Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HGA3

Protein Details
Accession U5HGA3    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-80PTSSTEFKPRNQKDKSKYKHKQADADEAKHydrophilic
390-415DAAAEKEEKRKERKQHYQMKAADKKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-193KAKKAEEKKKRTR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MDQSAFRALLSSSNKPSGTSSGTAASTPRFGAPPPKRSAAATAPALHDPTAPTSSTEFKPRNQKDKSKYKHKQADADEAKSSSASTYRDRAAERRTGARHDFADAEKLLEDFKARVGDDDSLTKDELEEKLKYLGGDAEHTVLVKGLDMALLERMKAQQAAGADQSLEDVEDELDLVLADKAKKAEEKKKRTRDDLIAELKASKGGSKSDRPAAGFRDRTQDEEEKKKVKVAEQVATAGDAAASASKVSKPLPIPPPTINVEADDDLDIFGDAGEYKGLDTDSDDDDNHEATAARKEPTFEQTAAPPRNATAAVKRSYFDDDEEKDEDVERSTAPDSVTNLASSKQPAVKMTDSNAIMEEGEEEEEQRPLRLQPLSKSAIPNVKELLAMDAAAEKEEKRKERKQHYQMKAADKKEATLKAMTPQQRAEHEHQVMMTYLEKKERRAKGESTKEDDEDEDVANGGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.4
4 0.38
5 0.37
6 0.32
7 0.29
8 0.27
9 0.27
10 0.27
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.16
17 0.18
18 0.28
19 0.35
20 0.42
21 0.46
22 0.5
23 0.49
24 0.5
25 0.54
26 0.5
27 0.48
28 0.43
29 0.41
30 0.39
31 0.39
32 0.39
33 0.33
34 0.27
35 0.22
36 0.21
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.24
42 0.26
43 0.34
44 0.33
45 0.38
46 0.48
47 0.56
48 0.63
49 0.67
50 0.74
51 0.75
52 0.83
53 0.86
54 0.86
55 0.87
56 0.88
57 0.89
58 0.86
59 0.85
60 0.79
61 0.81
62 0.76
63 0.7
64 0.61
65 0.52
66 0.45
67 0.36
68 0.3
69 0.2
70 0.17
71 0.16
72 0.18
73 0.21
74 0.24
75 0.28
76 0.3
77 0.35
78 0.37
79 0.41
80 0.41
81 0.45
82 0.45
83 0.48
84 0.49
85 0.48
86 0.43
87 0.38
88 0.37
89 0.3
90 0.32
91 0.25
92 0.22
93 0.18
94 0.17
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.08
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.16
112 0.16
113 0.17
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.14
171 0.2
172 0.3
173 0.39
174 0.5
175 0.6
176 0.69
177 0.74
178 0.76
179 0.75
180 0.73
181 0.67
182 0.65
183 0.59
184 0.5
185 0.44
186 0.38
187 0.32
188 0.25
189 0.2
190 0.13
191 0.09
192 0.12
193 0.16
194 0.2
195 0.23
196 0.27
197 0.29
198 0.29
199 0.31
200 0.32
201 0.35
202 0.33
203 0.31
204 0.34
205 0.32
206 0.33
207 0.35
208 0.37
209 0.34
210 0.39
211 0.43
212 0.39
213 0.38
214 0.39
215 0.35
216 0.32
217 0.35
218 0.32
219 0.3
220 0.28
221 0.28
222 0.25
223 0.24
224 0.21
225 0.13
226 0.09
227 0.05
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.1
237 0.11
238 0.18
239 0.25
240 0.29
241 0.32
242 0.32
243 0.36
244 0.35
245 0.36
246 0.29
247 0.23
248 0.21
249 0.18
250 0.17
251 0.13
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.06
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.17
285 0.21
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.24
290 0.32
291 0.33
292 0.31
293 0.27
294 0.24
295 0.25
296 0.24
297 0.21
298 0.19
299 0.23
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.27
304 0.3
305 0.29
306 0.24
307 0.25
308 0.24
309 0.27
310 0.28
311 0.27
312 0.23
313 0.23
314 0.21
315 0.16
316 0.15
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.17
332 0.17
333 0.19
334 0.2
335 0.24
336 0.26
337 0.27
338 0.28
339 0.31
340 0.28
341 0.27
342 0.26
343 0.21
344 0.18
345 0.16
346 0.14
347 0.08
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.17
358 0.2
359 0.23
360 0.26
361 0.33
362 0.37
363 0.39
364 0.41
365 0.41
366 0.44
367 0.42
368 0.4
369 0.34
370 0.3
371 0.28
372 0.25
373 0.22
374 0.15
375 0.13
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.09
382 0.16
383 0.24
384 0.31
385 0.38
386 0.47
387 0.57
388 0.67
389 0.77
390 0.81
391 0.85
392 0.85
393 0.87
394 0.85
395 0.86
396 0.83
397 0.75
398 0.72
399 0.62
400 0.57
401 0.54
402 0.5
403 0.43
404 0.38
405 0.37
406 0.35
407 0.43
408 0.46
409 0.42
410 0.44
411 0.46
412 0.48
413 0.54
414 0.54
415 0.55
416 0.52
417 0.49
418 0.44
419 0.4
420 0.35
421 0.29
422 0.27
423 0.21
424 0.22
425 0.29
426 0.31
427 0.37
428 0.46
429 0.53
430 0.55
431 0.57
432 0.63
433 0.65
434 0.74
435 0.76
436 0.74
437 0.71
438 0.66
439 0.61
440 0.54
441 0.45
442 0.36
443 0.28
444 0.21