FuNGI

U5HF02

Protein Details

Accession

U5HF02

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-111	LREVLGRRREEEKRRRKERRGSWVGSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
83-105	DRLREVLGRRREEEKRRRKERRG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR014906 PRP4-like IPR036285 PRP4-like_sf IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
Pfam	View protein in Pfam PF08799 PRP4 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSNSNTNPTPNSLDFDTLESIPFDLSDVNESHPETALLLAELDRKKSNRSLYVPTNDLEVRNKLRLVGEPVCLFGERAEDRRDRLREVLGRRREEEKRRRKERRGSWVGSSGESSDEEEREGSQDGEEHEEEEEFYTEGSIELKEARRRIAQYSLPRAQSRIQAQRLEANVKLGRLMDVRRAVFGQLKQFTNLGSQIGDTRPLGPLKFSPDGTILLTSSWTGTAKLWSVPSCKEVRTLKAHKERIGGVAWHSSATIGQSTASVNFATSGADKEIKLWNLENTESLATLTGHSARVSRIAFHPSGEYLGSASYDGTFRLWSVETSTELLLQEGHSKEVYSLAFQPDGSLACTGGLDAIGRVWDLRSGRSAMVLDGHVKDVLSMDFAPNGHQIVSGSNDDTIRVWDLRALKSVYTIPAHKSAVAEVAFFKTGASQTGQRKILPRGFKTLGVFDWNEEANKDVKGPNEGEQDIADVPLNGLYLVSGGYDGTVKIWSADDWQLVKTLTADSEGKVMGVDVSPDARFIASSEYSRTFKLWSTPEVDLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.31
4	0.24
5	0.24
6	0.2
7	0.18
8	0.15
9	0.13
10	0.11
11	0.08
12	0.09
13	0.12
14	0.12
15	0.15
16	0.18
17	0.19
18	0.19
19	0.19
20	0.18
21	0.15
22	0.14
23	0.12
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.16
28	0.17
29	0.2
30	0.25
31	0.26
32	0.31
33	0.38
34	0.45
35	0.46
36	0.5
37	0.55
38	0.59
39	0.64
40	0.62
41	0.55
42	0.52
43	0.45
44	0.42
45	0.38
46	0.36
47	0.34
48	0.35
49	0.35
50	0.32
51	0.33
52	0.34
53	0.37
54	0.34
55	0.34
56	0.31
57	0.32
58	0.31
59	0.29
60	0.25
61	0.17
62	0.2
63	0.18
64	0.22
65	0.27
66	0.28
67	0.32
68	0.41
69	0.43
70	0.4
71	0.41
72	0.45
73	0.46
74	0.53
75	0.59
76	0.59
77	0.61
78	0.6
79	0.65
80	0.66
81	0.69
82	0.71
83	0.72
84	0.74
85	0.81
86	0.88
87	0.9
88	0.92
89	0.91
90	0.91
91	0.9
92	0.84
93	0.78
94	0.75
95	0.67
96	0.57
97	0.48
98	0.37
99	0.28
100	0.24
101	0.21
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.13
106	0.13
107	0.13
108	0.14
109	0.11
110	0.09
111	0.11
112	0.12
113	0.16
114	0.16
115	0.14
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.13
120	0.12
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.1
130	0.15
131	0.2
132	0.21
133	0.25
134	0.29
135	0.31
136	0.34
137	0.37
138	0.39
139	0.43
140	0.51
141	0.53
142	0.53
143	0.52
144	0.5
145	0.46
146	0.46
147	0.45
148	0.45
149	0.44
150	0.42
151	0.43
152	0.46
153	0.46
154	0.42
155	0.35
156	0.31
157	0.27
158	0.24
159	0.24
160	0.19
161	0.18
162	0.17
163	0.18
164	0.18
165	0.22
166	0.23
167	0.23
168	0.23
169	0.23
170	0.25
171	0.26
172	0.28
173	0.27
174	0.27
175	0.28
176	0.27
177	0.26
178	0.24
179	0.22
180	0.15
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.13
189	0.14
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.18
194	0.2
195	0.2
196	0.19
197	0.19
198	0.2
199	0.19
200	0.18
201	0.12
202	0.1
203	0.1
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.1
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.15
217	0.19
218	0.2
219	0.19
220	0.24
221	0.25
222	0.28
223	0.35
224	0.39
225	0.45
226	0.53
227	0.56
228	0.53
229	0.53
230	0.49
231	0.42
232	0.38
233	0.29
234	0.21
235	0.19
236	0.16
237	0.13
238	0.12
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.1
260	0.13
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.15
266	0.15
267	0.13
268	0.12
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.17
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.14
290	0.15
291	0.13
292	0.11
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.09
308	0.1
309	0.1
310	0.12
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.09
316	0.08
317	0.12
318	0.11
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.14
324	0.13
325	0.1
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.11
332	0.12
333	0.11
334	0.09
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.03
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.13
353	0.13
354	0.15
355	0.15
356	0.12
357	0.13
358	0.13
359	0.13
360	0.12
361	0.13
362	0.12
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.13
391	0.18
392	0.19
393	0.23
394	0.22
395	0.2
396	0.22
397	0.23
398	0.23
399	0.22
400	0.23
401	0.22
402	0.26
403	0.27
404	0.25
405	0.24
406	0.21
407	0.23
408	0.21
409	0.18
410	0.14
411	0.16
412	0.15
413	0.15
414	0.14
415	0.11
416	0.11
417	0.12
418	0.14
419	0.18
420	0.24
421	0.33
422	0.35
423	0.36
424	0.4
425	0.46
426	0.51
427	0.52
428	0.49
429	0.49
430	0.5
431	0.51
432	0.49
433	0.44
434	0.38
435	0.34
436	0.32
437	0.25
438	0.25
439	0.22
440	0.2
441	0.17
442	0.18
443	0.15
444	0.15
445	0.16
446	0.15
447	0.16
448	0.2
449	0.22
450	0.26
451	0.31
452	0.31
453	0.29
454	0.27
455	0.27
456	0.23
457	0.21
458	0.15
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.13
481	0.16
482	0.19
483	0.2
484	0.21
485	0.22
486	0.22
487	0.22
488	0.18
489	0.17
490	0.13
491	0.16
492	0.16
493	0.14
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.13
498	0.13
499	0.1
500	0.09
501	0.1
502	0.08
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.15
511	0.16
512	0.18
513	0.23
514	0.27
515	0.29
516	0.3
517	0.31
518	0.27
519	0.27
520	0.33
521	0.33
522	0.32
523	0.36

U5HF02

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer