Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HA83

Protein Details
Accession U5HA83    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-384METPKSNPLLKKKKKRDLGQAAIAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-303RKRRRE
370-375KKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPSASSPPPPSQSPATVSTPTASASVSTPKPGAGRTGGGLQLPGALGNKGKTKANPSAETSRNNTTRDTLKEPHETTTNTNTTTGKFEHEPSTNVQHLMDAVGASGVDINAEEDSLRQHQPVRSHFNTTSTSQQPNPSTTHTHTHTHTHTATTAASSAPSTSTLTDLDLRIHSQSFIDPQVLADVVRKIAAEYSLKSLEGQTIPLIALACRTRLMDLISNSIRVRDHRLNANHLRKPPFDNQLKRRRRDQALGQEYRVHEEEDMLQEGKKEPVWDAVVYDEPEKALWVLEKVDREEERKRRRERVLRDEKEQEEKELREAVEASERAREEQERDDIAISTPGVDGTDQTMTNTLASTGGMETPKSNPLLKKKKKRDLGQAAIAKNLSGDVQKRLTDQIAMRSLGGRSFSWLSGAGGAAAGASNMSTSNRPHNQSAMGTPTLGTTPTARSSSLNPFPSSLNRLTTIPSLHDANRQKLDAEETWRQGAHVVELKDILFALDNQRGMGLGKGAGKVASLKARAGVVRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.4
4 0.38
5 0.35
6 0.3
7 0.27
8 0.23
9 0.17
10 0.13
11 0.13
12 0.2
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.23
17 0.25
18 0.25
19 0.27
20 0.23
21 0.24
22 0.23
23 0.27
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.14
35 0.2
36 0.22
37 0.26
38 0.29
39 0.35
40 0.43
41 0.49
42 0.51
43 0.52
44 0.58
45 0.6
46 0.61
47 0.59
48 0.59
49 0.56
50 0.53
51 0.48
52 0.44
53 0.45
54 0.45
55 0.47
56 0.44
57 0.45
58 0.52
59 0.52
60 0.51
61 0.49
62 0.45
63 0.43
64 0.47
65 0.44
66 0.36
67 0.37
68 0.35
69 0.31
70 0.33
71 0.29
72 0.25
73 0.24
74 0.26
75 0.3
76 0.31
77 0.32
78 0.32
79 0.38
80 0.35
81 0.34
82 0.3
83 0.24
84 0.22
85 0.2
86 0.16
87 0.09
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.18
106 0.22
107 0.29
108 0.37
109 0.43
110 0.42
111 0.48
112 0.47
113 0.47
114 0.47
115 0.43
116 0.43
117 0.38
118 0.39
119 0.35
120 0.41
121 0.39
122 0.38
123 0.39
124 0.35
125 0.36
126 0.35
127 0.39
128 0.37
129 0.38
130 0.37
131 0.41
132 0.4
133 0.4
134 0.37
135 0.32
136 0.29
137 0.26
138 0.24
139 0.18
140 0.17
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.09
193 0.06
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.14
204 0.19
205 0.19
206 0.21
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.17
211 0.23
212 0.23
213 0.26
214 0.31
215 0.34
216 0.41
217 0.5
218 0.57
219 0.54
220 0.54
221 0.55
222 0.49
223 0.52
224 0.49
225 0.49
226 0.49
227 0.54
228 0.58
229 0.65
230 0.72
231 0.7
232 0.72
233 0.71
234 0.67
235 0.64
236 0.63
237 0.63
238 0.64
239 0.62
240 0.56
241 0.52
242 0.47
243 0.43
244 0.35
245 0.25
246 0.15
247 0.13
248 0.14
249 0.11
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.09
277 0.11
278 0.11
279 0.15
280 0.16
281 0.2
282 0.28
283 0.37
284 0.45
285 0.53
286 0.58
287 0.62
288 0.71
289 0.76
290 0.77
291 0.79
292 0.8
293 0.75
294 0.74
295 0.73
296 0.66
297 0.64
298 0.55
299 0.47
300 0.4
301 0.37
302 0.32
303 0.29
304 0.26
305 0.19
306 0.19
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.19
318 0.22
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.18
323 0.17
324 0.15
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.06
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.14
351 0.15
352 0.19
353 0.22
354 0.32
355 0.44
356 0.53
357 0.62
358 0.7
359 0.78
360 0.84
361 0.87
362 0.87
363 0.87
364 0.84
365 0.82
366 0.78
367 0.69
368 0.61
369 0.53
370 0.42
371 0.31
372 0.23
373 0.15
374 0.11
375 0.13
376 0.15
377 0.18
378 0.19
379 0.21
380 0.23
381 0.23
382 0.24
383 0.24
384 0.26
385 0.27
386 0.27
387 0.26
388 0.25
389 0.25
390 0.22
391 0.22
392 0.15
393 0.15
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.1
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.08
413 0.1
414 0.2
415 0.27
416 0.31
417 0.33
418 0.35
419 0.37
420 0.37
421 0.38
422 0.34
423 0.29
424 0.25
425 0.23
426 0.21
427 0.18
428 0.16
429 0.14
430 0.1
431 0.13
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.24
437 0.32
438 0.38
439 0.39
440 0.36
441 0.36
442 0.38
443 0.41
444 0.43
445 0.37
446 0.32
447 0.3
448 0.29
449 0.31
450 0.31
451 0.28
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.25
456 0.33
457 0.37
458 0.41
459 0.44
460 0.42
461 0.4
462 0.38
463 0.42
464 0.37
465 0.39
466 0.38
467 0.37
468 0.39
469 0.38
470 0.36
471 0.32
472 0.29
473 0.27
474 0.26
475 0.24
476 0.22
477 0.24
478 0.24
479 0.21
480 0.2
481 0.15
482 0.1
483 0.11
484 0.15
485 0.18
486 0.18
487 0.18
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.17
492 0.13
493 0.12
494 0.15
495 0.16
496 0.17
497 0.16
498 0.16
499 0.18
500 0.21
501 0.25
502 0.24
503 0.24
504 0.25
505 0.29
506 0.32