Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H3A0

Protein Details
Accession U5H3A0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-181TIASKHLRKSKAKTVKRPVQKHKHRTIRKTTPKKMTTTKKKTVSNKKKVTHKNKTTHKKTKKVATKKASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-187SRKKHTIASKHLRKSKAKTVKRPVQKHKHRTIRKTTPKKMTTTKKKTVSNKKKVTHKNKTTHKKTKKVATKKASGIKAKL
Subcellular Location(s) extr 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023346  Lysozyme-like_dom_sf  
IPR008258  Transglycosylase_SLT_dom_1  
Pfam View protein in Pfam  
PF01464  SLT  
Amino Acid Sequences MHISALLYLLGAISTLISGVAAHPNLEWYQNRDLLGRQEVVQPSTLNVAATGAEDPHVSSPLRRRSCAAKARQRTAVAAKSNSAVRLQLASTKGASTHIRTTTKVSASRKKHTIASKHLRKSKAKTVKRPVQKHKHRTIRKTTPKKMTTTKKKTVSNKKKVTHKNKTTHKKTKKVATKKASGIKAKLDSKTGKSSSSGSGGTVFTSKSNGDGPGLFGVSTSQCGASGATEAITKSSGPNGAESWLNCGFSTSNPNSGWNPPYIKISQLRARTMEEALAMPNSVFSACKPYVYLFEKYGSQLGLPPILLASIAMQESSCNAGTMGDHGGAWGLMQITSDKCGNAPNGNCADPDYNVGTGARYLKGLLDQQNGDVLVSLGMYNGWYRGLTYYGATKIRDSCFQCQNNGDYHQQLLNGWMQGIDGSQLGTIRNIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.03
3 0.03
4 0.03
5 0.04
6 0.05
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.15
12 0.16
13 0.21
14 0.22
15 0.22
16 0.29
17 0.31
18 0.33
19 0.31
20 0.33
21 0.34
22 0.36
23 0.32
24 0.28
25 0.32
26 0.33
27 0.33
28 0.32
29 0.27
30 0.23
31 0.24
32 0.23
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.11
46 0.16
47 0.24
48 0.34
49 0.39
50 0.4
51 0.42
52 0.47
53 0.57
54 0.62
55 0.63
56 0.64
57 0.68
58 0.73
59 0.76
60 0.7
61 0.65
62 0.63
63 0.59
64 0.55
65 0.47
66 0.42
67 0.39
68 0.39
69 0.35
70 0.29
71 0.22
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.19
82 0.21
83 0.19
84 0.24
85 0.29
86 0.31
87 0.32
88 0.37
89 0.4
90 0.43
91 0.46
92 0.47
93 0.5
94 0.55
95 0.62
96 0.62
97 0.59
98 0.61
99 0.62
100 0.62
101 0.63
102 0.67
103 0.69
104 0.73
105 0.77
106 0.78
107 0.77
108 0.75
109 0.75
110 0.75
111 0.75
112 0.76
113 0.8
114 0.82
115 0.85
116 0.88
117 0.88
118 0.88
119 0.9
120 0.9
121 0.89
122 0.9
123 0.9
124 0.89
125 0.89
126 0.89
127 0.89
128 0.89
129 0.88
130 0.88
131 0.83
132 0.8
133 0.79
134 0.79
135 0.79
136 0.78
137 0.78
138 0.76
139 0.79
140 0.83
141 0.85
142 0.85
143 0.84
144 0.84
145 0.82
146 0.84
147 0.87
148 0.88
149 0.87
150 0.86
151 0.85
152 0.86
153 0.9
154 0.9
155 0.9
156 0.89
157 0.87
158 0.84
159 0.84
160 0.84
161 0.84
162 0.83
163 0.8
164 0.77
165 0.75
166 0.76
167 0.72
168 0.66
169 0.58
170 0.53
171 0.52
172 0.48
173 0.43
174 0.4
175 0.36
176 0.36
177 0.4
178 0.37
179 0.31
180 0.28
181 0.29
182 0.25
183 0.25
184 0.21
185 0.14
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.2
238 0.16
239 0.2
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.26
244 0.27
245 0.23
246 0.24
247 0.2
248 0.24
249 0.22
250 0.24
251 0.25
252 0.29
253 0.32
254 0.34
255 0.35
256 0.33
257 0.35
258 0.33
259 0.3
260 0.25
261 0.19
262 0.15
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.21
278 0.25
279 0.27
280 0.22
281 0.23
282 0.24
283 0.24
284 0.25
285 0.18
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.05
321 0.07
322 0.07
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.14
328 0.17
329 0.22
330 0.23
331 0.27
332 0.3
333 0.3
334 0.3
335 0.3
336 0.28
337 0.22
338 0.24
339 0.2
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.14
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.15
351 0.21
352 0.24
353 0.27
354 0.27
355 0.27
356 0.29
357 0.28
358 0.25
359 0.19
360 0.14
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.16
377 0.21
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.32
382 0.34
383 0.41
384 0.41
385 0.44
386 0.5
387 0.52
388 0.54
389 0.52
390 0.52
391 0.5
392 0.49
393 0.46
394 0.38
395 0.38
396 0.34
397 0.31
398 0.28
399 0.25
400 0.25
401 0.21
402 0.19
403 0.16
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.09