Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HBT6

Protein Details
Accession U5HBT6    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-49GQLLAKQKRDKAQAKLKRRIARKEAENRGEEHydrophilic
447-483GESAPTEAPRRKKRPCTTPRKRSKPFHPLLRPRANSAHydrophilic
493-513PEPIPLPPKNGKKKDANNASVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-43AKQKRDKAQAKLKRRIARKEA
455-480PRRKKRPCTTPRKRSKPFHPLLRPRA
503-504GK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 12.5, mito 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSTVPKLDLSGIRNKVVRGQLLAKQKRDKAQAKLKRRIARKEAENRGEEVGKGWTRTIENTREWLGDSEEFADARTRPAPVKVDDATGDVTVDLGTLATLFPASTATPHVEGQPVPREPKMLITTSPGKPPAPFTRDFLADFQALMGGKSRADIVPRKSPKFELGRVARWARKRGYGAIAVVGEDHAKPTTLTLSLLPHGPTAHFRLTGITLGKDIPGHAKSTSHPPELVLNHFSTPLGLSLASLLSHLFLPPSAADLLARQGYQGRQVVLAQNSRDFVFIRRYRYMFALKGERLGSKKKVGLERQQPEDQEEDDTIKTRFQEIGPRMTVKMRWIRRGALGETGDERSERERNEKAAGVGEGEGTFGEVAQGEDPNLGEVGGSGRRNKGKGRAGDDDEDEDEDEDEQEAEAARAIGLGEGEHAGTLSIDPETGAARSQAKDIAMADGESAPTEAPRRKKRPCTTPRKRSKPFHPLLRPRANSASPPPGELAEPEPIPLPPKNGKKKDANNASVLSSVGKTWHAGRGEGGVREAKKRQEWGWEAKMQVSRRKFFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.44
4 0.42
5 0.38
6 0.4
7 0.42
8 0.5
9 0.58
10 0.59
11 0.62
12 0.66
13 0.69
14 0.73
15 0.74
16 0.73
17 0.77
18 0.79
19 0.81
20 0.85
21 0.86
22 0.84
23 0.86
24 0.86
25 0.84
26 0.83
27 0.83
28 0.83
29 0.84
30 0.84
31 0.77
32 0.7
33 0.65
34 0.56
35 0.46
36 0.37
37 0.34
38 0.28
39 0.27
40 0.25
41 0.24
42 0.24
43 0.3
44 0.36
45 0.34
46 0.35
47 0.38
48 0.4
49 0.37
50 0.37
51 0.32
52 0.29
53 0.24
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.18
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.18
65 0.24
66 0.28
67 0.27
68 0.33
69 0.31
70 0.32
71 0.3
72 0.3
73 0.26
74 0.21
75 0.19
76 0.13
77 0.11
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.21
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.3
105 0.28
106 0.35
107 0.33
108 0.28
109 0.25
110 0.27
111 0.34
112 0.35
113 0.39
114 0.35
115 0.32
116 0.31
117 0.36
118 0.4
119 0.38
120 0.37
121 0.36
122 0.38
123 0.39
124 0.4
125 0.35
126 0.29
127 0.23
128 0.22
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.11
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.1
139 0.14
140 0.21
141 0.24
142 0.34
143 0.42
144 0.45
145 0.46
146 0.47
147 0.5
148 0.51
149 0.49
150 0.48
151 0.47
152 0.48
153 0.52
154 0.56
155 0.53
156 0.52
157 0.55
158 0.48
159 0.48
160 0.46
161 0.43
162 0.42
163 0.4
164 0.35
165 0.31
166 0.28
167 0.21
168 0.19
169 0.15
170 0.11
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.18
196 0.17
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.14
208 0.14
209 0.24
210 0.29
211 0.26
212 0.25
213 0.24
214 0.29
215 0.29
216 0.31
217 0.23
218 0.2
219 0.18
220 0.19
221 0.18
222 0.13
223 0.11
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.16
257 0.17
258 0.2
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.13
265 0.12
266 0.19
267 0.22
268 0.26
269 0.29
270 0.29
271 0.3
272 0.33
273 0.34
274 0.27
275 0.27
276 0.28
277 0.24
278 0.27
279 0.26
280 0.26
281 0.25
282 0.28
283 0.27
284 0.25
285 0.27
286 0.29
287 0.35
288 0.38
289 0.45
290 0.5
291 0.52
292 0.54
293 0.54
294 0.5
295 0.45
296 0.4
297 0.32
298 0.23
299 0.19
300 0.15
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.11
309 0.19
310 0.21
311 0.26
312 0.27
313 0.28
314 0.27
315 0.28
316 0.28
317 0.26
318 0.32
319 0.31
320 0.35
321 0.36
322 0.37
323 0.4
324 0.43
325 0.38
326 0.35
327 0.31
328 0.25
329 0.25
330 0.24
331 0.2
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.16
336 0.17
337 0.2
338 0.22
339 0.24
340 0.27
341 0.28
342 0.25
343 0.23
344 0.22
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.1
349 0.08
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.06
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.18
372 0.22
373 0.24
374 0.28
375 0.35
376 0.39
377 0.44
378 0.49
379 0.51
380 0.52
381 0.53
382 0.51
383 0.44
384 0.37
385 0.31
386 0.25
387 0.18
388 0.14
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.12
423 0.12
424 0.14
425 0.16
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.16
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.11
435 0.09
436 0.09
437 0.07
438 0.07
439 0.13
440 0.18
441 0.28
442 0.38
443 0.48
444 0.57
445 0.68
446 0.77
447 0.83
448 0.88
449 0.9
450 0.9
451 0.92
452 0.94
453 0.94
454 0.94
455 0.92
456 0.92
457 0.92
458 0.9
459 0.9
460 0.89
461 0.89
462 0.89
463 0.9
464 0.82
465 0.76
466 0.74
467 0.66
468 0.6
469 0.56
470 0.55
471 0.45
472 0.44
473 0.4
474 0.34
475 0.32
476 0.28
477 0.25
478 0.2
479 0.19
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.21
484 0.21
485 0.24
486 0.28
487 0.39
488 0.49
489 0.56
490 0.64
491 0.7
492 0.78
493 0.83
494 0.84
495 0.79
496 0.73
497 0.68
498 0.61
499 0.51
500 0.42
501 0.33
502 0.23
503 0.18
504 0.15
505 0.14
506 0.14
507 0.15
508 0.21
509 0.21
510 0.21
511 0.22
512 0.27
513 0.3
514 0.3
515 0.3
516 0.3
517 0.31
518 0.37
519 0.41
520 0.42
521 0.44
522 0.49
523 0.49
524 0.53
525 0.58
526 0.61
527 0.64
528 0.61
529 0.56
530 0.57
531 0.6
532 0.56
533 0.58
534 0.57