FuNGI

U5HHQ1

Protein Details

Accession

U5HHQ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
435-474	GSVQEERKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
441-474	RKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEE

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MPSHTPSSLHLKHHPTSPAKPEQQPNGTGTASSASTSSDEFIRFAATMRLPLAPVWSADGAAGGEMGSGGIEGVRQVLAGWVMRYLPPLQCVLLTFSPTPTFVHPTSTFPSHASPFPPVSSSTRSGLTLTSRENSNKEDDPKPTKNPDEQDEQEEEDKVKFKVLPMISGTGFGLPIVHFTGVGWRPRVGQKMVGSPTLSTPSHVSLLLHNLFNATLPASHIPSDEWRFDPDYVVPAFIRERQKMAFPTTSATKTANEEAEEAERTEEGIEADAEGGEEKEEELAQEEEARLAMEEDEMYADRGWWVNVRTGEPMGGEKGSVEFTIVSLTIANSMITVTGSLLSSPFSSKVPPQNPIIATYRSGLSNAADVMRRHTTEEHNRKRKEMAKELGEDDDESQSESESESEAKDGRRGERAVSMSPVDQVPRVKEEGVVGSVQEERKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.59
3	0.61
4	0.64
5	0.66
6	0.66
7	0.71
8	0.72
9	0.73
10	0.72
11	0.68
12	0.62
13	0.56
14	0.48
15	0.4
16	0.33
17	0.26
18	0.2
19	0.16
20	0.14
21	0.11
22	0.12
23	0.12
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.13
31	0.14
32	0.18
33	0.16
34	0.17
35	0.18
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.2
40	0.15
41	0.15
42	0.16
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.13
47	0.1
48	0.09
49	0.08
50	0.05
51	0.04
52	0.04
53	0.04
54	0.03
55	0.03
56	0.03
57	0.03
58	0.03
59	0.03
60	0.04
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.05
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.1
70	0.1
71	0.13
72	0.14
73	0.14
74	0.15
75	0.16
76	0.16
77	0.15
78	0.16
79	0.19
80	0.18
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.2
85	0.2
86	0.21
87	0.18
88	0.22
89	0.19
90	0.26
91	0.25
92	0.28
93	0.32
94	0.33
95	0.32
96	0.28
97	0.31
98	0.27
99	0.28
100	0.26
101	0.25
102	0.24
103	0.24
104	0.23
105	0.22
106	0.24
107	0.27
108	0.28
109	0.26
110	0.25
111	0.25
112	0.24
113	0.23
114	0.22
115	0.21
116	0.2
117	0.21
118	0.23
119	0.25
120	0.26
121	0.27
122	0.29
123	0.31
124	0.34
125	0.36
126	0.39
127	0.46
128	0.49
129	0.53
130	0.54
131	0.54
132	0.55
133	0.55
134	0.52
135	0.51
136	0.48
137	0.46
138	0.42
139	0.4
140	0.34
141	0.3
142	0.27
143	0.21
144	0.21
145	0.16
146	0.16
147	0.14
148	0.14
149	0.2
150	0.2
151	0.21
152	0.21
153	0.23
154	0.21
155	0.21
156	0.2
157	0.13
158	0.12
159	0.09
160	0.08
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.13
168	0.16
169	0.19
170	0.19
171	0.18
172	0.21
173	0.25
174	0.29
175	0.23
176	0.25
177	0.25
178	0.31
179	0.32
180	0.31
181	0.28
182	0.24
183	0.24
184	0.23
185	0.21
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.14
192	0.1
193	0.16
194	0.17
195	0.15
196	0.14
197	0.13
198	0.12
199	0.12
200	0.11
201	0.06
202	0.04
203	0.05
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.13
210	0.15
211	0.16
212	0.16
213	0.17
214	0.18
215	0.18
216	0.19
217	0.15
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.11
222	0.1
223	0.11
224	0.15
225	0.2
226	0.18
227	0.19
228	0.19
229	0.23
230	0.24
231	0.27
232	0.23
233	0.18
234	0.2
235	0.21
236	0.22
237	0.2
238	0.19
239	0.16
240	0.17
241	0.18
242	0.17
243	0.14
244	0.14
245	0.13
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.1
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.09
292	0.1
293	0.13
294	0.15
295	0.16
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.15
300	0.15
301	0.12
302	0.11
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.09
333	0.09
334	0.11
335	0.16
336	0.26
337	0.29
338	0.32
339	0.33
340	0.39
341	0.39
342	0.41
343	0.4
344	0.32
345	0.29
346	0.28
347	0.26
348	0.2
349	0.2
350	0.16
351	0.13
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.15
356	0.14
357	0.19
358	0.22
359	0.22
360	0.23
361	0.26
362	0.33
363	0.41
364	0.52
365	0.58
366	0.64
367	0.66
368	0.67
369	0.71
370	0.7
371	0.69
372	0.67
373	0.64
374	0.61
375	0.62
376	0.62
377	0.56
378	0.49
379	0.4
380	0.32
381	0.25
382	0.19
383	0.16
384	0.13
385	0.11
386	0.11
387	0.1
388	0.09
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.11
393	0.14
394	0.15
395	0.19
396	0.22
397	0.24
398	0.3
399	0.31
400	0.31
401	0.35
402	0.37
403	0.35
404	0.35
405	0.33
406	0.27
407	0.28
408	0.28
409	0.22
410	0.22
411	0.23
412	0.24
413	0.26
414	0.28
415	0.26
416	0.25
417	0.27
418	0.26
419	0.24
420	0.21
421	0.17
422	0.16
423	0.2
424	0.2
425	0.22
426	0.22
427	0.24
428	0.32
429	0.42
430	0.48
431	0.55
432	0.65
433	0.7
434	0.78
435	0.86
436	0.89
437	0.9
438	0.94
439	0.94
440	0.95
441	0.96
442	0.96
443	0.96
444	0.97
445	0.96
446	0.96
447	0.96
448	0.96
449	0.95
450	0.95
451	0.93
452	0.92
453	0.91
454	0.91

U5HHQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer