Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HB48

Protein Details
Accession U5HB48    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
487-511LVGTNKRPNGKRVKRGRGRGEEEEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
491-505NKRPNGKRVKRGRGR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013893  RNase_P_Rpp40  
Gene Ontology GO:0030677  C:ribonuclease P complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF08584  Ribonuc_P_40  
Amino Acid Sequences MNWAVLSLTSASANNLKTIGRKGEPGDRDKVRLLSLTALQRRTAGSPSYDPHQPRSTTMNGHHQKRSHRAGLAAEKSYYSSGTTTTTLHDNDDDDDDDSKGLHSKQQSKLAHALLRLPSIDELEIIHPLGAALPLELEQIIHQQAYFYHLTQLDLSHLLQPQFMNDYIRKGSLLAVSIPTQSKDDAEGDVVAIDGRGRLILNVSKHTYETLGLTGRKSRQLASATRQRFVIELPLSSPSNVCGKSGFERIKSHLRNWPTRSRTDLFTQLDGVASFERSGKEGGKRWDVLMCFVGEDGSLQPIDFPPSLLEAGTRIKRCTANLTKSTTKTVLSPKDCISPPFGSSEQTPSVNKKRRKLMTPSGVPTKRFEERTSTLAKEVEEGTRGMREWIGRARLGDAGSRGLEEEGEEEEEEEEGRVVVDMTVMRWTGFFHPFAMKRVLEALLEAQASTIPRTSTPSSTSPPTIFSLLTTLRHPFSHFIKWGKEPLVGTNKRPNGKRVKRGRGRGEEEEASSEAGGGVDLGEGGVTGVEIWFGGRKERSEKDDQVGWSLWEWQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.19
4 0.22
5 0.27
6 0.32
7 0.29
8 0.34
9 0.37
10 0.45
11 0.51
12 0.52
13 0.55
14 0.52
15 0.54
16 0.54
17 0.52
18 0.45
19 0.39
20 0.35
21 0.3
22 0.32
23 0.38
24 0.4
25 0.39
26 0.38
27 0.37
28 0.38
29 0.36
30 0.34
31 0.27
32 0.26
33 0.29
34 0.31
35 0.33
36 0.39
37 0.39
38 0.42
39 0.46
40 0.43
41 0.41
42 0.44
43 0.45
44 0.44
45 0.47
46 0.51
47 0.53
48 0.58
49 0.62
50 0.61
51 0.64
52 0.67
53 0.7
54 0.66
55 0.6
56 0.56
57 0.57
58 0.62
59 0.59
60 0.52
61 0.44
62 0.38
63 0.36
64 0.34
65 0.27
66 0.18
67 0.13
68 0.12
69 0.14
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.2
80 0.19
81 0.16
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.23
91 0.31
92 0.37
93 0.47
94 0.48
95 0.49
96 0.55
97 0.55
98 0.51
99 0.43
100 0.42
101 0.35
102 0.35
103 0.3
104 0.25
105 0.2
106 0.18
107 0.17
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.15
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.06
187 0.1
188 0.12
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.19
202 0.2
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.24
207 0.28
208 0.32
209 0.34
210 0.42
211 0.4
212 0.4
213 0.39
214 0.34
215 0.29
216 0.25
217 0.25
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.11
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.16
232 0.23
233 0.24
234 0.23
235 0.25
236 0.29
237 0.38
238 0.38
239 0.39
240 0.38
241 0.41
242 0.46
243 0.49
244 0.55
245 0.49
246 0.49
247 0.51
248 0.48
249 0.44
250 0.4
251 0.42
252 0.34
253 0.31
254 0.29
255 0.23
256 0.21
257 0.18
258 0.16
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.14
268 0.18
269 0.22
270 0.25
271 0.25
272 0.25
273 0.27
274 0.24
275 0.22
276 0.19
277 0.15
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.12
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.2
303 0.21
304 0.22
305 0.3
306 0.33
307 0.36
308 0.4
309 0.46
310 0.47
311 0.48
312 0.5
313 0.42
314 0.34
315 0.31
316 0.34
317 0.36
318 0.34
319 0.35
320 0.34
321 0.38
322 0.38
323 0.35
324 0.33
325 0.26
326 0.24
327 0.25
328 0.24
329 0.19
330 0.2
331 0.23
332 0.2
333 0.21
334 0.22
335 0.25
336 0.34
337 0.42
338 0.47
339 0.5
340 0.58
341 0.62
342 0.67
343 0.69
344 0.7
345 0.7
346 0.71
347 0.69
348 0.7
349 0.67
350 0.61
351 0.55
352 0.5
353 0.45
354 0.41
355 0.37
356 0.35
357 0.34
358 0.37
359 0.39
360 0.35
361 0.32
362 0.3
363 0.29
364 0.23
365 0.21
366 0.18
367 0.15
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.14
376 0.19
377 0.21
378 0.21
379 0.21
380 0.22
381 0.22
382 0.22
383 0.21
384 0.16
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.1
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.17
419 0.24
420 0.26
421 0.29
422 0.32
423 0.28
424 0.26
425 0.27
426 0.26
427 0.19
428 0.18
429 0.16
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.1
440 0.16
441 0.19
442 0.21
443 0.25
444 0.29
445 0.32
446 0.35
447 0.38
448 0.34
449 0.33
450 0.33
451 0.3
452 0.25
453 0.21
454 0.22
455 0.21
456 0.22
457 0.21
458 0.22
459 0.22
460 0.23
461 0.25
462 0.24
463 0.27
464 0.33
465 0.37
466 0.39
467 0.42
468 0.45
469 0.49
470 0.47
471 0.46
472 0.38
473 0.41
474 0.47
475 0.45
476 0.47
477 0.51
478 0.56
479 0.6
480 0.62
481 0.63
482 0.63
483 0.7
484 0.74
485 0.76
486 0.8
487 0.82
488 0.89
489 0.91
490 0.9
491 0.87
492 0.84
493 0.8
494 0.72
495 0.64
496 0.57
497 0.47
498 0.37
499 0.29
500 0.22
501 0.15
502 0.11
503 0.09
504 0.05
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.04
519 0.08
520 0.09
521 0.15
522 0.18
523 0.23
524 0.31
525 0.38
526 0.44
527 0.5
528 0.55
529 0.55
530 0.58
531 0.56
532 0.53
533 0.48
534 0.42