Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HGC1

Protein Details
Accession U5HGC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-176GTASIRRSERERRDKQRGEDVCHydrophilic
242-264YPLTCTRRPVPRRTNRAAPKINYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito 4, plas 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PF02373  JmjC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MSPTPPPIAAAAAAAAAAAAMTDERDSSPLSTLSELDAASPPVPATSSNATTSSIGPSATGTSATTSATTSATTSTTTSSSSTTRLTRSHSHSPSQPSRTPPPAAAAATNEPSRRSSLRSSISTPIPTPVPTPTPATSQPSTSVPRLPKVPSRHGTASIRRSERERRDKQRGEDVCLVCTPPGTVLTAAQEKANQDKVWIQCEHCNAWYHWHCINLNTGDSPEDFDQWYCPPCIKITLATRYPLTCTRRPVPRRTNRAAPKINYANLDAHLPADHLRWQRVIATRKILPANFPKLRPERLTEEWLFREGTWSEPIIVESPRGLGMQMPDPSTSISAIADEIGGDHPIEALDVAAQDRDRTIKTLRQWADYFENPRRDKVRNVISLEVGSTPFGEKIVAPEMVRRLDWVDNIWPKDCRDEGQYPQVQKYCLMSVAESWTDWHIDFAGSSVFYHILRGGKVFYFIRPTKENLKAYETWSGNTDRQEANWLGDHVDAVYRVELVPGNTMFIPSGWIHAVETPSDSLVIGGNFVHSLNIETQLEVYRIELATKVPKKFRFPHFVTLLWHVANHYTARLNKVLASSASMRTWPVELRSRRVLLGLKQASEFLIEQTTRWAKGTNELSRERRRAAIHNVPNTYIKNPNELSREFRQVVLRALGEPMDRLCELSNDAMSLTWVSPEELRAEAMARDMVSTPKGKAVNGRGSAEGLTPMMNGHGDARMKRKASDAVSFQVTAAMMDPHASGTRSKKPRITPSGMTAVPNDAPTILENTTPYARRPMRTQQMMDPKRAEVGLQLATVNESSNTKTIVKRWEEGGRVFIDVRKMVTTIERVEFGVPEEEIVAAQQTLGQRGTEGAEGADGVQGEQEIQVDGTAGSSGAGRQDVRQTTVQHLPMEVDQAPMPTVPVASASTSVLVSAPVPVSAPVPVSAPVPVSARVPVSAPVPTPAPAPKAAPIRPPIVLAEAPAHPFPTWDPYHPTAYKLSTDPYVRLEQMSRIINTYHDPHLIKATGLNSAFMGSDGTSDADDWTDEKFFDLVWSMRPVPKEGRASESDSGTRRKSHGSQSKSRTSSGKMGVALKKDTQPHGPTSVPTSSLTSASTAASTSASTSASGSTSQAPILETGPAATSPSLQRPDSADAPMASPHLKSIQSITSSPVPIMSYIQQNQPQLDSVAPRSTVLPAAQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.04
4 0.03
5 0.03
6 0.03
7 0.03
8 0.04
9 0.04
10 0.06
11 0.07
12 0.08
13 0.1
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.15
33 0.18
34 0.21
35 0.23
36 0.24
37 0.26
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.21
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.23
70 0.25
71 0.28
72 0.3
73 0.35
74 0.41
75 0.47
76 0.54
77 0.55
78 0.57
79 0.6
80 0.66
81 0.7
82 0.69
83 0.67
84 0.63
85 0.66
86 0.67
87 0.63
88 0.55
89 0.5
90 0.47
91 0.43
92 0.38
93 0.34
94 0.32
95 0.33
96 0.35
97 0.32
98 0.29
99 0.29
100 0.32
101 0.3
102 0.31
103 0.33
104 0.38
105 0.43
106 0.46
107 0.49
108 0.5
109 0.53
110 0.51
111 0.46
112 0.4
113 0.35
114 0.31
115 0.28
116 0.27
117 0.26
118 0.24
119 0.29
120 0.27
121 0.31
122 0.34
123 0.39
124 0.36
125 0.34
126 0.35
127 0.35
128 0.38
129 0.35
130 0.38
131 0.36
132 0.39
133 0.41
134 0.43
135 0.46
136 0.49
137 0.57
138 0.54
139 0.58
140 0.58
141 0.6
142 0.63
143 0.64
144 0.65
145 0.64
146 0.63
147 0.58
148 0.61
149 0.64
150 0.67
151 0.69
152 0.71
153 0.72
154 0.79
155 0.84
156 0.84
157 0.84
158 0.77
159 0.74
160 0.73
161 0.64
162 0.55
163 0.48
164 0.43
165 0.32
166 0.28
167 0.2
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.15
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.25
180 0.29
181 0.24
182 0.22
183 0.28
184 0.3
185 0.34
186 0.35
187 0.33
188 0.33
189 0.37
190 0.39
191 0.36
192 0.36
193 0.31
194 0.38
195 0.4
196 0.39
197 0.37
198 0.39
199 0.37
200 0.34
201 0.4
202 0.33
203 0.3
204 0.26
205 0.25
206 0.21
207 0.2
208 0.22
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.2
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.19
222 0.23
223 0.28
224 0.36
225 0.37
226 0.38
227 0.39
228 0.36
229 0.39
230 0.4
231 0.4
232 0.36
233 0.41
234 0.45
235 0.54
236 0.6
237 0.67
238 0.7
239 0.74
240 0.79
241 0.79
242 0.82
243 0.81
244 0.85
245 0.83
246 0.74
247 0.73
248 0.69
249 0.65
250 0.57
251 0.5
252 0.41
253 0.33
254 0.32
255 0.23
256 0.17
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.17
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.21
266 0.26
267 0.33
268 0.37
269 0.35
270 0.38
271 0.39
272 0.43
273 0.47
274 0.42
275 0.4
276 0.42
277 0.48
278 0.46
279 0.45
280 0.48
281 0.5
282 0.55
283 0.52
284 0.49
285 0.46
286 0.46
287 0.52
288 0.46
289 0.46
290 0.42
291 0.41
292 0.36
293 0.29
294 0.28
295 0.21
296 0.2
297 0.17
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.17
319 0.15
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.12
347 0.15
348 0.19
349 0.24
350 0.34
351 0.35
352 0.39
353 0.38
354 0.4
355 0.42
356 0.42
357 0.44
358 0.41
359 0.49
360 0.44
361 0.49
362 0.49
363 0.46
364 0.46
365 0.48
366 0.5
367 0.47
368 0.5
369 0.46
370 0.43
371 0.4
372 0.36
373 0.28
374 0.19
375 0.13
376 0.1
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.08
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.14
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.16
395 0.2
396 0.24
397 0.26
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.29
402 0.27
403 0.22
404 0.23
405 0.26
406 0.28
407 0.36
408 0.39
409 0.37
410 0.41
411 0.41
412 0.35
413 0.31
414 0.29
415 0.21
416 0.19
417 0.17
418 0.13
419 0.12
420 0.15
421 0.14
422 0.12
423 0.12
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.13
446 0.13
447 0.12
448 0.19
449 0.2
450 0.24
451 0.25
452 0.28
453 0.33
454 0.4
455 0.42
456 0.36
457 0.4
458 0.37
459 0.38
460 0.42
461 0.35
462 0.28
463 0.27
464 0.28
465 0.25
466 0.24
467 0.25
468 0.18
469 0.17
470 0.21
471 0.2
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.08
492 0.09
493 0.08
494 0.07
495 0.09
496 0.07
497 0.08
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.08
504 0.09
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.05
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.16
535 0.21
536 0.24
537 0.28
538 0.32
539 0.38
540 0.45
541 0.51
542 0.52
543 0.51
544 0.56
545 0.53
546 0.51
547 0.47
548 0.43
549 0.38
550 0.28
551 0.24
552 0.16
553 0.14
554 0.13
555 0.11
556 0.08
557 0.1
558 0.11
559 0.13
560 0.14
561 0.14
562 0.14
563 0.14
564 0.14
565 0.11
566 0.13
567 0.12
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.12
574 0.1
575 0.11
576 0.18
577 0.2
578 0.24
579 0.27
580 0.28
581 0.27
582 0.29
583 0.27
584 0.22
585 0.29
586 0.26
587 0.23
588 0.22
589 0.22
590 0.2
591 0.19
592 0.17
593 0.08
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.12
598 0.13
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.12
603 0.19
604 0.26
605 0.26
606 0.3
607 0.35
608 0.42
609 0.47
610 0.49
611 0.44
612 0.41
613 0.39
614 0.39
615 0.42
616 0.45
617 0.45
618 0.47
619 0.47
620 0.44
621 0.44
622 0.4
623 0.34
624 0.31
625 0.25
626 0.24
627 0.24
628 0.27
629 0.29
630 0.29
631 0.32
632 0.29
633 0.34
634 0.3
635 0.31
636 0.3
637 0.27
638 0.28
639 0.24
640 0.2
641 0.15
642 0.14
643 0.13
644 0.11
645 0.1
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.06
664 0.06
665 0.07
666 0.08
667 0.07
668 0.08
669 0.07
670 0.08
671 0.07
672 0.08
673 0.07
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.14
682 0.15
683 0.15
684 0.2
685 0.25
686 0.31
687 0.32
688 0.33
689 0.29
690 0.29
691 0.29
692 0.24
693 0.18
694 0.1
695 0.08
696 0.06
697 0.06
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.08
703 0.1
704 0.12
705 0.17
706 0.21
707 0.22
708 0.23
709 0.25
710 0.28
711 0.29
712 0.32
713 0.3
714 0.28
715 0.29
716 0.28
717 0.25
718 0.2
719 0.17
720 0.12
721 0.1
722 0.07
723 0.05
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.09
730 0.15
731 0.24
732 0.3
733 0.34
734 0.4
735 0.46
736 0.55
737 0.61
738 0.62
739 0.56
740 0.54
741 0.56
742 0.51
743 0.45
744 0.35
745 0.29
746 0.23
747 0.2
748 0.15
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.11
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.11
757 0.14
758 0.15
759 0.15
760 0.22
761 0.24
762 0.26
763 0.31
764 0.39
765 0.45
766 0.5
767 0.51
768 0.5
769 0.59
770 0.59
771 0.58
772 0.5
773 0.41
774 0.37
775 0.34
776 0.26
777 0.16
778 0.16
779 0.13
780 0.12
781 0.12
782 0.1
783 0.11
784 0.11
785 0.1
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.09
790 0.11
791 0.13
792 0.15
793 0.19
794 0.27
795 0.3
796 0.3
797 0.33
798 0.37
799 0.38
800 0.37
801 0.36
802 0.28
803 0.26
804 0.25
805 0.22
806 0.19
807 0.17
808 0.17
809 0.14
810 0.13
811 0.13
812 0.15
813 0.16
814 0.16
815 0.17
816 0.17
817 0.17
818 0.17
819 0.16
820 0.15
821 0.14
822 0.1
823 0.09
824 0.08
825 0.08
826 0.07
827 0.07
828 0.06
829 0.04
830 0.04
831 0.06
832 0.06
833 0.09
834 0.09
835 0.09
836 0.09
837 0.1
838 0.11
839 0.09
840 0.09
841 0.07
842 0.06
843 0.06
844 0.07
845 0.07
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.05
851 0.05
852 0.05
853 0.04
854 0.04
855 0.04
856 0.05
857 0.05
858 0.05
859 0.04
860 0.04
861 0.04
862 0.04
863 0.05
864 0.05
865 0.07
866 0.07
867 0.09
868 0.16
869 0.17
870 0.21
871 0.25
872 0.26
873 0.3
874 0.36
875 0.37
876 0.31
877 0.3
878 0.28
879 0.24
880 0.25
881 0.21
882 0.16
883 0.13
884 0.13
885 0.13
886 0.11
887 0.11
888 0.08
889 0.07
890 0.06
891 0.07
892 0.07
893 0.08
894 0.09
895 0.09
896 0.09
897 0.09
898 0.09
899 0.08
900 0.07
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.06
905 0.07
906 0.07
907 0.08
908 0.08
909 0.09
910 0.08
911 0.09
912 0.09
913 0.1
914 0.1
915 0.1
916 0.11
917 0.12
918 0.13
919 0.13
920 0.14
921 0.14
922 0.14
923 0.14
924 0.13
925 0.13
926 0.14
927 0.14
928 0.14
929 0.14
930 0.14
931 0.16
932 0.17
933 0.18
934 0.18
935 0.2
936 0.24
937 0.3
938 0.32
939 0.36
940 0.37
941 0.37
942 0.36
943 0.36
944 0.31
945 0.28
946 0.25
947 0.2
948 0.19
949 0.18
950 0.2
951 0.19
952 0.19
953 0.15
954 0.15
955 0.15
956 0.2
957 0.21
958 0.21
959 0.28
960 0.3
961 0.38
962 0.38
963 0.39
964 0.36
965 0.36
966 0.35
967 0.3
968 0.29
969 0.27
970 0.28
971 0.28
972 0.28
973 0.29
974 0.27
975 0.28
976 0.27
977 0.24
978 0.28
979 0.31
980 0.27
981 0.25
982 0.24
983 0.24
984 0.26
985 0.27
986 0.24
987 0.25
988 0.25
989 0.25
990 0.29
991 0.28
992 0.25
993 0.24
994 0.22
995 0.23
996 0.22
997 0.21
998 0.16
999 0.16
1000 0.16
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.07
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.08
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.09
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.09
1019 0.1
1020 0.13
1021 0.12
1022 0.15
1023 0.2
1024 0.21
1025 0.25
1026 0.26
1027 0.29
1028 0.31
1029 0.38
1030 0.42
1031 0.4
1032 0.43
1033 0.44
1034 0.48
1035 0.47
1036 0.46
1037 0.43
1038 0.4
1039 0.44
1040 0.41
1041 0.41
1042 0.37
1043 0.41
1044 0.43
1045 0.49
1046 0.54
1047 0.57
1048 0.64
1049 0.68
1050 0.76
1051 0.72
1052 0.7
1053 0.63
1054 0.59
1055 0.59
1056 0.54
1057 0.5
1058 0.44
1059 0.48
1060 0.5
1061 0.5
1062 0.48
1063 0.43
1064 0.43
1065 0.44
1066 0.44
1067 0.45
1068 0.44
1069 0.44
1070 0.45
1071 0.43
1072 0.39
1073 0.4
1074 0.38
1075 0.32
1076 0.29
1077 0.29
1078 0.25
1079 0.25
1080 0.24
1081 0.19
1082 0.18
1083 0.16
1084 0.15
1085 0.12
1086 0.11
1087 0.1
1088 0.1
1089 0.1
1090 0.1
1091 0.1
1092 0.1
1093 0.1
1094 0.11
1095 0.11
1096 0.12
1097 0.12
1098 0.14
1099 0.14
1100 0.14
1101 0.15
1102 0.14
1103 0.15
1104 0.15
1105 0.14
1106 0.11
1107 0.11
1108 0.11
1109 0.11
1110 0.11
1111 0.1
1112 0.13
1113 0.16
1114 0.23
1115 0.28
1116 0.27
1117 0.29
1118 0.32
1119 0.38
1120 0.38
1121 0.36
1122 0.32
1123 0.28
1124 0.29
1125 0.28
1126 0.26
1127 0.21
1128 0.18
1129 0.18
1130 0.19
1131 0.19
1132 0.19
1133 0.22
1134 0.25
1135 0.28
1136 0.29
1137 0.31
1138 0.32
1139 0.33
1140 0.32
1141 0.29
1142 0.24
1143 0.21
1144 0.24
1145 0.23
1146 0.25
1147 0.28
1148 0.35
1149 0.39
1150 0.41
1151 0.42
1152 0.4
1153 0.38
1154 0.31
1155 0.31
1156 0.28
1157 0.27
1158 0.29
1159 0.28
1160 0.27
1161 0.26
1162 0.27
1163 0.27