Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HDM3

Protein Details
Accession U5HDM3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-100VSSSRDRAPQRRRRSSIASQEIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-91RRARNKEAVSSSRDRAPQRRRR
Subcellular Location(s) plas 24, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011527  ABC1_TM_dom  
IPR036640  ABC1_TM_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0140359  F:ABC-type transporter activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00664  ABC_membrane  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50929  ABC_TM1F  
CDD cd18596  ABC_6TM_VMR1_D1_like  
Amino Acid Sequences MDSQLTFNYPSSSDGWCQNDSAPYWNGREFSVCFLRRTIDGLIPLACLSISLLSTLFITLFHLYLIISRRRARNKEAVSSSRDRAPQRRRRSSIASQEIKRAGLSAITEAENEVILAVVRDESPDLSAKELDTLAGETGSPSAIDDEDEELERATLQLGASMVASAIWSNKKDVLGLLGAAGVLGLSVVKMLAATDDGANWLLFGITTWSWMTLLSLIKLAISVSRKLGSLQAPKRPHRGLPRVYTFLELNLIPWLLVYQVIAFQDVYDALTSSRPSTMREIRIEVALFALTLAMTAVEIFWPRPSRFTSRSAKHNRSSAESGNLPPSHELNASLYSLLTFSYVGGFLFRHARTTIQRDDIPDLRPDDQTARVVLNFRRDCGHLGRSFPKRAHSLGMTVKLLFHFRKLLMAQQLWALITALSRAIPSLFLRGLLNEIAKRSRGEEAPVHVALLFATGMFFSQLISTVSGSQALYIGRRIGIRLRSVLIGEIFTKALRRKDLAGSSQEDASEDKTGEAKNHGDEPELKEIEEELERASSGKILNLIAIDTFRISEVSSYLHFIFPDLSLEIIIIVILLFQVLGWAAMAGVIVLVTLVPIQTYLARRFNQFQTKLLAAADARISLATEVITSVRIVKYFAWEEKFLAMMHVTRMKELDALWSRAMVMVSSSLIFNGAPVIVSLATFVCQTKVLKRELTASDAFTALSLFNVLRGPLEGFPDMVVSVLQAHVSLKRIDDFLNEQETAKYAVVKEPRTGSNPIVGFTDSASFTWADEAEAREDLSVFRIRDLNLSFPVGKFSIILGPVGSGKTTLLMSLLGETNQLSGSAFLPSPVGRSTGEGRIRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.31
4 0.32
5 0.31
6 0.33
7 0.31
8 0.34
9 0.3
10 0.3
11 0.32
12 0.34
13 0.32
14 0.29
15 0.31
16 0.27
17 0.31
18 0.37
19 0.36
20 0.34
21 0.35
22 0.36
23 0.33
24 0.35
25 0.32
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.25
30 0.23
31 0.22
32 0.18
33 0.14
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.08
44 0.06
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.12
52 0.19
53 0.22
54 0.27
55 0.34
56 0.43
57 0.53
58 0.59
59 0.63
60 0.67
61 0.68
62 0.72
63 0.74
64 0.71
65 0.69
66 0.69
67 0.64
68 0.6
69 0.6
70 0.57
71 0.58
72 0.63
73 0.66
74 0.71
75 0.79
76 0.78
77 0.79
78 0.81
79 0.81
80 0.81
81 0.81
82 0.79
83 0.7
84 0.72
85 0.67
86 0.59
87 0.49
88 0.39
89 0.28
90 0.21
91 0.2
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.07
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.09
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.16
117 0.15
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.05
151 0.06
152 0.04
153 0.08
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.04
170 0.03
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.03
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.21
216 0.24
217 0.31
218 0.36
219 0.43
220 0.5
221 0.54
222 0.61
223 0.59
224 0.59
225 0.6
226 0.63
227 0.62
228 0.63
229 0.65
230 0.61
231 0.59
232 0.55
233 0.45
234 0.36
235 0.3
236 0.21
237 0.15
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.14
264 0.21
265 0.27
266 0.31
267 0.33
268 0.35
269 0.33
270 0.35
271 0.33
272 0.25
273 0.19
274 0.13
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.02
282 0.02
283 0.02
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.08
289 0.12
290 0.13
291 0.16
292 0.2
293 0.26
294 0.3
295 0.37
296 0.44
297 0.44
298 0.55
299 0.62
300 0.66
301 0.63
302 0.64
303 0.58
304 0.55
305 0.54
306 0.46
307 0.4
308 0.34
309 0.31
310 0.32
311 0.3
312 0.25
313 0.22
314 0.2
315 0.18
316 0.16
317 0.16
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.2
341 0.26
342 0.28
343 0.27
344 0.28
345 0.28
346 0.32
347 0.32
348 0.3
349 0.27
350 0.25
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.19
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.14
359 0.13
360 0.16
361 0.16
362 0.24
363 0.22
364 0.22
365 0.23
366 0.23
367 0.25
368 0.26
369 0.3
370 0.22
371 0.26
372 0.32
373 0.36
374 0.39
375 0.37
376 0.37
377 0.34
378 0.33
379 0.32
380 0.26
381 0.25
382 0.25
383 0.27
384 0.23
385 0.21
386 0.2
387 0.18
388 0.2
389 0.15
390 0.13
391 0.12
392 0.11
393 0.15
394 0.15
395 0.18
396 0.19
397 0.19
398 0.18
399 0.16
400 0.17
401 0.14
402 0.13
403 0.1
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.08
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.14
429 0.13
430 0.16
431 0.17
432 0.19
433 0.22
434 0.21
435 0.2
436 0.17
437 0.16
438 0.12
439 0.11
440 0.07
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.12
467 0.15
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.17
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.11
481 0.13
482 0.16
483 0.17
484 0.18
485 0.2
486 0.25
487 0.29
488 0.3
489 0.3
490 0.3
491 0.29
492 0.28
493 0.25
494 0.21
495 0.18
496 0.15
497 0.12
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.17
507 0.17
508 0.17
509 0.19
510 0.23
511 0.28
512 0.27
513 0.25
514 0.21
515 0.21
516 0.21
517 0.18
518 0.14
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.08
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.11
552 0.09
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.03
560 0.02
561 0.02
562 0.02
563 0.02
564 0.02
565 0.02
566 0.02
567 0.02
568 0.02
569 0.02
570 0.02
571 0.02
572 0.03
573 0.03
574 0.02
575 0.02
576 0.02
577 0.02
578 0.02
579 0.02
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.02
584 0.02
585 0.03
586 0.07
587 0.11
588 0.16
589 0.22
590 0.24
591 0.27
592 0.32
593 0.39
594 0.45
595 0.43
596 0.41
597 0.39
598 0.39
599 0.37
600 0.32
601 0.26
602 0.17
603 0.16
604 0.15
605 0.1
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.08
618 0.09
619 0.09
620 0.11
621 0.11
622 0.16
623 0.19
624 0.24
625 0.25
626 0.25
627 0.26
628 0.25
629 0.26
630 0.2
631 0.18
632 0.14
633 0.11
634 0.14
635 0.18
636 0.18
637 0.17
638 0.18
639 0.17
640 0.17
641 0.17
642 0.22
643 0.22
644 0.24
645 0.24
646 0.23
647 0.23
648 0.23
649 0.23
650 0.14
651 0.09
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.06
657 0.07
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.06
665 0.05
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.08
672 0.07
673 0.1
674 0.12
675 0.18
676 0.23
677 0.27
678 0.29
679 0.3
680 0.36
681 0.35
682 0.39
683 0.35
684 0.31
685 0.28
686 0.26
687 0.24
688 0.17
689 0.15
690 0.1
691 0.08
692 0.07
693 0.06
694 0.07
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.11
700 0.11
701 0.15
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.14
706 0.12
707 0.1
708 0.09
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.09
716 0.12
717 0.13
718 0.14
719 0.15
720 0.17
721 0.17
722 0.2
723 0.23
724 0.24
725 0.28
726 0.27
727 0.26
728 0.25
729 0.26
730 0.25
731 0.21
732 0.19
733 0.15
734 0.2
735 0.27
736 0.29
737 0.32
738 0.34
739 0.38
740 0.39
741 0.42
742 0.37
743 0.38
744 0.36
745 0.33
746 0.3
747 0.26
748 0.22
749 0.2
750 0.21
751 0.14
752 0.13
753 0.14
754 0.12
755 0.12
756 0.13
757 0.12
758 0.11
759 0.12
760 0.14
761 0.15
762 0.15
763 0.16
764 0.14
765 0.14
766 0.13
767 0.15
768 0.19
769 0.17
770 0.19
771 0.22
772 0.22
773 0.28
774 0.3
775 0.3
776 0.27
777 0.31
778 0.3
779 0.27
780 0.31
781 0.25
782 0.23
783 0.19
784 0.18
785 0.18
786 0.17
787 0.17
788 0.13
789 0.14
790 0.15
791 0.15
792 0.14
793 0.1
794 0.09
795 0.11
796 0.1
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.09
801 0.11
802 0.12
803 0.1
804 0.11
805 0.11
806 0.11
807 0.11
808 0.11
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.11
813 0.11
814 0.1
815 0.13
816 0.13
817 0.15
818 0.15
819 0.17
820 0.14
821 0.19
822 0.23
823 0.3
824 0.39