FuNGI

U5H2C6

Protein Details

Accession

U5H2C6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
953-1007	ATPPQPCTSYRSCPRRQRWCYAPRCCCRVVSRCRSSQWTPSSRRRRWRQALVARA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, nucl 6.5, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027512 EIF3A IPR000717 PCI_dom
Gene Ontology	GO:0010494 C:cytoplasmic stress granule GO:0016282 C:eukaryotic 43S preinitiation complex GO:0033290 C:eukaryotic 48S preinitiation complex GO:0071540 C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e GO:0071541 C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m GO:0003723 F:RNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0001732 P:formation of cytoplasmic translation initiation complex
Pfam	View protein in Pfam PF01399 PCI
PROSITE	View protein in PROSITE PS50250 PCI

Amino Acid Sequences

MSPFTRPELVIRRCDELLSVNQPLAALSSISEVFSSKRFRTTPLSMLEPILIKFLGLCVDLRKGRTAKEGLHIYKNVAQNTSVSSVEVVITKFLEQSRAKLTEALAKVDELEGPAPEKSTAADGDKDDVEDLEASETPESILLSTVSEEKSRDRTYRTLVTPWLRFLWEAYRTALDTLRNNARLEVLYQTVCHDAFAFCLEHQRKTEFRRLAETLRSHLTSSQKYSHQSHSINLNDPDTLQRHLDTRFVQLNTAVELELWQEAFRTAEDIHALVGMSKRAPKASMMATFFDKMVKVFGVGQNYLFHAAAYSKLYALHAARVAAVGDKAEDAELEKLSSLVLLSALAVPLGSGLLGESGKRREVSEEGEAKGKLGRLAALLGLNAAPTRSGLLNDALSRHVLKRVSPELRELYNILEVDFHPLSITSKIEPILASLAAKPETARYVEPLKDVVLARLFEQLAQVYASLKIERVVKLASFAASEQVAATRMRVERFVTEACRRGDLDVTIDHATGSIKFDEDLFNADTSAAPIASTSAAPYEAKSLQPSAAALLRSHLARLAASLHATLDAVAPEHSPIFAATQAREKAFAAFAAQGADEREALIARAQIIKRRKELAEEQNARAEKEEAHQRTLLAAKKAEEDALRQKNEVRNRELERVRREVEQVKQAEAAKIAESLVKGGLKVDIDKLPELSASDLVQLQVQQIEKDKKDLAQKLAGVNKRLDYLERAFRKEEIPLVKQDYERQQTRDRLAHESARTQRAEQNKKQHAEALAIKQSLARLMPDYRAYKEKAERESRAAYEAEEKRLAQALAAAKAERRQQVLDQRRREQEEEQRREQEKAERAERERAAAEAQREEEEREAAEKAAIEARQRQMEEEAEAARAAALAERKAERDKDLETVRLRQQREEEALARRQNRQPSGPPPVGSAEWKAARAPPPVPVRRCLVRCSLGATPPQPCTSYRSCPRRQRWCYAPRCCCRVVSRCRSSQWTPSSRRRRWRQALVARA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.4
3	0.34
4	0.35
5	0.33
6	0.32
7	0.27
8	0.27
9	0.26
10	0.25
11	0.21
12	0.15
13	0.09
14	0.08
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.11
19	0.11
20	0.12
21	0.18
22	0.24
23	0.23
24	0.3
25	0.31
26	0.36
27	0.43
28	0.48
29	0.49
30	0.48
31	0.52
32	0.46
33	0.45
34	0.43
35	0.37
36	0.31
37	0.26
38	0.2
39	0.14
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.19
47	0.23
48	0.25
49	0.32
50	0.32
51	0.35
52	0.42
53	0.43
54	0.4
55	0.45
56	0.53
57	0.5
58	0.55
59	0.53
60	0.5
61	0.52
62	0.53
63	0.47
64	0.39
65	0.34
66	0.28
67	0.31
68	0.3
69	0.24
70	0.19
71	0.16
72	0.15
73	0.16
74	0.17
75	0.13
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.14
80	0.14
81	0.22
82	0.2
83	0.24
84	0.31
85	0.33
86	0.33
87	0.32
88	0.33
89	0.34
90	0.34
91	0.34
92	0.27
93	0.24
94	0.24
95	0.22
96	0.21
97	0.14
98	0.13
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.13
107	0.15
108	0.16
109	0.18
110	0.18
111	0.21
112	0.21
113	0.21
114	0.19
115	0.16
116	0.15
117	0.12
118	0.11
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.11
133	0.12
134	0.13
135	0.14
136	0.18
137	0.25
138	0.3
139	0.32
140	0.35
141	0.38
142	0.44
143	0.51
144	0.5
145	0.47
146	0.5
147	0.53
148	0.51
149	0.48
150	0.44
151	0.36
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.26
156	0.26
157	0.25
158	0.24
159	0.24
160	0.26
161	0.26
162	0.23
163	0.22
164	0.27
165	0.33
166	0.34
167	0.34
168	0.33
169	0.32
170	0.29
171	0.27
172	0.24
173	0.19
174	0.16
175	0.16
176	0.17
177	0.18
178	0.17
179	0.16
180	0.14
181	0.11
182	0.11
183	0.13
184	0.13
185	0.1
186	0.2
187	0.22
188	0.25
189	0.28
190	0.32
191	0.35
192	0.4
193	0.5
194	0.46
195	0.46
196	0.49
197	0.5
198	0.51
199	0.53
200	0.49
201	0.43
202	0.42
203	0.41
204	0.35
205	0.35
206	0.37
207	0.34
208	0.36
209	0.38
210	0.37
211	0.42
212	0.45
213	0.48
214	0.49
215	0.45
216	0.44
217	0.47
218	0.46
219	0.46
220	0.43
221	0.38
222	0.3
223	0.29
224	0.3
225	0.24
226	0.22
227	0.18
228	0.17
229	0.19
230	0.2
231	0.24
232	0.21
233	0.24
234	0.28
235	0.27
236	0.27
237	0.26
238	0.25
239	0.22
240	0.21
241	0.15
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.15
268	0.15
269	0.18
270	0.21
271	0.26
272	0.25
273	0.26
274	0.27
275	0.27
276	0.26
277	0.23
278	0.19
279	0.13
280	0.12
281	0.1
282	0.09
283	0.11
284	0.14
285	0.16
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.18
290	0.19
291	0.15
292	0.13
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.09
310	0.09
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.02
338	0.02
339	0.02
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.07
344	0.09
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.14
349	0.16
350	0.2
351	0.25
352	0.27
353	0.26
354	0.29
355	0.28
356	0.26
357	0.25
358	0.22
359	0.15
360	0.12
361	0.11
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.03
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.19
390	0.27
391	0.3
392	0.3
393	0.33
394	0.32
395	0.32
396	0.32
397	0.27
398	0.2
399	0.19
400	0.18
401	0.13
402	0.11
403	0.11
404	0.15
405	0.14
406	0.12
407	0.1
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.12
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.15
432	0.16
433	0.17
434	0.16
435	0.15
436	0.17
437	0.16
438	0.15
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.14
443	0.14
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.08
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.05
470	0.05
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.09
475	0.1
476	0.11
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.14
481	0.16
482	0.17
483	0.19
484	0.23
485	0.23
486	0.23
487	0.23
488	0.21
489	0.2
490	0.16
491	0.15
492	0.1
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.09
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.07
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.05
516	0.04
517	0.03
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.09
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.1
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.09
543	0.07
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.14
569	0.16
570	0.16
571	0.17
572	0.16
573	0.15
574	0.15
575	0.14
576	0.1
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.11
593	0.12
594	0.18
595	0.25
596	0.29
597	0.32
598	0.36
599	0.36
600	0.36
601	0.44
602	0.47
603	0.51
604	0.52
605	0.5
606	0.51
607	0.51
608	0.46
609	0.38
610	0.3
611	0.19
612	0.19
613	0.27
614	0.24
615	0.26
616	0.26
617	0.25
618	0.26
619	0.3
620	0.29
621	0.22
622	0.21
623	0.2
624	0.21
625	0.22
626	0.22
627	0.18
628	0.18
629	0.25
630	0.3
631	0.3
632	0.29
633	0.33
634	0.38
635	0.45
636	0.47
637	0.42
638	0.42
639	0.46
640	0.55
641	0.56
642	0.57
643	0.55
644	0.55
645	0.52
646	0.46
647	0.46
648	0.43
649	0.42
650	0.42
651	0.38
652	0.33
653	0.35
654	0.34
655	0.3
656	0.26
657	0.22
658	0.14
659	0.13
660	0.12
661	0.1
662	0.09
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.1
669	0.09
670	0.1
671	0.12
672	0.13
673	0.14
674	0.15
675	0.15
676	0.14
677	0.13
678	0.13
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.08
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.17
692	0.23
693	0.23
694	0.26
695	0.27
696	0.28
697	0.36
698	0.41
699	0.38
700	0.36
701	0.38
702	0.4
703	0.46
704	0.45
705	0.4
706	0.36
707	0.33
708	0.31
709	0.29
710	0.25
711	0.22
712	0.24
713	0.3
714	0.33
715	0.35
716	0.34
717	0.35
718	0.35
719	0.32
720	0.33
721	0.3
722	0.29
723	0.3
724	0.34
725	0.35
726	0.35
727	0.39
728	0.42
729	0.44
730	0.45
731	0.45
732	0.48
733	0.51
734	0.56
735	0.55
736	0.49
737	0.47
738	0.47
739	0.49
740	0.44
741	0.46
742	0.46
743	0.47
744	0.46
745	0.42
746	0.42
747	0.46
748	0.54
749	0.54
750	0.58
751	0.6
752	0.62
753	0.61
754	0.6
755	0.51
756	0.47
757	0.45
758	0.42
759	0.38
760	0.36
761	0.34
762	0.31
763	0.29
764	0.25
765	0.2
766	0.14
767	0.12
768	0.14
769	0.17
770	0.23
771	0.25
772	0.27
773	0.31
774	0.33
775	0.36
776	0.42
777	0.46
778	0.49
779	0.54
780	0.54
781	0.55
782	0.57
783	0.52
784	0.47
785	0.4
786	0.32
787	0.34
788	0.34
789	0.32
790	0.29
791	0.28
792	0.27
793	0.3
794	0.28
795	0.19
796	0.2
797	0.19
798	0.2
799	0.21
800	0.2
801	0.18
802	0.23
803	0.29
804	0.27
805	0.26
806	0.26
807	0.31
808	0.42
809	0.51
810	0.57
811	0.6
812	0.64
813	0.69
814	0.72
815	0.69
816	0.66
817	0.66
818	0.68
819	0.68
820	0.67
821	0.68
822	0.65
823	0.64
824	0.6
825	0.57
826	0.54
827	0.54
828	0.54
829	0.53
830	0.54
831	0.61
832	0.58
833	0.53
834	0.45
835	0.39
836	0.35
837	0.32
838	0.31
839	0.26
840	0.26
841	0.25
842	0.26
843	0.26
844	0.23
845	0.21
846	0.18
847	0.17
848	0.16
849	0.14
850	0.14
851	0.12
852	0.12
853	0.16
854	0.16
855	0.18
856	0.23
857	0.28
858	0.32
859	0.32
860	0.32
861	0.31
862	0.31
863	0.3
864	0.26
865	0.22
866	0.18
867	0.17
868	0.15
869	0.12
870	0.1
871	0.08
872	0.09
873	0.1
874	0.1
875	0.15
876	0.16
877	0.2
878	0.25
879	0.27
880	0.28
881	0.29
882	0.3
883	0.34
884	0.36
885	0.4
886	0.39
887	0.43
888	0.48
889	0.52
890	0.52
891	0.49
892	0.51
893	0.51
894	0.52
895	0.51
896	0.48
897	0.47
898	0.54
899	0.56
900	0.55
901	0.55
902	0.56
903	0.6
904	0.61
905	0.6
906	0.61
907	0.62
908	0.67
909	0.65
910	0.59
911	0.53
912	0.51
913	0.46
914	0.41
915	0.35
916	0.33
917	0.31
918	0.31
919	0.3
920	0.31
921	0.34
922	0.36
923	0.34
924	0.35
925	0.43
926	0.51
927	0.53
928	0.52
929	0.53
930	0.58
931	0.6
932	0.56
933	0.54
934	0.49
935	0.47
936	0.48
937	0.47
938	0.42
939	0.45
940	0.44
941	0.41
942	0.4
943	0.41
944	0.38
945	0.34
946	0.37
947	0.37
948	0.44
949	0.5
950	0.56
951	0.64
952	0.73
953	0.82
954	0.86
955	0.87
956	0.87
957	0.87
958	0.87
959	0.87
960	0.88
961	0.88
962	0.85
963	0.84
964	0.77
965	0.72
966	0.71
967	0.7
968	0.7
969	0.71
970	0.71
971	0.71
972	0.75
973	0.76
974	0.73
975	0.73
976	0.72
977	0.71
978	0.72
979	0.76
980	0.81
981	0.82
982	0.88
983	0.89
984	0.9
985	0.9
986	0.91
987	0.92

U5H2C6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer