Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U5HCN8

Protein Details
Accession U5HCN8    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-515GIRPKAKKELQKRQRREQRELBasic
695-721VSGPGGRRDRKERKRAKKGKGRWVESDBasic
794-815LTSGPSRKLKTKSKASKPTWDGHydrophilic
826-846ENDRAKKSDFKRKRALARAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-43GNNRGGARGGGPPGGASRGGAANRGAAAGRGRGGGGG
380-405KKGPAPKLTKAQKRAGKKARRAGRLH
496-513IRPKAKKELQKRQRREQR
699-716GGRRDRKERKRAKKGKGR
831-856KKSDFKRKRALARAEANEAAPHKFKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS51061  R3H  
Amino Acid Sequences MAKGNRGNNRGGARGGGPPGGASRGGAANRGAAAGRGRGGGGGGASSLRRLQPREDMSELSFDYSSLTEEVSGYNLSPSFPAPKVPTRQPYPPPTPPNGGHSGYHTPKRGVGSSGGRDGRPSQRETNHHQKPISSFRGRGGAAGLGSHDTTTASIGFRPSIRGRGGIVGFTPGGHRPLLVPVTFVAASGLTPKMQGDLDVDEVPGELEEKVVEGHLVESVRDLDQRDESSPEDEESTSESDEQDEVGLELTERIVVEEKEKILVAEGEVGEIEEMEAAPSFVINLTASRVEDCLVPPTLVVPSDFVLGVSSNTAASREEVDSGSDEEEEETEQIVFHPTALTSSNPSSSAPRAARAEVSTPTTTKEAVAASEPMIQPHTKKGPAPKLTKAQKRAGKKARRAGRLHARSGNQHLLVEAESSDEDEQAVDEEDARQGREMFARMELNDDAEGMQVEEGGGNEGEDKGEEAPEPRVGDSDLEWGSDGPPEMETRSSAGIRPKAKKELQKRQRREQRELEKMQRLASGARSHVEKLLGGNRATDDHARNLLGETEEGDIDLEAARRFAEGLMGSSSGVQKTLDELVDEAREEQEDGQEGWRTTSGSEDDEDESGSESDESSSSGSSGGEEFDSNDELERDHMLGEADAAVDRAMAGAEAVMMDDASSHRDSSISSGAENDAIEAALLAGQTIRLSSVGVSGPGGRRDRKERKRAKKGKGRWVESDSSEEEDDEVRMFTGENTWADNDEDFIQELQDILDTNESLLLGSGRKNRKKLFKAVQNGNFDDIDLMLEDDVLLTSGPSRKLKTKSKASKPTWDGEFADELQAQWENDRAKKSDFKRKRALARAEANEAAPHKFKKGHVPPASFAGSSDVAVINLKMREFILHDLEQGSLSLPPMSKKSRVAVHLLSEAYGLNSKSVGKGKARFPVLVRTQKTTTYGVDERKIRAIISTAEGERMLGGAQYGGRAKGKQGGLWAALSGDGKKSSGAGGGGGGMGGKRHDEGAVVGQGADRLGEDNIGFALLKRMGWSEGMQIGRTGGISEPISARIKTNKSGLGSGYSVSRIEAQIMAVGSGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.27
4 0.23
5 0.2
6 0.21
7 0.21
8 0.18
9 0.14
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.17
19 0.14
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.12
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.13
35 0.16
36 0.22
37 0.24
38 0.29
39 0.37
40 0.43
41 0.48
42 0.48
43 0.47
44 0.43
45 0.45
46 0.41
47 0.34
48 0.28
49 0.21
50 0.19
51 0.16
52 0.16
53 0.12
54 0.12
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.09
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.17
67 0.17
68 0.23
69 0.26
70 0.34
71 0.41
72 0.49
73 0.56
74 0.57
75 0.66
76 0.69
77 0.72
78 0.73
79 0.76
80 0.74
81 0.71
82 0.72
83 0.66
84 0.63
85 0.6
86 0.54
87 0.45
88 0.44
89 0.47
90 0.46
91 0.51
92 0.48
93 0.43
94 0.44
95 0.47
96 0.44
97 0.37
98 0.37
99 0.38
100 0.39
101 0.46
102 0.45
103 0.41
104 0.41
105 0.44
106 0.46
107 0.43
108 0.44
109 0.44
110 0.49
111 0.56
112 0.63
113 0.68
114 0.68
115 0.7
116 0.65
117 0.62
118 0.61
119 0.64
120 0.64
121 0.58
122 0.51
123 0.47
124 0.53
125 0.49
126 0.42
127 0.34
128 0.27
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.19
146 0.21
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.27
151 0.31
152 0.31
153 0.26
154 0.24
155 0.2
156 0.19
157 0.17
158 0.18
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.17
165 0.2
166 0.18
167 0.17
168 0.16
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.13
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.16
336 0.23
337 0.21
338 0.23
339 0.24
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.25
344 0.2
345 0.24
346 0.21
347 0.19
348 0.2
349 0.19
350 0.18
351 0.15
352 0.15
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.2
365 0.24
366 0.21
367 0.24
368 0.32
369 0.4
370 0.49
371 0.53
372 0.53
373 0.58
374 0.65
375 0.71
376 0.68
377 0.67
378 0.66
379 0.68
380 0.73
381 0.73
382 0.74
383 0.74
384 0.76
385 0.77
386 0.79
387 0.74
388 0.72
389 0.73
390 0.7
391 0.66
392 0.63
393 0.57
394 0.51
395 0.54
396 0.49
397 0.38
398 0.32
399 0.26
400 0.21
401 0.19
402 0.16
403 0.1
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.1
426 0.12
427 0.13
428 0.12
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.11
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.05
438 0.05
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.12
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.11
481 0.16
482 0.21
483 0.27
484 0.32
485 0.35
486 0.4
487 0.45
488 0.51
489 0.57
490 0.62
491 0.66
492 0.72
493 0.75
494 0.79
495 0.83
496 0.82
497 0.8
498 0.78
499 0.78
500 0.76
501 0.75
502 0.72
503 0.68
504 0.61
505 0.54
506 0.45
507 0.36
508 0.28
509 0.25
510 0.2
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.11
518 0.11
519 0.15
520 0.16
521 0.15
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.13
533 0.12
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.07
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.07
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.1
585 0.09
586 0.11
587 0.1
588 0.09
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.09
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.07
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.02
638 0.02
639 0.02
640 0.02
641 0.02
642 0.02
643 0.02
644 0.02
645 0.02
646 0.03
647 0.03
648 0.06
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.08
654 0.11
655 0.15
656 0.12
657 0.12
658 0.12
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.1
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.04
667 0.04
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.04
676 0.03
677 0.04
678 0.04
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.09
684 0.11
685 0.16
686 0.2
687 0.21
688 0.25
689 0.35
690 0.46
691 0.54
692 0.63
693 0.69
694 0.76
695 0.85
696 0.91
697 0.91
698 0.91
699 0.91
700 0.91
701 0.9
702 0.84
703 0.79
704 0.74
705 0.67
706 0.58
707 0.53
708 0.43
709 0.36
710 0.3
711 0.24
712 0.19
713 0.15
714 0.14
715 0.1
716 0.09
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.07
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.11
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.11
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.09
734 0.08
735 0.07
736 0.07
737 0.06
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.06
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.05
748 0.06
749 0.06
750 0.1
751 0.18
752 0.27
753 0.33
754 0.4
755 0.47
756 0.57
757 0.62
758 0.69
759 0.71
760 0.71
761 0.75
762 0.78
763 0.79
764 0.75
765 0.69
766 0.62
767 0.51
768 0.42
769 0.32
770 0.22
771 0.15
772 0.09
773 0.07
774 0.05
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.03
781 0.03
782 0.05
783 0.09
784 0.13
785 0.16
786 0.19
787 0.27
788 0.35
789 0.45
790 0.53
791 0.61
792 0.67
793 0.75
794 0.83
795 0.82
796 0.84
797 0.78
798 0.75
799 0.67
800 0.61
801 0.51
802 0.43
803 0.4
804 0.3
805 0.28
806 0.21
807 0.18
808 0.16
809 0.16
810 0.13
811 0.11
812 0.15
813 0.16
814 0.2
815 0.23
816 0.24
817 0.27
818 0.36
819 0.43
820 0.5
821 0.56
822 0.62
823 0.68
824 0.74
825 0.8
826 0.81
827 0.82
828 0.8
829 0.79
830 0.74
831 0.69
832 0.62
833 0.52
834 0.45
835 0.38
836 0.32
837 0.27
838 0.24
839 0.22
840 0.26
841 0.27
842 0.36
843 0.43
844 0.51
845 0.56
846 0.59
847 0.57
848 0.59
849 0.59
850 0.48
851 0.39
852 0.32
853 0.24
854 0.19
855 0.19
856 0.13
857 0.11
858 0.12
859 0.12
860 0.11
861 0.12
862 0.12
863 0.11
864 0.11
865 0.12
866 0.14
867 0.18
868 0.2
869 0.19
870 0.2
871 0.2
872 0.2
873 0.19
874 0.17
875 0.14
876 0.09
877 0.09
878 0.1
879 0.1
880 0.12
881 0.18
882 0.22
883 0.26
884 0.29
885 0.34
886 0.38
887 0.41
888 0.45
889 0.42
890 0.42
891 0.42
892 0.38
893 0.33
894 0.27
895 0.24
896 0.18
897 0.18
898 0.14
899 0.1
900 0.11
901 0.11
902 0.15
903 0.2
904 0.24
905 0.28
906 0.34
907 0.4
908 0.47
909 0.49
910 0.48
911 0.46
912 0.5
913 0.53
914 0.56
915 0.54
916 0.52
917 0.51
918 0.51
919 0.52
920 0.45
921 0.37
922 0.35
923 0.38
924 0.38
925 0.43
926 0.44
927 0.43
928 0.45
929 0.43
930 0.36
931 0.31
932 0.28
933 0.24
934 0.24
935 0.26
936 0.21
937 0.22
938 0.22
939 0.2
940 0.17
941 0.15
942 0.11
943 0.07
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.09
948 0.11
949 0.13
950 0.16
951 0.16
952 0.18
953 0.25
954 0.26
955 0.25
956 0.28
957 0.29
958 0.28
959 0.28
960 0.26
961 0.19
962 0.19
963 0.19
964 0.15
965 0.14
966 0.13
967 0.13
968 0.13
969 0.13
970 0.12
971 0.13
972 0.13
973 0.1
974 0.1
975 0.1
976 0.1
977 0.09
978 0.08
979 0.06
980 0.06
981 0.07
982 0.07
983 0.08
984 0.09
985 0.09
986 0.1
987 0.11
988 0.16
989 0.17
990 0.16
991 0.16
992 0.15
993 0.16
994 0.15
995 0.13
996 0.08
997 0.07
998 0.07
999 0.09
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.08
1003 0.09
1004 0.08
1005 0.07
1006 0.12
1007 0.12
1008 0.12
1009 0.13
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.18
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.23
1016 0.24
1017 0.23
1018 0.22
1019 0.21
1020 0.2
1021 0.18
1022 0.15
1023 0.1
1024 0.13
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.16
1028 0.2
1029 0.24
1030 0.23
1031 0.27
1032 0.31
1033 0.35
1034 0.38
1035 0.43
1036 0.43
1037 0.43
1038 0.45
1039 0.43
1040 0.39
1041 0.36
1042 0.32
1043 0.28
1044 0.24
1045 0.21
1046 0.19
1047 0.2
1048 0.16
1049 0.17
1050 0.16
1051 0.14
1052 0.16
1053 0.16