FuNGI

U5HDY1

Protein Details

Accession

U5HDY1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-35	TTTPAHDRPVRKKPISRHTLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 10.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR006225 PsdUridine_synth_RluC/D IPR006145 PsdUridine_synth_RsuA/RluA
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
Pfam	View protein in Pfam PF00849 PseudoU_synth_2
CDD	cd02557 PseudoU_synth_ScRIB2

Amino Acid Sequences

MESPTQDDVVAATATTTPAHDRPVRKKPISRHTLPEPSGIFAMPPPRPQYYTDQGLRKVRPYWYAFNAYAKQRWQNRSLIDVYSEFRLALPPPAEETLFVLTSRYNTPTDRRDLGDWIRDRSHEYYIWSIETGAIIVNNERTTPEYILKNGDMISNVVHRHEPPVVAGPIRIIYDGRLPGNDGETLVVEKPGSMPVHSTGRYHFNTLLSILKHDCDLPLVHTSNRLDRLTSGVMICALTVEASKKLGAWFGGQRRDGGTVHKEYVARCVGKFPEEEVTCEEPLMTIDRQIGINVVHPEGRSAKTIFTRLSYDAKSNTSAVHCRPITGRSHQIRVHLQFLGFPIANDPIYRNSAAWGTNGGKGGVFPLSTEQREQYVKGGSFGGEERGGGNVDRQERRDRGDKLMGSAQQKSLDLSSIAAAMSLDDHSRPHTNATGDERSKEEEKAKTENEPNKAQKDLDDEGIDLDRKAHDPSITPAARTAILALRDVKDEADGWARSRDLRGLELARLGAEDHGCVGNAERAMLDVAHSKAEAEEGEGQFTDDVEATSKWVEKDPAFCRDCFTPLVPDPRPEQLFIWLHALRYRTTEWDYSSPLPYWAEANYDVPLNSILT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.13
5	0.15
6	0.22
7	0.28
8	0.37
9	0.46
10	0.56
11	0.65
12	0.69
13	0.75
14	0.79
15	0.83
16	0.83
17	0.8
18	0.77
19	0.76
20	0.78
21	0.72
22	0.68
23	0.59
24	0.51
25	0.46
26	0.38
27	0.29
28	0.22
29	0.28
30	0.24
31	0.28
32	0.3
33	0.33
34	0.35
35	0.39
36	0.44
37	0.44
38	0.5
39	0.52
40	0.54
41	0.58
42	0.64
43	0.63
44	0.6
45	0.57
46	0.53
47	0.54
48	0.53
49	0.53
50	0.51
51	0.55
52	0.52
53	0.54
54	0.56
55	0.53
56	0.52
57	0.5
58	0.52
59	0.54
60	0.58
61	0.56
62	0.56
63	0.53
64	0.54
65	0.52
66	0.45
67	0.39
68	0.35
69	0.32
70	0.28
71	0.25
72	0.19
73	0.16
74	0.17
75	0.15
76	0.18
77	0.17
78	0.16
79	0.19
80	0.2
81	0.2
82	0.19
83	0.2
84	0.17
85	0.17
86	0.16
87	0.13
88	0.12
89	0.14
90	0.17
91	0.17
92	0.17
93	0.19
94	0.26
95	0.32
96	0.37
97	0.38
98	0.39
99	0.38
100	0.42
101	0.44
102	0.46
103	0.43
104	0.42
105	0.41
106	0.39
107	0.41
108	0.38
109	0.37
110	0.29
111	0.3
112	0.29
113	0.28
114	0.28
115	0.24
116	0.21
117	0.17
118	0.15
119	0.12
120	0.08
121	0.07
122	0.06
123	0.07
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.1
128	0.12
129	0.15
130	0.17
131	0.21
132	0.21
133	0.23
134	0.26
135	0.25
136	0.24
137	0.21
138	0.2
139	0.16
140	0.14
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.14
145	0.16
146	0.15
147	0.18
148	0.19
149	0.17
150	0.15
151	0.2
152	0.2
153	0.19
154	0.19
155	0.16
156	0.16
157	0.16
158	0.15
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.16
163	0.15
164	0.14
165	0.15
166	0.15
167	0.17
168	0.16
169	0.12
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.11
179	0.11
180	0.1
181	0.11
182	0.14
183	0.2
184	0.2
185	0.21
186	0.19
187	0.26
188	0.27
189	0.28
190	0.27
191	0.22
192	0.22
193	0.23
194	0.24
195	0.17
196	0.18
197	0.16
198	0.15
199	0.14
200	0.14
201	0.12
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.14
206	0.16
207	0.15
208	0.19
209	0.21
210	0.24
211	0.28
212	0.26
213	0.22
214	0.21
215	0.24
216	0.21
217	0.21
218	0.17
219	0.12
220	0.12
221	0.11
222	0.1
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.1
236	0.15
237	0.2
238	0.26
239	0.26
240	0.26
241	0.26
242	0.28
243	0.26
244	0.24
245	0.23
246	0.2
247	0.21
248	0.23
249	0.24
250	0.21
251	0.26
252	0.26
253	0.23
254	0.2
255	0.22
256	0.2
257	0.21
258	0.21
259	0.17
260	0.2
261	0.19
262	0.2
263	0.22
264	0.24
265	0.22
266	0.22
267	0.2
268	0.13
269	0.13
270	0.14
271	0.09
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.13
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.14
290	0.15
291	0.18
292	0.17
293	0.16
294	0.18
295	0.18
296	0.21
297	0.2
298	0.2
299	0.19
300	0.2
301	0.2
302	0.18
303	0.17
304	0.15
305	0.17
306	0.16
307	0.22
308	0.2
309	0.2
310	0.21
311	0.23
312	0.24
313	0.26
314	0.34
315	0.3
316	0.36
317	0.36
318	0.4
319	0.42
320	0.41
321	0.39
322	0.31
323	0.28
324	0.23
325	0.22
326	0.21
327	0.14
328	0.12
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.13
348	0.12
349	0.12
350	0.1
351	0.08
352	0.06
353	0.09
354	0.12
355	0.13
356	0.14
357	0.14
358	0.17
359	0.18
360	0.18
361	0.17
362	0.19
363	0.18
364	0.18
365	0.18
366	0.15
367	0.15
368	0.15
369	0.14
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.11
378	0.18
379	0.2
380	0.23
381	0.29
382	0.3
383	0.35
384	0.41
385	0.4
386	0.4
387	0.45
388	0.42
389	0.39
390	0.42
391	0.42
392	0.37
393	0.36
394	0.32
395	0.26
396	0.26
397	0.23
398	0.19
399	0.15
400	0.12
401	0.11
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.09
414	0.12
415	0.13
416	0.15
417	0.18
418	0.19
419	0.22
420	0.29
421	0.34
422	0.33
423	0.34
424	0.33
425	0.34
426	0.34
427	0.34
428	0.33
429	0.29
430	0.32
431	0.37
432	0.37
433	0.39
434	0.46
435	0.49
436	0.49
437	0.53
438	0.55
439	0.52
440	0.53
441	0.46
442	0.4
443	0.4
444	0.36
445	0.3
446	0.25
447	0.22
448	0.21
449	0.22
450	0.21
451	0.14
452	0.13
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.15
459	0.19
460	0.28
461	0.27
462	0.26
463	0.26
464	0.25
465	0.25
466	0.23
467	0.21
468	0.14
469	0.15
470	0.17
471	0.18
472	0.17
473	0.19
474	0.19
475	0.17
476	0.14
477	0.14
478	0.14
479	0.17
480	0.17
481	0.17
482	0.2
483	0.2
484	0.2
485	0.22
486	0.23
487	0.19
488	0.2
489	0.23
490	0.23
491	0.23
492	0.24
493	0.22
494	0.19
495	0.17
496	0.16
497	0.13
498	0.11
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.1
513	0.11
514	0.12
515	0.13
516	0.13
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.11
522	0.17
523	0.17
524	0.19
525	0.18
526	0.19
527	0.17
528	0.17
529	0.15
530	0.08
531	0.08
532	0.09
533	0.09
534	0.1
535	0.12
536	0.15
537	0.15
538	0.18
539	0.22
540	0.23
541	0.31
542	0.35
543	0.43
544	0.43
545	0.42
546	0.43
547	0.4
548	0.41
549	0.36
550	0.33
551	0.31
552	0.34
553	0.43
554	0.42
555	0.43
556	0.44
557	0.48
558	0.48
559	0.43
560	0.38
561	0.38
562	0.38
563	0.36
564	0.4
565	0.33
566	0.32
567	0.33
568	0.34
569	0.26
570	0.28
571	0.28
572	0.26
573	0.3
574	0.32
575	0.35
576	0.37
577	0.42
578	0.41
579	0.42
580	0.37
581	0.35
582	0.32
583	0.28
584	0.25
585	0.2
586	0.21
587	0.19
588	0.2
589	0.19
590	0.2
591	0.19
592	0.18

U5HDY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer