Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H5P3

Protein Details
Accession U5H5P3    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-81AAPSLIPIEKKKDKRHKSNKGKDKRKPVVVPEPVNHydrophilic
137-163KLAARRIKEVPSKNKKRKVEAERSDEQHydrophilic
209-231EDTTTSKKKPSNKDKRLERDDTPHydrophilic
541-564LPPGKFLKVSKRKVRLERCKTGIAHydrophilic
648-675LDPDRLARRAEKKKQKVLSERYERKMANHydrophilic
683-716ILGRESRGELRRRKEKKRVKEGNRTGKRAKKGDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-73EKKKDKRHKSNKGKDKRKP
140-154ARRIKEVPSKNKKRK
652-714RLARRAEKKKQKVLSERYERKMANLEKSGAGILGRESRGELRRRKEKKRVKEGNRTGKRAKKG
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_mito 7, mito 6.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSSSKSTATEAGLSSFLLAQGEGSKDNELDAVFANSKGPSTSIAAPSLIPIEKKKDKRHKSNKGKDKRKPVVVPEPVNEAPKSETEGEEEEVDDEILEPLEIDSDASLEMPSSDDDDEDDDENDDGVEQAYAAKLAARRIKEVPSKNKKRKVEAERSDEQDSEASDEEDDEDEHTDEEEDEEMIDADDLTPGTILATKQSKLTISEDTTTSKKKPSNKDKRLERDDTPEQRDARTVFLGNVPATCATSRPMKKALIRHVLQSPTLLQLLPADFPTLKCDSIRFRSIAFASTVFGRKESQTNDPDALEVDAEGGRNRKRAREWRDAEGSDQRGVRGGFHAKEPVPSSSSNRGSSGALTDGQKRRVALFRGDLNQGKSTCNAYLVLEPLKNTPSSSLSDADLLKLIVQSVDATHFEGYTLRADIVRPRSTAALIAAAQISAKPDLSIPLPANAPKGPVYVVPTAEARRTVFIGGLDFTETEENVRKAIEAVLVREKGQASSVKGWVEGVRLIRDASSGLGKGFGYVLLQDPSCVDELLALPPGKFLKVSKRKVRLERCKTGIAAARAKASANAKNPSSLSTTSKPTTQKLGGQILAAPRDPSLRLGNRPIISSSKLASQAALVEKQAAQAAQLASLPASDRKQIKALDPDRLARRAEKKKQKVLSERYERKMANLEKSGAGILGRESRGELRRRKEKKRVKEGNRTGKRAKKGDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.27
4 0.21
5 0.14
6 0.13
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.15
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.16
31 0.21
32 0.22
33 0.24
34 0.24
35 0.23
36 0.24
37 0.25
38 0.22
39 0.2
40 0.21
41 0.28
42 0.37
43 0.46
44 0.56
45 0.64
46 0.73
47 0.82
48 0.89
49 0.91
50 0.93
51 0.95
52 0.95
53 0.96
54 0.96
55 0.94
56 0.94
57 0.92
58 0.91
59 0.87
60 0.85
61 0.85
62 0.83
63 0.79
64 0.7
65 0.68
66 0.6
67 0.56
68 0.47
69 0.38
70 0.31
71 0.26
72 0.29
73 0.23
74 0.21
75 0.21
76 0.24
77 0.24
78 0.22
79 0.21
80 0.17
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.09
125 0.15
126 0.21
127 0.22
128 0.26
129 0.29
130 0.37
131 0.44
132 0.52
133 0.57
134 0.63
135 0.72
136 0.79
137 0.85
138 0.84
139 0.85
140 0.86
141 0.85
142 0.85
143 0.83
144 0.81
145 0.77
146 0.75
147 0.69
148 0.58
149 0.49
150 0.39
151 0.3
152 0.24
153 0.19
154 0.14
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.06
184 0.06
185 0.1
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.23
196 0.23
197 0.25
198 0.27
199 0.29
200 0.28
201 0.29
202 0.32
203 0.38
204 0.48
205 0.56
206 0.64
207 0.7
208 0.78
209 0.82
210 0.88
211 0.88
212 0.82
213 0.74
214 0.71
215 0.71
216 0.69
217 0.64
218 0.59
219 0.52
220 0.47
221 0.47
222 0.39
223 0.32
224 0.26
225 0.21
226 0.16
227 0.17
228 0.19
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.18
238 0.2
239 0.23
240 0.27
241 0.31
242 0.36
243 0.42
244 0.49
245 0.49
246 0.48
247 0.48
248 0.49
249 0.46
250 0.41
251 0.35
252 0.27
253 0.19
254 0.19
255 0.15
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.15
269 0.19
270 0.24
271 0.27
272 0.24
273 0.23
274 0.26
275 0.26
276 0.25
277 0.2
278 0.16
279 0.13
280 0.14
281 0.17
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.18
287 0.2
288 0.25
289 0.24
290 0.27
291 0.27
292 0.26
293 0.25
294 0.21
295 0.18
296 0.11
297 0.08
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.1
303 0.11
304 0.16
305 0.17
306 0.2
307 0.28
308 0.37
309 0.45
310 0.52
311 0.55
312 0.56
313 0.61
314 0.57
315 0.53
316 0.49
317 0.42
318 0.34
319 0.3
320 0.24
321 0.2
322 0.19
323 0.17
324 0.14
325 0.16
326 0.14
327 0.15
328 0.18
329 0.16
330 0.19
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.21
336 0.25
337 0.28
338 0.27
339 0.26
340 0.26
341 0.24
342 0.23
343 0.2
344 0.13
345 0.11
346 0.12
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.22
351 0.22
352 0.23
353 0.26
354 0.27
355 0.23
356 0.23
357 0.24
358 0.26
359 0.29
360 0.29
361 0.27
362 0.28
363 0.26
364 0.23
365 0.2
366 0.19
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.16
387 0.16
388 0.15
389 0.13
390 0.11
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.13
412 0.19
413 0.21
414 0.2
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.21
419 0.16
420 0.12
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.11
435 0.11
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.15
441 0.16
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.15
450 0.17
451 0.18
452 0.18
453 0.18
454 0.15
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.08
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.14
477 0.11
478 0.14
479 0.2
480 0.21
481 0.21
482 0.23
483 0.22
484 0.18
485 0.2
486 0.2
487 0.18
488 0.22
489 0.24
490 0.22
491 0.22
492 0.22
493 0.2
494 0.18
495 0.17
496 0.15
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.13
502 0.12
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.1
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.1
526 0.14
527 0.13
528 0.12
529 0.14
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.22
535 0.32
536 0.42
537 0.5
538 0.6
539 0.68
540 0.78
541 0.86
542 0.87
543 0.86
544 0.86
545 0.81
546 0.75
547 0.67
548 0.62
549 0.57
550 0.52
551 0.48
552 0.4
553 0.38
554 0.34
555 0.34
556 0.32
557 0.31
558 0.31
559 0.31
560 0.35
561 0.33
562 0.36
563 0.36
564 0.34
565 0.34
566 0.3
567 0.3
568 0.29
569 0.35
570 0.33
571 0.39
572 0.4
573 0.38
574 0.42
575 0.39
576 0.4
577 0.41
578 0.45
579 0.4
580 0.37
581 0.37
582 0.33
583 0.32
584 0.28
585 0.22
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.24
591 0.27
592 0.31
593 0.37
594 0.44
595 0.43
596 0.44
597 0.44
598 0.39
599 0.37
600 0.34
601 0.29
602 0.26
603 0.28
604 0.26
605 0.23
606 0.2
607 0.22
608 0.23
609 0.23
610 0.18
611 0.18
612 0.18
613 0.19
614 0.19
615 0.15
616 0.11
617 0.14
618 0.14
619 0.13
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.15
627 0.2
628 0.23
629 0.26
630 0.32
631 0.34
632 0.39
633 0.45
634 0.47
635 0.5
636 0.51
637 0.56
638 0.56
639 0.57
640 0.54
641 0.51
642 0.57
643 0.59
644 0.66
645 0.69
646 0.73
647 0.79
648 0.85
649 0.87
650 0.87
651 0.86
652 0.87
653 0.87
654 0.86
655 0.82
656 0.82
657 0.72
658 0.65
659 0.65
660 0.6
661 0.58
662 0.54
663 0.51
664 0.43
665 0.44
666 0.4
667 0.31
668 0.25
669 0.17
670 0.15
671 0.18
672 0.18
673 0.17
674 0.19
675 0.25
676 0.33
677 0.41
678 0.47
679 0.51
680 0.61
681 0.71
682 0.79
683 0.83
684 0.87
685 0.89
686 0.91
687 0.93
688 0.92
689 0.94
690 0.94
691 0.95
692 0.94
693 0.91
694 0.89
695 0.87
696 0.86