.63
405 0.56
406 0.54
407 0.49
408 0.43
409 0.45
410 0.4
411 0.39
412 0.34
413 0.3
414 0.22
415 0.16
416 0.13
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.1
431 0.15
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.19
438 0.15
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.09
452 0.17
453 0.22
454 0.29
455 0.31
456 0.32
457 0.33
458 0.38
459 0.45
460 0.47
461 0.49
462 0.52
463 0.51
464 0.5
465 0.49
466 0.42
467 0.34
468 0.25
469 0.21
470 0.11
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.15
479 0.15
480 0.16
481 0.19
482 0.2
483 0.25
484 0.3
485 0.32
486 0.33
487 0.33
488 0.34
489 0.36
490 0.37
491 0.33
492 0.28
493 0.25
494 0.23
495 0.21
496 0.2
497 0.16
498 0.13
499 0.12
500 0.16
501 0.22
502 0.25
503 0.31
504 0.35
505 0.39
506 0.44
507 0.5
508 0.55
509 0.58
510 0.63
511 0.67
512 0.73
513 0.78
514 0.84
515 0.85
516 0.86
517 0.87
518 0.86
519 0.84
520 0.76
521 0.69
522 0.65
523 0.64
524 0.55
525 0.45
526 0.37
527 0.28
528 0.27
529 0.24
530 0.19
531 0.13
532 0.12
533 0.14
534 0.14
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.22
540 0.24
541 0.27
542 0.34
543 0.37
544 0.33
545 0.36
546 0.38
547 0.31
548 0.34
549 0.38
550 0.42
551 0.49
552 0.58
553 0.65
554 0.72
555 0.75
556 0.77
557 0.75
558 0.67
559 0.61
560 0.53
561 0.46
562 0.46
563 0.42
564 0.34
565 0.26
566 0.24
567 0.2
568 0.18
569 0.16
570 0.09
571 0.1
572 0.11
573 0.13
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.13
579 0.17
580 0.2
581 0.26
582 0.31
583 0.33
584 0.38
585 0.4
586 0.39
587 0.35
588 0.34
589 0.31
590 0.28
591 0.28
592 0.25
593 0.23
594 0.22
595 0.27
596 0.3
597 0.3
598 0.3
599 0.31
600 0.33
601 0.37
602 0.44
603 0.46
604 0.49
605 0.51
606 0.57
607 0.61
608 0.62
609 0.65
610 0.64