FuNGI

U5HDD1

Protein Details

Accession

U5HDD1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-41	MESSPPHPKKQKLPPQSTTRHDASPAKKRKRDHSQAVEAAA	Hydrophilic
76-103	DGMAKLDKAKAKKRRKEVQKAMENPPSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-31	PAKKRKR
83-92	KAKAKKRRKE

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR034922 REX1-like_exo IPR047021 REXO1/3/4-like IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0004527 F:exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF00929 RNase_T
CDD	cd06145 REX1_like

Amino Acid Sequences

MESSPPHPKKQKLPPQSTTRHDASPAKKRKRDHSQAVEAAASSPAAPLAGTGPGKDSARNQQEAQHETEASPSADDGMAKLDKAKAKKRRKEVQKAMENPPSFAFDTRGFKGGRTIQIKDIRDFVLHLLSEEKAQQWLYVANKRNVQRVVALMIPGITSSTLGIPQPPTSANLPFALSPPATPSQLPIFQTLFSHACPTKAPGDKYKLHSCYQHFINCSLTGGEKDRREKARKEQGQSRKTADPSMYLMTPEQMAEQAYPLPTRSSSDPLKTSLKGWKRDDGWVEAPYQAPLQQGQIPQVLGIDCEMCLTEDGSELTRVSVVDMQGKSVYDSLVKPDKPILDYLTRFSGLDQEKLSNVTKRLEDVQRDLSELISYNTILIGHSLECDLRVLKLVHSFIIDTSVIYQHPRGPPFKASLKWLAQKWLKREIQNNTSTTPASIVPPAPTSIAPSKDALAALPASTGTDPSAPTAPLIGGHDSAEDALTCVDLLKLKMAKGPGFGEFQNDQETIFERLGRGTDKKRCAVVDHGTPGQWHGAKADSAIGCTNDDQVVEGVERSVEDHDLIVARFMDLSHALGWSQPSNAALGKWSATLPGINVVPSTTIQDSSSRSPSSASLDEVYAQLNVQLAKLHAALPPLTALVIFTGHNSPLEMSRLAAKKAKFDRLWKTIKQSEIADKDRWMEADDRALLDEVERCRTGLSFYCVK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.86
3	0.88
4	0.84
5	0.8
6	0.73
7	0.65
8	0.61
9	0.6
10	0.6
11	0.61
12	0.66
13	0.69
14	0.72
15	0.76
16	0.81
17	0.83
18	0.84
19	0.84
20	0.84
21	0.83
22	0.81
23	0.77
24	0.67
25	0.56
26	0.46
27	0.35
28	0.25
29	0.15
30	0.1
31	0.08
32	0.07
33	0.06
34	0.05
35	0.06
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.15
40	0.19
41	0.2
42	0.22
43	0.26
44	0.31
45	0.38
46	0.41
47	0.4
48	0.43
49	0.5
50	0.51
51	0.52
52	0.45
53	0.38
54	0.34
55	0.35
56	0.31
57	0.24
58	0.2
59	0.15
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.1
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.15
68	0.19
69	0.24
70	0.32
71	0.42
72	0.47
73	0.58
74	0.67
75	0.76
76	0.81
77	0.87
78	0.9
79	0.91
80	0.92
81	0.91
82	0.89
83	0.87
84	0.85
85	0.74
86	0.65
87	0.55
88	0.48
89	0.39
90	0.33
91	0.28
92	0.25
93	0.3
94	0.3
95	0.34
96	0.3
97	0.29
98	0.35
99	0.37
100	0.4
101	0.4
102	0.41
103	0.44
104	0.52
105	0.55
106	0.5
107	0.47
108	0.39
109	0.35
110	0.33
111	0.26
112	0.22
113	0.19
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.13
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.16
125	0.2
126	0.27
127	0.33
128	0.36
129	0.42
130	0.45
131	0.51
132	0.48
133	0.44
134	0.38
135	0.33
136	0.31
137	0.26
138	0.24
139	0.17
140	0.15
141	0.13
142	0.11
143	0.09
144	0.06
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.07
149	0.07
150	0.1
151	0.11
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.16
156	0.17
157	0.19
158	0.18
159	0.18
160	0.18
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.15
165	0.13
166	0.16
167	0.17
168	0.17
169	0.16
170	0.18
171	0.19
172	0.23
173	0.24
174	0.24
175	0.22
176	0.21
177	0.22
178	0.24
179	0.2
180	0.17
181	0.21
182	0.18
183	0.18
184	0.18
185	0.21
186	0.25
187	0.29
188	0.32
189	0.34
190	0.41
191	0.46
192	0.52
193	0.58
194	0.55
195	0.52
196	0.55
197	0.51
198	0.5
199	0.49
200	0.47
201	0.39
202	0.37
203	0.37
204	0.3
205	0.28
206	0.22
207	0.18
208	0.15
209	0.18
210	0.22
211	0.24
212	0.29
213	0.35
214	0.43
215	0.49
216	0.53
217	0.59
218	0.64
219	0.67
220	0.69
221	0.72
222	0.74
223	0.74
224	0.73
225	0.67
226	0.61
227	0.55
228	0.51
229	0.42
230	0.34
231	0.3
232	0.28
233	0.23
234	0.18
235	0.17
236	0.14
237	0.13
238	0.11
239	0.09
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.11
251	0.13
252	0.17
253	0.2
254	0.23
255	0.25
256	0.28
257	0.31
258	0.29
259	0.3
260	0.33
261	0.37
262	0.41
263	0.43
264	0.45
265	0.43
266	0.47
267	0.47
268	0.44
269	0.4
270	0.32
271	0.3
272	0.25
273	0.23
274	0.19
275	0.17
276	0.13
277	0.1
278	0.09
279	0.1
280	0.12
281	0.13
282	0.14
283	0.15
284	0.14
285	0.13
286	0.13
287	0.11
288	0.08
289	0.08
290	0.06
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.08
309	0.13
310	0.13
311	0.13
312	0.14
313	0.14
314	0.13
315	0.12
316	0.12
317	0.08
318	0.08
319	0.12
320	0.17
321	0.17
322	0.17
323	0.19
324	0.2
325	0.2
326	0.21
327	0.19
328	0.18
329	0.19
330	0.2
331	0.19
332	0.19
333	0.18
334	0.16
335	0.2
336	0.17
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.18
342	0.2
343	0.15
344	0.16
345	0.16
346	0.16
347	0.16
348	0.21
349	0.22
350	0.23
351	0.24
352	0.28
353	0.26
354	0.27
355	0.25
356	0.2
357	0.17
358	0.15
359	0.12
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.08
377	0.08
378	0.09
379	0.12
380	0.13
381	0.12
382	0.13
383	0.13
384	0.1
385	0.12
386	0.11
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.13
394	0.17
395	0.2
396	0.21
397	0.22
398	0.24
399	0.29
400	0.33
401	0.3
402	0.3
403	0.33
404	0.37
405	0.39
406	0.38
407	0.41
408	0.41
409	0.44
410	0.44
411	0.47
412	0.47
413	0.46
414	0.52
415	0.52
416	0.54
417	0.56
418	0.53
419	0.45
420	0.42
421	0.37
422	0.3
423	0.24
424	0.17
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.11
433	0.14
434	0.17
435	0.18
436	0.18
437	0.18
438	0.18
439	0.18
440	0.18
441	0.14
442	0.11
443	0.09
444	0.08
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.08
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.15
481	0.18
482	0.19
483	0.2
484	0.21
485	0.19
486	0.2
487	0.2
488	0.22
489	0.2
490	0.21
491	0.21
492	0.19
493	0.17
494	0.16
495	0.18
496	0.15
497	0.15
498	0.14
499	0.11
500	0.12
501	0.14
502	0.17
503	0.21
504	0.26
505	0.34
506	0.39
507	0.42
508	0.45
509	0.44
510	0.44
511	0.45
512	0.42
513	0.41
514	0.39
515	0.37
516	0.35
517	0.34
518	0.31
519	0.29
520	0.24
521	0.18
522	0.15
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.19
527	0.15
528	0.15
529	0.16
530	0.16
531	0.15
532	0.15
533	0.16
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.09
538	0.1
539	0.09
540	0.09
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.09
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.08
559	0.1
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.12
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.12
570	0.13
571	0.12
572	0.11
573	0.12
574	0.12
575	0.12
576	0.12
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.13
582	0.13
583	0.12
584	0.12
585	0.11
586	0.12
587	0.12
588	0.15
589	0.12
590	0.13
591	0.14
592	0.17
593	0.21
594	0.24
595	0.3
596	0.27
597	0.26
598	0.26
599	0.27
600	0.3
601	0.28
602	0.25
603	0.21
604	0.21
605	0.22
606	0.21
607	0.2
608	0.14
609	0.12
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.12
617	0.13
618	0.14
619	0.13
620	0.15
621	0.15
622	0.14
623	0.14
624	0.12
625	0.11
626	0.1
627	0.08
628	0.07
629	0.08
630	0.07
631	0.09
632	0.11
633	0.12
634	0.12
635	0.13
636	0.13
637	0.15
638	0.18
639	0.16
640	0.15
641	0.22
642	0.25
643	0.28
644	0.33
645	0.32
646	0.38
647	0.45
648	0.54
649	0.52
650	0.58
651	0.64
652	0.68
653	0.75
654	0.71
655	0.73
656	0.7
657	0.68
658	0.63
659	0.59
660	0.59
661	0.6
662	0.58
663	0.52
664	0.48
665	0.47
666	0.45
667	0.4
668	0.33
669	0.28
670	0.25
671	0.29
672	0.29
673	0.26
674	0.25
675	0.25
676	0.22
677	0.2
678	0.24
679	0.19
680	0.23
681	0.23
682	0.21
683	0.22
684	0.22
685	0.25
686	0.26

U5HDD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer