Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H045

Protein Details
Accession U5H045    Localization Confidence High Confidence Score 24.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKGPQKKTGKGRLDKWYQLHydrophilic
393-418SAEEQLRRKREKRRANEKKAREIQRMBasic
535-554MERDAKHKAKEERRKRDAKEBasic
830-853AEAKARKKMRTIRRAEKMRAKAQGHydrophilic
872-895AKVLSKAKSSAKPTKKREIKVVVAHydrophilic
916-945VDPRDRKEARALKRIAKRDKKGGGRRKKNKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-413RRKREKRRANEKKAR
538-555DAKHKAKEERRKRDAKEG
821-850LNARPIKKIAEAKARKKMRTIRRAEKMRAK
873-945KVLSKAKSSAKPTKKREIKVVVAKGANRGIKGRPKGVKGRYKMVDPRDRKEARALKRIAKRDKKGGGRRKKNK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGKGPQKKTGKGRLDKWYQLAKEQGYRARSAFKLIQLNKKYDFLSSARCVIDLCAAPGGWLQVAAKNMPPNSIIIGVDLVPIKPIPRCITLVDDITTEKCRRDIRAEVKDWKADVVLHDGAPNVGSAWVQDAFTQVELVLASLKLATEFLSAGGTFVTKVFRSKDYNSLIWVFNQLFNKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCSGYLAPSKIDPKLLNAKHVFSDIDITTSTGVNPLSAVAALGQGGRISSKDTLTPTSLNVFQPDKKRRNRDGYADGDLTLHKECGVSEFIRSVDPIGVLGLVNEMKWRTDEDKKLFKHPLTTLEIKALVQDLKVLGKKDFKTLLKYRLAVREDYGLENKGGDGQGGTEGPDATEEFEVEPLDEDEQIAQELSRLSAEEQLRRKREKRRANEKKAREIQRMQLNMVTPMDMGLERQDGVDDADVFDLGEVEGNEKAGRSGVQGRTIPEDVIDEDEEGDEEDQGINAARAKLLRMAEQSAVPMDEDDEDNDELDEEEIKMRRLERSLDTAYDMYHQHKMERDAKHKAKEERRKRDAKEGGEWHGIRAKGSDDEDDEDDEEDFDPAPQPSSDEEESDDEDMKVEGTLVPTTSKNGKPKSKALLTKLQPVISEEKKTAEKSRAAQMWFDQPVFKGMPGLDKLLNGDDDEAADLEDEASVEASDDEDGETWNGLDSVDEEEYEEELESEEDEYSDDDFTGARETHFEDSDMEEEADLKAQEEAEELKRQRIEEIGLTTAEAMTLAQQLVNREKTKTQLIDEGFNRYTSNVGGDGLPSWFLDDEQRHFRNNIPITKEAVLALREKMRELNARPIKKIAEAKARKKMRTIRRAEKMRAKAQGINDDEENGLTEKEKAASIAKVLSKAKSSAKPTKKREIKVVVAKGANRGIKGRPKGVKGRYKMVDPRDRKEARALKRIAKRDKKGGGRRKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.77
4 0.76
5 0.67
6 0.64
7 0.63
8 0.57
9 0.55
10 0.56
11 0.55
12 0.49
13 0.51
14 0.47
15 0.47
16 0.42
17 0.42
18 0.4
19 0.41
20 0.48
21 0.51
22 0.59
23 0.58
24 0.64
25 0.6
26 0.59
27 0.52
28 0.44
29 0.42
30 0.35
31 0.37
32 0.35
33 0.38
34 0.34
35 0.33
36 0.32
37 0.28
38 0.31
39 0.24
40 0.21
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.14
51 0.15
52 0.18
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.24
57 0.22
58 0.22
59 0.23
60 0.2
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.12
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.19
72 0.21
73 0.24
74 0.26
75 0.27
76 0.33
77 0.35
78 0.36
79 0.31
80 0.28
81 0.26
82 0.27
83 0.3
84 0.26
85 0.24
86 0.27
87 0.29
88 0.33
89 0.38
90 0.45
91 0.5
92 0.58
93 0.64
94 0.67
95 0.68
96 0.67
97 0.61
98 0.52
99 0.43
100 0.34
101 0.28
102 0.26
103 0.23
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.1
145 0.09
146 0.13
147 0.16
148 0.21
149 0.27
150 0.3
151 0.38
152 0.41
153 0.42
154 0.42
155 0.42
156 0.38
157 0.33
158 0.34
159 0.27
160 0.25
161 0.26
162 0.24
163 0.21
164 0.21
165 0.23
166 0.2
167 0.21
168 0.22
169 0.27
170 0.33
171 0.35
172 0.4
173 0.45
174 0.5
175 0.52
176 0.49
177 0.48
178 0.42
179 0.39
180 0.35
181 0.28
182 0.23
183 0.18
184 0.16
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.12
193 0.15
194 0.16
195 0.21
196 0.2
197 0.24
198 0.34
199 0.35
200 0.4
201 0.39
202 0.4
203 0.36
204 0.37
205 0.32
206 0.22
207 0.25
208 0.16
209 0.16
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.13
236 0.15
237 0.18
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.23
243 0.21
244 0.22
245 0.23
246 0.26
247 0.35
248 0.44
249 0.5
250 0.56
251 0.66
252 0.71
253 0.77
254 0.78
255 0.77
256 0.74
257 0.7
258 0.66
259 0.57
260 0.48
261 0.39
262 0.33
263 0.27
264 0.2
265 0.14
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.12
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.11
293 0.15
294 0.22
295 0.31
296 0.36
297 0.45
298 0.47
299 0.53
300 0.56
301 0.52
302 0.5
303 0.44
304 0.44
305 0.41
306 0.42
307 0.36
308 0.33
309 0.32
310 0.26
311 0.24
312 0.19
313 0.13
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.22
322 0.23
323 0.27
324 0.33
325 0.31
326 0.37
327 0.42
328 0.47
329 0.45
330 0.47
331 0.46
332 0.47
333 0.47
334 0.4
335 0.35
336 0.31
337 0.28
338 0.28
339 0.26
340 0.19
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.12
345 0.11
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.12
381 0.14
382 0.19
383 0.27
384 0.34
385 0.4
386 0.46
387 0.52
388 0.57
389 0.65
390 0.69
391 0.73
392 0.77
393 0.82
394 0.87
395 0.9
396 0.87
397 0.87
398 0.86
399 0.82
400 0.78
401 0.7
402 0.65
403 0.63
404 0.58
405 0.48
406 0.41
407 0.34
408 0.28
409 0.25
410 0.18
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.04
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.13
444 0.14
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.24
449 0.24
450 0.22
451 0.15
452 0.15
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.1
475 0.1
476 0.12
477 0.12
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.14
482 0.11
483 0.11
484 0.08
485 0.07
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.04
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.12
505 0.13
506 0.16
507 0.16
508 0.21
509 0.22
510 0.22
511 0.23
512 0.21
513 0.2
514 0.19
515 0.18
516 0.14
517 0.17
518 0.17
519 0.17
520 0.19
521 0.25
522 0.3
523 0.36
524 0.39
525 0.45
526 0.5
527 0.56
528 0.6
529 0.63
530 0.66
531 0.7
532 0.75
533 0.76
534 0.79
535 0.81
536 0.77
537 0.79
538 0.76
539 0.69
540 0.66
541 0.6
542 0.55
543 0.53
544 0.5
545 0.4
546 0.37
547 0.33
548 0.25
549 0.21
550 0.18
551 0.13
552 0.14
553 0.15
554 0.12
555 0.14
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.09
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.16
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.11
581 0.11
582 0.1
583 0.09
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.08
591 0.08
592 0.11
593 0.16
594 0.21
595 0.27
596 0.35
597 0.42
598 0.45
599 0.51
600 0.57
601 0.59
602 0.6
603 0.58
604 0.6
605 0.56
606 0.6
607 0.56
608 0.49
609 0.42
610 0.38
611 0.39
612 0.33
613 0.32
614 0.24
615 0.25
616 0.27
617 0.29
618 0.32
619 0.31
620 0.32
621 0.32
622 0.4
623 0.41
624 0.39
625 0.37
626 0.35
627 0.36
628 0.34
629 0.31
630 0.24
631 0.2
632 0.22
633 0.21
634 0.19
635 0.13
636 0.12
637 0.16
638 0.16
639 0.19
640 0.16
641 0.16
642 0.17
643 0.16
644 0.16
645 0.12
646 0.11
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.06
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.09
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.05
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.09
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.12
704 0.15
705 0.15
706 0.16
707 0.14
708 0.16
709 0.17
710 0.17
711 0.14
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.11
723 0.13
724 0.21
725 0.22
726 0.26
727 0.28
728 0.28
729 0.29
730 0.27
731 0.26
732 0.22
733 0.24
734 0.21
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.15
739 0.12
740 0.08
741 0.05
742 0.05
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.09
747 0.12
748 0.19
749 0.26
750 0.26
751 0.28
752 0.3
753 0.33
754 0.39
755 0.39
756 0.35
757 0.36
758 0.37
759 0.41
760 0.41
761 0.44
762 0.37
763 0.34
764 0.32
765 0.24
766 0.23
767 0.16
768 0.17
769 0.1
770 0.1
771 0.1
772 0.1
773 0.11
774 0.1
775 0.1
776 0.08
777 0.09
778 0.08
779 0.08
780 0.14
781 0.16
782 0.21
783 0.3
784 0.32
785 0.34
786 0.35
787 0.39
788 0.43
789 0.47
790 0.48
791 0.45
792 0.45
793 0.47
794 0.47
795 0.43
796 0.35
797 0.31
798 0.25
799 0.22
800 0.23
801 0.23
802 0.22
803 0.23
804 0.25
805 0.27
806 0.33
807 0.35
808 0.43
809 0.47
810 0.51
811 0.52
812 0.54
813 0.5
814 0.5
815 0.53
816 0.5
817 0.52
818 0.57
819 0.64
820 0.7
821 0.76
822 0.72
823 0.73
824 0.75
825 0.75
826 0.76
827 0.77
828 0.77
829 0.8
830 0.86
831 0.87
832 0.87
833 0.85
834 0.82
835 0.8
836 0.73
837 0.68
838 0.64
839 0.64
840 0.57
841 0.52
842 0.45
843 0.38
844 0.35
845 0.29
846 0.25
847 0.17
848 0.14
849 0.11
850 0.12
851 0.12
852 0.13
853 0.13
854 0.13
855 0.15
856 0.16
857 0.17
858 0.22
859 0.23
860 0.28
861 0.31
862 0.32
863 0.32
864 0.35
865 0.41
866 0.42
867 0.49
868 0.53
869 0.61
870 0.69
871 0.74
872 0.81
873 0.83
874 0.81
875 0.82
876 0.81
877 0.8
878 0.8
879 0.79
880 0.75
881 0.71
882 0.66
883 0.61
884 0.59
885 0.52
886 0.43
887 0.39
888 0.4
889 0.45
890 0.5
891 0.54
892 0.54
893 0.59
894 0.68
895 0.74
896 0.76
897 0.73
898 0.76
899 0.71
900 0.73
901 0.73
902 0.74
903 0.75
904 0.72
905 0.71
906 0.72
907 0.7
908 0.64
909 0.66
910 0.65
911 0.63
912 0.67
913 0.67
914 0.66
915 0.73
916 0.8
917 0.81
918 0.82
919 0.81
920 0.82
921 0.85
922 0.86
923 0.88
924 0.88
925 0.89