Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HCT1

Protein Details
Accession U5HCT1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-46TTEHQSLRARPGRRRPPRRSSSHVDALPHydrophilic
73-92RSPAQRQQRHLLHKRQAQARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-37ARPGRRRPPRR
Subcellular Location(s) nucl 17, plas 7, cyto 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Amino Acid Sequences MMTAERPPARSPSHCDQTTTEHQSLRARPGRRRPPRRSSSHVDALPRFQTLLLLVVLIASITSLAQASEVHHRSPAQRQQRHLLHKRQAQARTTPIAATTDAGPVPTTTPNVAPTTAPATTPAVTTTPTTQPSATTNDDVTTTTKKKKTHSSDTTTAAAVATTTMTTTTTTTTTSLSVAVAPSNTTAAAPLVVITVTSIVTNPDGSTSIAAVVNPAATADSATSRTTSGGSSASRTYAIIGGVLGSVVGLLLLLILLYKLAQHRGWGGDGRLGRFINKPFGAGPNGKEIKWPELQPDGQTVSTGLATLNPMGTRKTGGAGISMGEKDDEDEFLDNEEEELSGNGSWDEIKMPDGSVVRRPSTKCGGGGGAAIQRSVTGSMSSHYTVGSANGRESRTSHYDSYRSPSPAMLFHRPQSPQILYPANLHRAPSNPHLHGPYAMHPPPPAVFQSYPYPHPHPHPHPHPHAAQSALQGYPTLALAPVNHGPPAPPQSQPLPRSLMHRPSSINLFPLSTSPAPPSPLPSPSPTSGGSHSSHHYPSSPLEQGSVHPDRSNSNSSSSSHGSSSSSSAARKQQQRYQQQMEPAFLGHGQGFSADLYAPREGVERQLSVRNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.57
3 0.53
4 0.56
5 0.6
6 0.6
7 0.54
8 0.46
9 0.49
10 0.53
11 0.55
12 0.57
13 0.54
14 0.53
15 0.58
16 0.67
17 0.75
18 0.78
19 0.84
20 0.84
21 0.88
22 0.91
23 0.9
24 0.88
25 0.86
26 0.84
27 0.82
28 0.77
29 0.73
30 0.66
31 0.63
32 0.56
33 0.48
34 0.39
35 0.29
36 0.26
37 0.19
38 0.18
39 0.12
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.06
45 0.05
46 0.03
47 0.03
48 0.03
49 0.03
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.06
54 0.08
55 0.18
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.26
60 0.29
61 0.39
62 0.46
63 0.47
64 0.51
65 0.56
66 0.64
67 0.71
68 0.78
69 0.78
70 0.78
71 0.77
72 0.77
73 0.8
74 0.78
75 0.76
76 0.7
77 0.67
78 0.63
79 0.57
80 0.52
81 0.44
82 0.37
83 0.32
84 0.27
85 0.22
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.11
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.17
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.22
117 0.21
118 0.22
119 0.24
120 0.28
121 0.27
122 0.24
123 0.22
124 0.21
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.26
130 0.32
131 0.37
132 0.4
133 0.46
134 0.55
135 0.61
136 0.65
137 0.69
138 0.69
139 0.7
140 0.7
141 0.66
142 0.55
143 0.46
144 0.35
145 0.25
146 0.16
147 0.1
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.01
237 0.01
238 0.01
239 0.01
240 0.01
241 0.01
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.03
246 0.04
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.16
260 0.17
261 0.19
262 0.2
263 0.22
264 0.2
265 0.2
266 0.18
267 0.2
268 0.22
269 0.21
270 0.2
271 0.24
272 0.25
273 0.24
274 0.26
275 0.25
276 0.26
277 0.27
278 0.26
279 0.2
280 0.22
281 0.23
282 0.21
283 0.23
284 0.2
285 0.17
286 0.16
287 0.14
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.17
343 0.19
344 0.2
345 0.24
346 0.25
347 0.28
348 0.32
349 0.32
350 0.27
351 0.25
352 0.24
353 0.2
354 0.2
355 0.16
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.1
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.22
382 0.24
383 0.27
384 0.28
385 0.28
386 0.31
387 0.32
388 0.37
389 0.37
390 0.33
391 0.3
392 0.28
393 0.26
394 0.28
395 0.32
396 0.33
397 0.31
398 0.31
399 0.37
400 0.36
401 0.37
402 0.37
403 0.33
404 0.28
405 0.3
406 0.3
407 0.26
408 0.3
409 0.32
410 0.32
411 0.31
412 0.3
413 0.27
414 0.27
415 0.3
416 0.33
417 0.35
418 0.32
419 0.34
420 0.36
421 0.35
422 0.34
423 0.32
424 0.28
425 0.3
426 0.29
427 0.27
428 0.25
429 0.26
430 0.24
431 0.24
432 0.21
433 0.18
434 0.17
435 0.19
436 0.27
437 0.29
438 0.32
439 0.35
440 0.38
441 0.36
442 0.42
443 0.49
444 0.49
445 0.56
446 0.62
447 0.65
448 0.68
449 0.71
450 0.68
451 0.62
452 0.57
453 0.5
454 0.43
455 0.37
456 0.32
457 0.26
458 0.23
459 0.18
460 0.15
461 0.13
462 0.11
463 0.08
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.1
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.19
474 0.25
475 0.23
476 0.21
477 0.24
478 0.31
479 0.4
480 0.41
481 0.4
482 0.39
483 0.38
484 0.43
485 0.47
486 0.49
487 0.44
488 0.45
489 0.43
490 0.42
491 0.47
492 0.43
493 0.37
494 0.29
495 0.26
496 0.23
497 0.22
498 0.24
499 0.19
500 0.19
501 0.2
502 0.21
503 0.24
504 0.24
505 0.28
506 0.26
507 0.29
508 0.31
509 0.32
510 0.35
511 0.34
512 0.37
513 0.33
514 0.33
515 0.31
516 0.33
517 0.3
518 0.28
519 0.29
520 0.3
521 0.3
522 0.28
523 0.27
524 0.25
525 0.27
526 0.3
527 0.31
528 0.27
529 0.26
530 0.26
531 0.26
532 0.32
533 0.33
534 0.28
535 0.26
536 0.27
537 0.3
538 0.34
539 0.38
540 0.32
541 0.32
542 0.33
543 0.33
544 0.38
545 0.37
546 0.34
547 0.29
548 0.29
549 0.25
550 0.24
551 0.25
552 0.24
553 0.23
554 0.23
555 0.27
556 0.35
557 0.43
558 0.5
559 0.55
560 0.59
561 0.66
562 0.74
563 0.79
564 0.78
565 0.74
566 0.74
567 0.7
568 0.64
569 0.55
570 0.45
571 0.37
572 0.29
573 0.26
574 0.17
575 0.14
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.08
580 0.09
581 0.08
582 0.09
583 0.12
584 0.13
585 0.13
586 0.13
587 0.15
588 0.15
589 0.21
590 0.24
591 0.23
592 0.26