Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HD82

Protein Details
Accession U5HD82    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-429VPAPGSTGKKKDKEKVYRLKFEDDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-175KKRGPYKKKEKG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
IPR047288  Tudor_SGF29_rpt1  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
CDD cd20393  Tudor_SGF29_rpt1  
Amino Acid Sequences MVSTASAPPPAKKPRTTMEPSAQLDIPTLTSTLRTRLKAYAQLASKLDTTLKDVNQVHSELDTDNKPINLVKGRLDRLYDLVGEDTNAELKRLDQAIETLDVLVVLAKEPPPPPIRALAFTALAGTSNAAATASSSSSSVTAPTSSVSTPVSAANSPASSVASKKRGPYKKKEKGDGGSRAVSPTNSVPASPLPAYSTTTSPPLSRHPSIAGKTSGKTSGKTAGKTGGKISAAIAASASTSSMNGSPAIPSPANTSTPNTGTPTMTKKATAKSKKETSATSTTSSNLAFHAQLPLGPGRQVAFRQPSKSVVLGEEKQDEWILARVIASIGGDKHRYQVEDVDYDVMNPTSDQGKFNTTTKSIIPLPDRMDNKTYPDHDYTPGQAVLALYPETTSFYRAIVQSGPVPAPGSTGKKKDKEKVYRLKFEDDGDSVREIPIEFVLDIPDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.66
3 0.7
4 0.69
5 0.68
6 0.7
7 0.68
8 0.66
9 0.58
10 0.49
11 0.43
12 0.34
13 0.26
14 0.18
15 0.15
16 0.11
17 0.14
18 0.15
19 0.22
20 0.27
21 0.28
22 0.31
23 0.36
24 0.41
25 0.45
26 0.47
27 0.47
28 0.44
29 0.47
30 0.45
31 0.42
32 0.37
33 0.3
34 0.29
35 0.23
36 0.25
37 0.26
38 0.25
39 0.31
40 0.33
41 0.35
42 0.36
43 0.36
44 0.31
45 0.26
46 0.26
47 0.19
48 0.21
49 0.18
50 0.17
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.23
56 0.25
57 0.26
58 0.31
59 0.37
60 0.4
61 0.42
62 0.43
63 0.38
64 0.34
65 0.34
66 0.27
67 0.2
68 0.18
69 0.16
70 0.14
71 0.12
72 0.1
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.17
85 0.16
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.1
96 0.11
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.23
101 0.28
102 0.29
103 0.28
104 0.31
105 0.27
106 0.25
107 0.22
108 0.21
109 0.14
110 0.13
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.11
148 0.16
149 0.21
150 0.23
151 0.27
152 0.37
153 0.45
154 0.52
155 0.61
156 0.67
157 0.71
158 0.77
159 0.8
160 0.77
161 0.75
162 0.76
163 0.72
164 0.65
165 0.57
166 0.5
167 0.43
168 0.37
169 0.3
170 0.22
171 0.16
172 0.15
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.15
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.19
191 0.24
192 0.24
193 0.24
194 0.25
195 0.29
196 0.3
197 0.32
198 0.3
199 0.25
200 0.25
201 0.25
202 0.27
203 0.23
204 0.22
205 0.2
206 0.25
207 0.26
208 0.26
209 0.26
210 0.27
211 0.28
212 0.28
213 0.27
214 0.22
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.19
243 0.18
244 0.2
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.17
249 0.19
250 0.22
251 0.23
252 0.22
253 0.23
254 0.23
255 0.29
256 0.38
257 0.44
258 0.46
259 0.52
260 0.58
261 0.61
262 0.61
263 0.56
264 0.52
265 0.5
266 0.46
267 0.4
268 0.33
269 0.29
270 0.28
271 0.26
272 0.2
273 0.14
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.17
289 0.23
290 0.26
291 0.29
292 0.3
293 0.33
294 0.33
295 0.33
296 0.28
297 0.23
298 0.26
299 0.25
300 0.26
301 0.25
302 0.23
303 0.23
304 0.21
305 0.18
306 0.13
307 0.14
308 0.11
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.11
318 0.13
319 0.13
320 0.17
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.24
325 0.24
326 0.23
327 0.24
328 0.23
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.14
333 0.1
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.19
341 0.22
342 0.25
343 0.28
344 0.25
345 0.27
346 0.26
347 0.29
348 0.27
349 0.3
350 0.31
351 0.31
352 0.34
353 0.39
354 0.41
355 0.4
356 0.42
357 0.38
358 0.4
359 0.41
360 0.4
361 0.38
362 0.41
363 0.39
364 0.38
365 0.39
366 0.37
367 0.34
368 0.32
369 0.26
370 0.22
371 0.19
372 0.16
373 0.16
374 0.13
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.17
384 0.17
385 0.19
386 0.17
387 0.19
388 0.2
389 0.23
390 0.22
391 0.19
392 0.2
393 0.17
394 0.19
395 0.22
396 0.27
397 0.3
398 0.39
399 0.47
400 0.54
401 0.63
402 0.69
403 0.75
404 0.78
405 0.82
406 0.84
407 0.86
408 0.87
409 0.84
410 0.81
411 0.73
412 0.65
413 0.6
414 0.52
415 0.45
416 0.37
417 0.35
418 0.29
419 0.26
420 0.23
421 0.18
422 0.16
423 0.14
424 0.14
425 0.12
426 0.12