Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HHV6

Protein Details
Accession U5HHV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-440SLRQATARSKKQKKVVDTRASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-443SKKQKKVVDTRASKGRK
Subcellular Location(s) nucl 16cyto_nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025160  AATF  
IPR039223  AATF/Bfr2  
IPR012617  AATF_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF13339  AATF-Che1  
PF08164  TRAUB  
Amino Acid Sequences MSKRLTLADQLAQIAEPAPQDFDPEDSYATYANERNKGEQAADLEAGRAEYLPVGPGGLRKKGEALVDSKYDGKKGSRRTMFGGEEEEDEGHNEDDEDEDSEQDDDGGDDFDDLVGSEDSHEFASADQDDNDDDDEGEHLAPIASTSNKQAPPSALKTSTKSSITKGKSADERAMISQLRTAAHADIEKGIDVKKQFSFCDSVLESRIKLQKAVTAINVLPRPANAEMYYQQVEEERERARLEVEALNEELFKLRSTMLKGKEQIQIQLPTNLGQSRKRHRNPDSAQEYLAATVKDLAAIETALEPFLRTTITKWSDKVLAASGLALGKDKKFKAVNQNAMAQIDHALGPLERERLVKRTRLRRTTDRAVVGQADLGTLEGEKTPVDEEVFDDGDFYQQLLRDVIESRMLDLDDPTLESLRQATARSKKQKKVVDTRASKGRKIRYHVHDKLQNFMVPIEAGGWHEEKVDELFASLLGRSFPQVKSNDEEASKVSTGRSGATASEHVDAGSLRIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.12
4 0.11
5 0.13
6 0.12
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.18
11 0.19
12 0.19
13 0.17
14 0.18
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.2
19 0.25
20 0.31
21 0.33
22 0.36
23 0.38
24 0.39
25 0.36
26 0.35
27 0.31
28 0.28
29 0.27
30 0.23
31 0.2
32 0.18
33 0.17
34 0.14
35 0.11
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.13
44 0.18
45 0.23
46 0.24
47 0.23
48 0.26
49 0.29
50 0.32
51 0.3
52 0.29
53 0.27
54 0.29
55 0.3
56 0.32
57 0.3
58 0.29
59 0.28
60 0.32
61 0.35
62 0.42
63 0.5
64 0.51
65 0.53
66 0.57
67 0.61
68 0.57
69 0.52
70 0.47
71 0.38
72 0.33
73 0.31
74 0.26
75 0.19
76 0.17
77 0.16
78 0.12
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.18
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.24
139 0.3
140 0.34
141 0.35
142 0.33
143 0.34
144 0.37
145 0.39
146 0.4
147 0.37
148 0.34
149 0.33
150 0.37
151 0.38
152 0.39
153 0.37
154 0.38
155 0.4
156 0.41
157 0.41
158 0.34
159 0.32
160 0.28
161 0.31
162 0.26
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.19
185 0.22
186 0.19
187 0.23
188 0.21
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.21
194 0.26
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.22
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.19
205 0.2
206 0.17
207 0.15
208 0.13
209 0.16
210 0.14
211 0.15
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.13
222 0.15
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.12
244 0.18
245 0.21
246 0.26
247 0.27
248 0.31
249 0.35
250 0.33
251 0.32
252 0.3
253 0.3
254 0.26
255 0.27
256 0.23
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.17
261 0.2
262 0.26
263 0.33
264 0.44
265 0.48
266 0.56
267 0.6
268 0.68
269 0.67
270 0.7
271 0.66
272 0.56
273 0.51
274 0.43
275 0.37
276 0.27
277 0.25
278 0.14
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.15
299 0.2
300 0.21
301 0.22
302 0.24
303 0.26
304 0.26
305 0.26
306 0.19
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.15
317 0.15
318 0.2
319 0.22
320 0.27
321 0.37
322 0.45
323 0.52
324 0.49
325 0.53
326 0.49
327 0.47
328 0.42
329 0.31
330 0.23
331 0.15
332 0.12
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.13
341 0.15
342 0.21
343 0.25
344 0.31
345 0.38
346 0.47
347 0.56
348 0.62
349 0.68
350 0.7
351 0.75
352 0.77
353 0.76
354 0.69
355 0.6
356 0.54
357 0.47
358 0.38
359 0.3
360 0.21
361 0.14
362 0.1
363 0.09
364 0.06
365 0.05
366 0.06
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.09
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.12
391 0.13
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.14
410 0.21
411 0.3
412 0.4
413 0.51
414 0.59
415 0.64
416 0.72
417 0.78
418 0.79
419 0.81
420 0.82
421 0.82
422 0.79
423 0.78
424 0.8
425 0.76
426 0.71
427 0.68
428 0.67
429 0.64
430 0.64
431 0.67
432 0.67
433 0.74
434 0.76
435 0.78
436 0.76
437 0.69
438 0.68
439 0.62
440 0.54
441 0.44
442 0.37
443 0.28
444 0.21
445 0.2
446 0.14
447 0.11
448 0.1
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.11
467 0.15
468 0.16
469 0.23
470 0.25
471 0.29
472 0.35
473 0.39
474 0.41
475 0.38
476 0.38
477 0.33
478 0.36
479 0.32
480 0.26
481 0.23
482 0.21
483 0.21
484 0.2
485 0.2
486 0.16
487 0.16
488 0.19
489 0.2
490 0.2
491 0.21
492 0.19
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.14