FuNGI

U5HGA9

Protein Details

Accession

U5HGA9

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
190-211	FDNDRQVRIKQQQTRDKQKSER	Hydrophilic
322-350	PVKGPTPASRKVKKKHRKKLRQHSDDELS	Basic
692-737	NVLDEQRQKSRKKEKEKEKELQRRKEKAKKETQRRKKEIQARALRN	Basic
766-787	DTETTRAKRKPRAALHREQQLA	Hydrophilic
833-860	SLETTSPPKRIPRKKLDLGLRGKKRRLG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
327-342	TPASRKVKKKHRKKLR
399-405	KRARKMK
699-733	QKSRKKEKEKEKELQRRKEKAKKETQRRKKEIQAR
840-858	PKRIPRKKLDLGLRGKKRR

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MHSHARNYRTGAAALPDSKNDRTPAASFKPPRPAVTAISVPTAFGADPHTDRNGHRTANHDSRFSPRTRYAPVSQPSRRPLTSFQARAPAAASPSYRATPPAAPRLFSGRTERIVSAYAMDECAPYDARAEAAREAQARLSPFVSAGEARNGARQAFHTERRRTDGCDSDSESIRYKPSRSYGDNNQYVFDNDRQVRIKQQQTRDKQKSERALQKEKQLALTPAYQADEKKRAANKLERLRAEGPSTVGKPLKRRNAVDENISTNSSGAASVKSSRRRSPTSQKAEEVLGFLGPEKCAASSRTKLSQKVDSDDDVLSLSSSPVKGPTPASRKVKKKHRKKLRQHSDDELSEYATAPMRISLSPSPAPAALVPKPKVVYDLATLLAEEDASVKVEVKWLKRARKMKRSEIKDDVDTSDSDSGQSDADRQLVHQEMRIRRENQASPDPLLEGEDELPDPSTLCPFCSSVLPSEPSKELSSLKKYLLGRPNVTPNPSKRNPLGKRLPVVETASFCRRHRWETSVIPEGKARGWPTTIDWEALPKRVGAREFSDHLSQIIMQRKPSRFFDIAKREWEAKGSKINNILSEFKSSEVELPGYYGLIGQEKLIHLLNKLFVVDAPLLTTYKALPLDVSAYIRRVLVPETAVELIRRDLELDLGDPDTRGEAERVCQESREFGQAMFSTTQKEEKEMRANVLDEQRQKSRKKEKEKEKELQRRKEKAKKETQRRKKEIQARALRNALRLQRGGSVDLGEDSSSAVGMPNGTASDTETTRAKRKPRAALHREQQLANSNGRSTAAPAEAANLPVRGSSGDSDDTDSDQELMVPLFETSERISLETTSPPKRIPRKKLDLGLRGKKRRLGEEEGPAVVTLEESSDDLNTD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.32
4	0.34
5	0.36
6	0.38
7	0.36
8	0.33
9	0.33
10	0.34
11	0.38
12	0.39
13	0.47
14	0.49
15	0.54
16	0.62
17	0.61
18	0.61
19	0.57
20	0.55
21	0.49
22	0.49
23	0.47
24	0.38
25	0.39
26	0.36
27	0.3
28	0.27
29	0.23
30	0.16
31	0.12
32	0.14
33	0.14
34	0.16
35	0.2
36	0.23
37	0.25
38	0.27
39	0.33
40	0.35
41	0.34
42	0.35
43	0.37
44	0.44
45	0.51
46	0.53
47	0.49
48	0.46
49	0.5
50	0.53
51	0.5
52	0.48
53	0.44
54	0.46
55	0.5
56	0.55
57	0.53
58	0.57
59	0.62
60	0.64
61	0.65
62	0.67
63	0.67
64	0.68
65	0.64
66	0.58
67	0.56
68	0.56
69	0.6
70	0.56
71	0.53
72	0.54
73	0.53
74	0.49
75	0.44
76	0.36
77	0.28
78	0.27
79	0.25
80	0.19
81	0.23
82	0.24
83	0.23
84	0.23
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.39
89	0.38
90	0.37
91	0.39
92	0.44
93	0.43
94	0.4
95	0.42
96	0.36
97	0.38
98	0.41
99	0.39
100	0.34
101	0.33
102	0.3
103	0.23
104	0.21
105	0.17
106	0.15
107	0.14
108	0.13
109	0.11
110	0.13
111	0.12
112	0.1
113	0.11
114	0.1
115	0.11
116	0.13
117	0.14
118	0.14
119	0.16
120	0.19
121	0.2
122	0.2
123	0.2
124	0.22
125	0.22
126	0.22
127	0.2
128	0.16
129	0.15
130	0.15
131	0.15
132	0.14
133	0.14
134	0.16
135	0.17
136	0.18
137	0.21
138	0.22
139	0.2
140	0.2
141	0.2
142	0.24
143	0.29
144	0.38
145	0.43
146	0.49
147	0.53
148	0.59
149	0.59
150	0.56
151	0.56
152	0.55
153	0.49
154	0.47
155	0.48
156	0.45
157	0.45
158	0.42
159	0.38
160	0.32
161	0.33
162	0.31
163	0.28
164	0.29
165	0.33
166	0.39
167	0.42
168	0.47
169	0.52
170	0.6
171	0.64
172	0.59
173	0.54
174	0.47
175	0.43
176	0.4
177	0.32
178	0.3
179	0.25
180	0.3
181	0.32
182	0.33
183	0.39
184	0.44
185	0.51
186	0.5
187	0.59
188	0.64
189	0.71
190	0.81
191	0.81
192	0.8
193	0.78
194	0.79
195	0.79
196	0.78
197	0.78
198	0.75
199	0.77
200	0.73
201	0.74
202	0.72
203	0.64
204	0.58
205	0.52
206	0.45
207	0.38
208	0.36
209	0.28
210	0.23
211	0.23
212	0.21
213	0.2
214	0.24
215	0.28
216	0.26
217	0.32
218	0.35
219	0.39
220	0.45
221	0.51
222	0.55
223	0.58
224	0.65
225	0.59
226	0.61
227	0.58
228	0.54
229	0.48
230	0.39
231	0.31
232	0.28
233	0.27
234	0.26
235	0.27
236	0.27
237	0.33
238	0.41
239	0.48
240	0.51
241	0.52
242	0.56
243	0.62
244	0.61
245	0.59
246	0.53
247	0.48
248	0.42
249	0.4
250	0.32
251	0.23
252	0.2
253	0.14
254	0.11
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.13
259	0.19
260	0.28
261	0.32
262	0.38
263	0.44
264	0.5
265	0.57
266	0.63
267	0.67
268	0.69
269	0.69
270	0.65
271	0.6
272	0.56
273	0.47
274	0.37
275	0.27
276	0.17
277	0.12
278	0.11
279	0.1
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.12
286	0.16
287	0.19
288	0.24
289	0.32
290	0.36
291	0.4
292	0.42
293	0.47
294	0.44
295	0.44
296	0.43
297	0.35
298	0.33
299	0.29
300	0.25
301	0.18
302	0.15
303	0.11
304	0.08
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.08
311	0.1
312	0.13
313	0.21
314	0.26
315	0.34
316	0.43
317	0.49
318	0.58
319	0.66
320	0.74
321	0.76
322	0.81
323	0.84
324	0.87
325	0.9
326	0.92
327	0.94
328	0.94
329	0.93
330	0.87
331	0.83
332	0.78
333	0.68
334	0.59
335	0.48
336	0.37
337	0.28
338	0.23
339	0.17
340	0.11
341	0.1
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.11
347	0.11
348	0.15
349	0.15
350	0.15
351	0.16
352	0.14
353	0.15
354	0.12
355	0.15
356	0.15
357	0.21
358	0.22
359	0.23
360	0.24
361	0.23
362	0.24
363	0.21
364	0.19
365	0.13
366	0.14
367	0.12
368	0.12
369	0.11
370	0.1
371	0.09
372	0.07
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.1
381	0.13
382	0.14
383	0.23
384	0.29
385	0.36
386	0.44
387	0.53
388	0.59
389	0.65
390	0.71
391	0.73
392	0.75
393	0.75
394	0.74
395	0.72
396	0.66
397	0.58
398	0.52
399	0.43
400	0.35
401	0.29
402	0.23
403	0.17
404	0.14
405	0.12
406	0.1
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.1
416	0.12
417	0.12
418	0.13
419	0.19
420	0.21
421	0.27
422	0.32
423	0.31
424	0.32
425	0.38
426	0.38
427	0.36
428	0.38
429	0.35
430	0.3
431	0.29
432	0.25
433	0.2
434	0.18
435	0.13
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.06
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.14
455	0.15
456	0.14
457	0.16
458	0.16
459	0.17
460	0.17
461	0.16
462	0.17
463	0.19
464	0.24
465	0.24
466	0.24
467	0.27
468	0.28
469	0.34
470	0.38
471	0.38
472	0.35
473	0.36
474	0.43
475	0.4
476	0.42
477	0.39
478	0.37
479	0.41
480	0.41
481	0.42
482	0.39
483	0.48
484	0.49
485	0.53
486	0.58
487	0.53
488	0.54
489	0.53
490	0.5
491	0.42
492	0.41
493	0.33
494	0.26
495	0.25
496	0.27
497	0.28
498	0.26
499	0.31
500	0.3
501	0.33
502	0.35
503	0.36
504	0.37
505	0.39
506	0.44
507	0.46
508	0.44
509	0.4
510	0.38
511	0.34
512	0.28
513	0.26
514	0.21
515	0.14
516	0.14
517	0.14
518	0.15
519	0.2
520	0.2
521	0.18
522	0.17
523	0.21
524	0.21
525	0.23
526	0.21
527	0.15
528	0.16
529	0.19
530	0.2
531	0.17
532	0.2
533	0.22
534	0.24
535	0.26
536	0.25
537	0.23
538	0.22
539	0.19
540	0.16
541	0.18
542	0.23
543	0.21
544	0.24
545	0.31
546	0.34
547	0.38
548	0.4
549	0.42
550	0.37
551	0.39
552	0.46
553	0.48
554	0.48
555	0.47
556	0.46
557	0.41
558	0.39
559	0.4
560	0.32
561	0.26
562	0.31
563	0.29
564	0.3
565	0.33
566	0.34
567	0.32
568	0.33
569	0.34
570	0.26
571	0.29
572	0.26
573	0.21
574	0.21
575	0.19
576	0.18
577	0.15
578	0.15
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.09
583	0.09
584	0.07
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.13
597	0.12
598	0.12
599	0.11
600	0.09
601	0.11
602	0.11
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.1
609	0.07
610	0.1
611	0.1
612	0.09
613	0.08
614	0.09
615	0.11
616	0.12
617	0.14
618	0.12
619	0.13
620	0.14
621	0.14
622	0.14
623	0.12
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.13
629	0.13
630	0.14
631	0.13
632	0.12
633	0.12
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.09
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.09
648	0.09
649	0.09
650	0.08
651	0.11
652	0.17
653	0.21
654	0.21
655	0.22
656	0.21
657	0.24
658	0.25
659	0.27
660	0.22
661	0.18
662	0.22
663	0.21
664	0.24
665	0.21
666	0.2
667	0.18
668	0.19
669	0.24
670	0.2
671	0.24
672	0.24
673	0.29
674	0.37
675	0.36
676	0.38
677	0.36
678	0.37
679	0.37
680	0.41
681	0.4
682	0.38
683	0.41
684	0.46
685	0.5
686	0.54
687	0.59
688	0.64
689	0.68
690	0.73
691	0.79
692	0.82
693	0.86
694	0.91
695	0.91
696	0.91
697	0.92
698	0.91
699	0.91
700	0.9
701	0.89
702	0.9
703	0.89
704	0.87
705	0.87
706	0.88
707	0.88
708	0.89
709	0.9
710	0.91
711	0.93
712	0.91
713	0.89
714	0.88
715	0.87
716	0.85
717	0.85
718	0.84
719	0.8
720	0.78
721	0.77
722	0.69
723	0.62
724	0.59
725	0.54
726	0.49
727	0.43
728	0.38
729	0.36
730	0.36
731	0.34
732	0.29
733	0.24
734	0.19
735	0.18
736	0.17
737	0.11
738	0.1
739	0.08
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.07
751	0.09
752	0.12
753	0.12
754	0.14
755	0.19
756	0.23
757	0.3
758	0.37
759	0.43
760	0.49
761	0.57
762	0.65
763	0.71
764	0.78
765	0.79
766	0.83
767	0.83
768	0.83
769	0.78
770	0.69
771	0.62
772	0.59
773	0.54
774	0.48
775	0.42
776	0.33
777	0.3
778	0.3
779	0.27
780	0.2
781	0.21
782	0.18
783	0.16
784	0.15
785	0.18
786	0.18
787	0.2
788	0.19
789	0.15
790	0.14
791	0.13
792	0.14
793	0.11
794	0.12
795	0.12
796	0.14
797	0.16
798	0.17
799	0.21
800	0.21
801	0.22
802	0.21
803	0.2
804	0.16
805	0.14
806	0.13
807	0.11
808	0.1
809	0.08
810	0.08
811	0.07
812	0.08
813	0.08
814	0.1
815	0.1
816	0.14
817	0.14
818	0.15
819	0.16
820	0.16
821	0.19
822	0.25
823	0.3
824	0.33
825	0.35
826	0.39
827	0.48
828	0.57
829	0.65
830	0.68
831	0.71
832	0.76
833	0.82
834	0.87
835	0.87
836	0.87
837	0.87
838	0.87
839	0.87
840	0.86
841	0.82
842	0.79
843	0.75
844	0.74
845	0.71
846	0.69
847	0.66
848	0.66
849	0.65
850	0.59
851	0.54
852	0.44
853	0.38
854	0.28
855	0.21
856	0.11
857	0.08
858	0.08
859	0.08
860	0.08

U5HGA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer