Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HA41

Protein Details
Accession U5HA41    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-106LVLVDKEKKRREQEIQRLQEREHydrophilic
879-901RIEEERPRKKGLKEKGKGKERTQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-83RAIRAKR
90-94KEKKR
874-900RQEAKRIEEERPRKKGLKEKGKGKERT
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLWRTCRRLLHVVGPTPSTTTSSPSTRAAAASSPCRCLVPSPRLTIGPSSQLFSTSQPSQKYEKKSTPQLDKLAQKRAIRAKRSLVLVDKEKKRREQEIQRLQEREQKRVQVDEWTSDLPPLEEAELESIYQQLITATPGQLLPPLETRPAIAAPKPPQLLLYDPSRDRAQGLLNLAERLEAFDADEDVDAPETDHDPASTIISDLAEKLRRKRSEVGLPREPEENAREGAQELVEIPKSAPQVLLDRLESLLHVGELASLPSTAIDLDHVQPSIGLIHQSEWTDLIITAAQSQDLESVKRGLILMQRMAPQHDARAMNELMSLFAVERRPRDALELANFAKERSLPFSLESHHHLLASLAPSHPELAIQHLYSLEASNYTPLLATYTLLINRLLSPISPPHLIARGWDLYAHCRLVAHPIPDVDLYNTMIAACSRGAYPSPERAVDLFLEMTETNLIAPTPTTYNALIRSCAREGSQPSYFEALRYLKKMLDVNLLPNRGTFHAILEGARRQGDLLRSRWVLVKMVQIGGECRPNADTLALVFRSCKGYEPEVKEKRGIVIGGSKRAAVASEEKGKESIIISPDVGPNKGTDETRKVDTQPTATAAEEQPLEDSNVIELLGESSLFYPGPIPTTPDELVLEAQTLLLQIVDPSVLGLSASPRSTPSSFPDVRPTAFLLNSYLELLTAHAPLPASVDFFNSAYGPSTGVDKNGYTFEVMIKRCETAKKREVGLEMARKVWGEWKLWSEEDQERLSGRNISLMWGSMIRVLARSFKHVEGLDLLQRFISTYPPLALVASARSRAHQRHSLPPNPNKIQLSSLQFPETTHPATRHDLPPHLLAEDVKLLYLRFRNVEDMEGLKKIQGVVKAYKEARQEAKRIEEERPRKKGLKEKGKGKERTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.48
3 0.42
4 0.38
5 0.33
6 0.25
7 0.23
8 0.25
9 0.27
10 0.3
11 0.31
12 0.32
13 0.3
14 0.3
15 0.27
16 0.27
17 0.29
18 0.34
19 0.35
20 0.35
21 0.35
22 0.35
23 0.34
24 0.35
25 0.39
26 0.4
27 0.44
28 0.47
29 0.49
30 0.5
31 0.51
32 0.5
33 0.44
34 0.42
35 0.36
36 0.32
37 0.29
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.28
42 0.27
43 0.31
44 0.33
45 0.37
46 0.44
47 0.5
48 0.56
49 0.6
50 0.63
51 0.66
52 0.72
53 0.77
54 0.79
55 0.8
56 0.78
57 0.77
58 0.77
59 0.75
60 0.74
61 0.72
62 0.64
63 0.65
64 0.68
65 0.7
66 0.67
67 0.67
68 0.65
69 0.64
70 0.65
71 0.62
72 0.58
73 0.56
74 0.59
75 0.63
76 0.64
77 0.68
78 0.71
79 0.74
80 0.74
81 0.76
82 0.77
83 0.78
84 0.8
85 0.82
86 0.84
87 0.83
88 0.79
89 0.73
90 0.71
91 0.63
92 0.6
93 0.56
94 0.53
95 0.49
96 0.5
97 0.49
98 0.49
99 0.49
100 0.44
101 0.41
102 0.36
103 0.33
104 0.29
105 0.28
106 0.19
107 0.17
108 0.14
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.09
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.26
141 0.29
142 0.36
143 0.37
144 0.34
145 0.32
146 0.31
147 0.33
148 0.28
149 0.3
150 0.29
151 0.29
152 0.33
153 0.33
154 0.31
155 0.28
156 0.27
157 0.24
158 0.22
159 0.24
160 0.25
161 0.25
162 0.25
163 0.24
164 0.22
165 0.18
166 0.15
167 0.13
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.13
194 0.18
195 0.22
196 0.29
197 0.38
198 0.4
199 0.45
200 0.51
201 0.54
202 0.59
203 0.65
204 0.66
205 0.66
206 0.65
207 0.62
208 0.57
209 0.49
210 0.42
211 0.35
212 0.29
213 0.21
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.15
231 0.17
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.09
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.14
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.21
295 0.21
296 0.23
297 0.24
298 0.21
299 0.19
300 0.23
301 0.22
302 0.19
303 0.23
304 0.22
305 0.18
306 0.19
307 0.17
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.05
312 0.07
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.25
324 0.22
325 0.24
326 0.24
327 0.2
328 0.19
329 0.17
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.24
339 0.22
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.13
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.1
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.08
384 0.08
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.14
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.16
399 0.16
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.16
404 0.19
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.09
426 0.11
427 0.14
428 0.16
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.17
433 0.14
434 0.13
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.16
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.18
463 0.21
464 0.23
465 0.21
466 0.22
467 0.24
468 0.23
469 0.19
470 0.2
471 0.19
472 0.17
473 0.18
474 0.18
475 0.16
476 0.19
477 0.2
478 0.18
479 0.2
480 0.19
481 0.24
482 0.27
483 0.28
484 0.25
485 0.24
486 0.24
487 0.19
488 0.2
489 0.14
490 0.1
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.1
500 0.12
501 0.17
502 0.19
503 0.2
504 0.24
505 0.24
506 0.25
507 0.28
508 0.26
509 0.22
510 0.19
511 0.21
512 0.18
513 0.18
514 0.18
515 0.15
516 0.15
517 0.15
518 0.17
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.09
526 0.07
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.13
533 0.13
534 0.14
535 0.14
536 0.19
537 0.26
538 0.33
539 0.43
540 0.46
541 0.48
542 0.47
543 0.44
544 0.4
545 0.35
546 0.28
547 0.18
548 0.21
549 0.21
550 0.24
551 0.24
552 0.22
553 0.2
554 0.2
555 0.19
556 0.13
557 0.14
558 0.15
559 0.22
560 0.23
561 0.24
562 0.24
563 0.23
564 0.22
565 0.19
566 0.18
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.17
572 0.17
573 0.17
574 0.14
575 0.12
576 0.14
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.21
581 0.23
582 0.26
583 0.28
584 0.27
585 0.29
586 0.3
587 0.29
588 0.25
589 0.24
590 0.22
591 0.21
592 0.22
593 0.17
594 0.17
595 0.15
596 0.13
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.09
601 0.09
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.09
618 0.09
619 0.12
620 0.12
621 0.18
622 0.18
623 0.18
624 0.18
625 0.16
626 0.17
627 0.14
628 0.13
629 0.08
630 0.08
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.03
637 0.04
638 0.04
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.05
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.11
650 0.15
651 0.17
652 0.19
653 0.22
654 0.28
655 0.3
656 0.32
657 0.39
658 0.38
659 0.37
660 0.37
661 0.34
662 0.28
663 0.25
664 0.24
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.15
669 0.13
670 0.1
671 0.09
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.11
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.13
687 0.1
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.1
692 0.09
693 0.13
694 0.12
695 0.13
696 0.15
697 0.13
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.12
702 0.12
703 0.15
704 0.21
705 0.21
706 0.23
707 0.23
708 0.23
709 0.26
710 0.34
711 0.36
712 0.39
713 0.46
714 0.48
715 0.5
716 0.53
717 0.52
718 0.49
719 0.52
720 0.51
721 0.45
722 0.4
723 0.38
724 0.34
725 0.32
726 0.32
727 0.27
728 0.21
729 0.23
730 0.26
731 0.29
732 0.29
733 0.31
734 0.3
735 0.3
736 0.33
737 0.31
738 0.28
739 0.25
740 0.26
741 0.26
742 0.24
743 0.2
744 0.2
745 0.18
746 0.19
747 0.19
748 0.18
749 0.17
750 0.14
751 0.14
752 0.12
753 0.13
754 0.11
755 0.12
756 0.13
757 0.17
758 0.18
759 0.23
760 0.25
761 0.25
762 0.3
763 0.28
764 0.29
765 0.26
766 0.29
767 0.29
768 0.26
769 0.25
770 0.2
771 0.2
772 0.19
773 0.16
774 0.16
775 0.12
776 0.13
777 0.14
778 0.15
779 0.16
780 0.15
781 0.15
782 0.13
783 0.16
784 0.17
785 0.2
786 0.19
787 0.22
788 0.29
789 0.33
790 0.4
791 0.44
792 0.46
793 0.52
794 0.61
795 0.67
796 0.7
797 0.73
798 0.76
799 0.72
800 0.74
801 0.66
802 0.59
803 0.54
804 0.51
805 0.5
806 0.45
807 0.43
808 0.38
809 0.36
810 0.34
811 0.35
812 0.34
813 0.3
814 0.29
815 0.29
816 0.31
817 0.36
818 0.42
819 0.44
820 0.45
821 0.46
822 0.45
823 0.47
824 0.44
825 0.39
826 0.34
827 0.26
828 0.24
829 0.23
830 0.2
831 0.16
832 0.16
833 0.15
834 0.2
835 0.23
836 0.24
837 0.22
838 0.24
839 0.29
840 0.3
841 0.32
842 0.29
843 0.29
844 0.28
845 0.27
846 0.26
847 0.21
848 0.21
849 0.21
850 0.21
851 0.23
852 0.25
853 0.31
854 0.35
855 0.43
856 0.44
857 0.47
858 0.49
859 0.51
860 0.55
861 0.55
862 0.57
863 0.55
864 0.62
865 0.64
866 0.62
867 0.63
868 0.64
869 0.68
870 0.72
871 0.73
872 0.72
873 0.72
874 0.77
875 0.78
876 0.79
877 0.8
878 0.79
879 0.81
880 0.84
881 0.88