Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HD07

Protein Details
Accession U5HD07    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-329SENLRKRRSQAYKKLDDEKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-238GGGKAKKGGSSSKSSKSKGKKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029523  INO80B/Ies2  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
Amino Acid Sequences MPPRIRSLTPESDDDDDVSMMTSSSPQRKPTTPAAAPPTRPPVASTVPATSAATAGTTLPQTRDDDDDDLSSLQSSEEEEEEEEEDDVEDDEDKQVSRATSRSRKTVPQYKDDDEASTSSEEEDQLDDDDDDDDGQDGAAYSDDDEEDELFDEEEEEFARARNATGGSRSRASSAIKSSPAKATGAGMKIKFKLGGGAGASASASPSGGRTTFSSGGGGKAKKGGSSSKSSKSKGKKRAHDDISDISDDDAGDPSFSDGSSVNSGSRLTARQRAKEMGGEYGMELESLSNDIIPRNKVKLTDAEAALRRSENLRKRRSQAYKKLDDEKTETINRLLKKQVGRQNNRGGKASAKNAGQPNNLSHADAVGPRTPGATLEAARPPTGLRWVSSIKTGEFKNVLMLPVEIVEGFEGEPKVFKGYPGPRPPPQSRDLRQLDKTAPASVQPVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.23
4 0.19
5 0.17
6 0.13
7 0.09
8 0.09
9 0.12
10 0.17
11 0.25
12 0.3
13 0.35
14 0.41
15 0.45
16 0.51
17 0.56
18 0.6
19 0.54
20 0.58
21 0.61
22 0.63
23 0.61
24 0.62
25 0.6
26 0.52
27 0.49
28 0.42
29 0.39
30 0.37
31 0.39
32 0.35
33 0.3
34 0.3
35 0.31
36 0.3
37 0.24
38 0.19
39 0.15
40 0.12
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.17
49 0.19
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.22
56 0.2
57 0.18
58 0.15
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.17
86 0.25
87 0.34
88 0.38
89 0.45
90 0.47
91 0.54
92 0.62
93 0.66
94 0.62
95 0.62
96 0.65
97 0.61
98 0.6
99 0.54
100 0.46
101 0.38
102 0.33
103 0.26
104 0.2
105 0.16
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.15
153 0.19
154 0.21
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.23
161 0.24
162 0.24
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.28
168 0.25
169 0.21
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.21
177 0.22
178 0.2
179 0.16
180 0.15
181 0.12
182 0.13
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.16
204 0.19
205 0.18
206 0.14
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.2
212 0.19
213 0.26
214 0.31
215 0.36
216 0.42
217 0.44
218 0.5
219 0.55
220 0.61
221 0.64
222 0.69
223 0.69
224 0.71
225 0.78
226 0.75
227 0.68
228 0.62
229 0.55
230 0.48
231 0.4
232 0.32
233 0.22
234 0.18
235 0.14
236 0.11
237 0.09
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.12
255 0.14
256 0.22
257 0.25
258 0.28
259 0.32
260 0.34
261 0.34
262 0.34
263 0.32
264 0.26
265 0.22
266 0.19
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.08
271 0.07
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.07
279 0.1
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.22
286 0.25
287 0.29
288 0.32
289 0.3
290 0.32
291 0.34
292 0.34
293 0.32
294 0.28
295 0.22
296 0.21
297 0.28
298 0.32
299 0.39
300 0.46
301 0.52
302 0.57
303 0.67
304 0.73
305 0.76
306 0.78
307 0.78
308 0.79
309 0.78
310 0.82
311 0.75
312 0.68
313 0.64
314 0.57
315 0.52
316 0.46
317 0.42
318 0.36
319 0.38
320 0.36
321 0.34
322 0.34
323 0.34
324 0.37
325 0.44
326 0.49
327 0.54
328 0.61
329 0.65
330 0.72
331 0.73
332 0.71
333 0.65
334 0.58
335 0.54
336 0.52
337 0.48
338 0.44
339 0.38
340 0.41
341 0.44
342 0.48
343 0.45
344 0.41
345 0.39
346 0.39
347 0.39
348 0.33
349 0.27
350 0.22
351 0.2
352 0.19
353 0.2
354 0.16
355 0.17
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.14
360 0.16
361 0.15
362 0.14
363 0.18
364 0.23
365 0.24
366 0.24
367 0.24
368 0.21
369 0.21
370 0.27
371 0.23
372 0.19
373 0.23
374 0.27
375 0.28
376 0.33
377 0.33
378 0.28
379 0.32
380 0.31
381 0.32
382 0.29
383 0.28
384 0.28
385 0.27
386 0.26
387 0.22
388 0.22
389 0.16
390 0.15
391 0.15
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.16
403 0.16
404 0.17
405 0.23
406 0.31
407 0.42
408 0.51
409 0.58
410 0.6
411 0.69
412 0.75
413 0.72
414 0.71
415 0.71
416 0.67
417 0.7
418 0.72
419 0.71
420 0.68
421 0.68
422 0.64
423 0.62
424 0.58
425 0.5
426 0.43
427 0.36