FuNGI

U5HCV3

Protein Details

Accession

U5HCV3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MPRPRQRRGADAKKEAKQLKR	Basic
693-714	LPLWERRREDWKTKMRQRDVEL	Hydrophilic
729-754	TLTASADDSKRKKRKKDEVDEIFETR	Hydrophilic
782-807	IEEASKRSEKVKKERAKERAKGAHDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-21	PRQRRGADAKKEAKQLKR
36-42	KRARHKK
738-744	KRKKRKK
787-802	KRSEKVKKERAKERAK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 8, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding

Amino Acid Sequences

MPRPRQRRGADAKKEAKQLKREQQEQAARAQELAEKRARHKKSEMPWTALPHRAVASTSNPANGDSQREDRPSGSGPAVPVDPNALPECDPDTKAYFQQVDQQIAEMESLGVGRQHRAVEGEEDEEDDRPLMLRSALEALSGNELALAGDTETSVILERLLYSMDDFAKRVLADRFTGNYDRLVRHQRASHVLQTLFMLAGETVDRETRGIIALPPTASTSSSSLPTMSTLVISIITELVPELPSLLYDSFGSHCLRALLLLVAGQAPTAEGQSGGAERSKRSLQFRKAQGSMKSFLGPADGAVDSSTDKGKKTRSVPKEFDDALKAMWTTLEVIETSSGVLSSSSAGIPGDGVRKAAMDAVAGPAVRILIELEAARPKGWRIGGWADRVLCGLIEEVKKPDTTTEARTNLREEYLGGLLRHPASAPTLETILQQAPDRIVKALWTNFFAGKLHRLAGNAVANFVVAVALSRLDKDLFVSAVEELSQIARERRAKWVDNSRTGVMKMLLERASALESAEKEVSDLILDTFGLHTPEERLLMIPCVLSLNRLEYYRKLPSHVTVEPTVQGSLLLQAFARLHAPHSQALYDSLSSFKIEALTPLTRNPTSSRLIDAFLDSPTTPPREIRGFLLSLIGHYHTLADDRIGSRLVEHCWAVADVFLKDKIAQSISQEGQLPFLQQSPWAHFWAKKLELPLWERRREDWKTKMRQRDVELKGLKTASEAAAAAATLTASADDSKRKKRKKDEVDEIFETRFKGKKSKVLTNGEGGEAGGEALVDVAAIEEASKRSEKVKKERAKERAKGAHDDGLDEVLEALKNVK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.82
3	0.8
4	0.78
5	0.79
6	0.78
7	0.79
8	0.79
9	0.77
10	0.79
11	0.8
12	0.72
13	0.69
14	0.64
15	0.54
16	0.48
17	0.42
18	0.37
19	0.31
20	0.35
21	0.34
22	0.33
23	0.41
24	0.51
25	0.54
26	0.55
27	0.59
28	0.63
29	0.66
30	0.73
31	0.71
32	0.68
33	0.69
34	0.7
35	0.68
36	0.66
37	0.57
38	0.48
39	0.43
40	0.37
41	0.33
42	0.28
43	0.27
44	0.27
45	0.27
46	0.28
47	0.27
48	0.27
49	0.3
50	0.28
51	0.3
52	0.28
53	0.32
54	0.35
55	0.38
56	0.39
57	0.35
58	0.37
59	0.35
60	0.33
61	0.3
62	0.27
63	0.24
64	0.25
65	0.25
66	0.22
67	0.19
68	0.18
69	0.16
70	0.17
71	0.18
72	0.17
73	0.16
74	0.17
75	0.22
76	0.21
77	0.22
78	0.22
79	0.25
80	0.26
81	0.28
82	0.33
83	0.3
84	0.27
85	0.35
86	0.37
87	0.37
88	0.34
89	0.32
90	0.27
91	0.26
92	0.25
93	0.16
94	0.11
95	0.07
96	0.07
97	0.06
98	0.08
99	0.08
100	0.1
101	0.13
102	0.13
103	0.14
104	0.16
105	0.18
106	0.19
107	0.2
108	0.21
109	0.18
110	0.19
111	0.19
112	0.18
113	0.16
114	0.13
115	0.11
116	0.09
117	0.1
118	0.09
119	0.09
120	0.08
121	0.09
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.14
128	0.14
129	0.12
130	0.09
131	0.09
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.04
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.06
149	0.07
150	0.09
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.15
156	0.14
157	0.17
158	0.18
159	0.17
160	0.18
161	0.2
162	0.22
163	0.24
164	0.27
165	0.24
166	0.26
167	0.28
168	0.28
169	0.31
170	0.38
171	0.37
172	0.39
173	0.42
174	0.42
175	0.45
176	0.47
177	0.46
178	0.44
179	0.4
180	0.36
181	0.33
182	0.29
183	0.22
184	0.17
185	0.12
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.15
210	0.15
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.1
216	0.09
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.09
237	0.09
238	0.12
239	0.13
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.03
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.09
264	0.1
265	0.1
266	0.14
267	0.17
268	0.21
269	0.29
270	0.38
271	0.43
272	0.51
273	0.57
274	0.6
275	0.61
276	0.63
277	0.6
278	0.55
279	0.5
280	0.43
281	0.37
282	0.3
283	0.25
284	0.21
285	0.15
286	0.1
287	0.1
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.1
295	0.09
296	0.1
297	0.14
298	0.17
299	0.23
300	0.31
301	0.4
302	0.47
303	0.55
304	0.59
305	0.59
306	0.62
307	0.56
308	0.5
309	0.43
310	0.34
311	0.24
312	0.21
313	0.17
314	0.11
315	0.09
316	0.08
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.08
339	0.07
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.07
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.11
367	0.12
368	0.11
369	0.13
370	0.19
371	0.22
372	0.24
373	0.26
374	0.23
375	0.22
376	0.22
377	0.18
378	0.11
379	0.08
380	0.06
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.12
390	0.14
391	0.19
392	0.24
393	0.27
394	0.29
395	0.3
396	0.31
397	0.27
398	0.25
399	0.2
400	0.14
401	0.11
402	0.11
403	0.12
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.09
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.09
427	0.08
428	0.08
429	0.12
430	0.14
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.15
435	0.16
436	0.16
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.12
444	0.16
445	0.18
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.12
450	0.11
451	0.1
452	0.06
453	0.02
454	0.03
455	0.02
456	0.03
457	0.03
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.07
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.13
477	0.17
478	0.18
479	0.26
480	0.31
481	0.34
482	0.4
483	0.49
484	0.51
485	0.53
486	0.55
487	0.49
488	0.45
489	0.42
490	0.36
491	0.27
492	0.21
493	0.15
494	0.16
495	0.15
496	0.13
497	0.13
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.1
502	0.08
503	0.08
504	0.11
505	0.11
506	0.1
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.07
511	0.07
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.08
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.11
536	0.12
537	0.14
538	0.15
539	0.17
540	0.22
541	0.29
542	0.29
543	0.28
544	0.29
545	0.31
546	0.35
547	0.35
548	0.33
549	0.27
550	0.28
551	0.26
552	0.25
553	0.21
554	0.15
555	0.13
556	0.09
557	0.1
558	0.09
559	0.08
560	0.07
561	0.08
562	0.09
563	0.09
564	0.11
565	0.08
566	0.1
567	0.15
568	0.17
569	0.18
570	0.19
571	0.19
572	0.17
573	0.19
574	0.19
575	0.14
576	0.13
577	0.12
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.13
586	0.16
587	0.16
588	0.19
589	0.23
590	0.22
591	0.24
592	0.25
593	0.26
594	0.27
595	0.27
596	0.28
597	0.25
598	0.26
599	0.25
600	0.24
601	0.2
602	0.16
603	0.17
604	0.13
605	0.13
606	0.15
607	0.18
608	0.16
609	0.16
610	0.2
611	0.23
612	0.24
613	0.26
614	0.27
615	0.24
616	0.24
617	0.26
618	0.21
619	0.18
620	0.18
621	0.15
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.08
626	0.1
627	0.09
628	0.08
629	0.1
630	0.11
631	0.12
632	0.13
633	0.12
634	0.13
635	0.15
636	0.16
637	0.16
638	0.16
639	0.14
640	0.15
641	0.15
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.09
646	0.11
647	0.12
648	0.11
649	0.12
650	0.13
651	0.15
652	0.15
653	0.16
654	0.16
655	0.23
656	0.23
657	0.25
658	0.28
659	0.25
660	0.26
661	0.26
662	0.24
663	0.18
664	0.18
665	0.16
666	0.16
667	0.19
668	0.22
669	0.25
670	0.26
671	0.29
672	0.29
673	0.33
674	0.38
675	0.39
676	0.35
677	0.36
678	0.36
679	0.4
680	0.43
681	0.5
682	0.5
683	0.53
684	0.53
685	0.54
686	0.59
687	0.6
688	0.63
689	0.63
690	0.65
691	0.69
692	0.76
693	0.83
694	0.82
695	0.82
696	0.8
697	0.8
698	0.74
699	0.73
700	0.69
701	0.6
702	0.55
703	0.48
704	0.42
705	0.32
706	0.3
707	0.2
708	0.17
709	0.16
710	0.11
711	0.11
712	0.11
713	0.1
714	0.07
715	0.06
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.07
721	0.09
722	0.18
723	0.26
724	0.37
725	0.47
726	0.56
727	0.66
728	0.75
729	0.84
730	0.87
731	0.9
732	0.91
733	0.91
734	0.9
735	0.85
736	0.77
737	0.67
738	0.58
739	0.48
740	0.41
741	0.36
742	0.3
743	0.35
744	0.37
745	0.44
746	0.5
747	0.59
748	0.64
749	0.68
750	0.69
751	0.67
752	0.63
753	0.55
754	0.48
755	0.37
756	0.28
757	0.18
758	0.14
759	0.07
760	0.05
761	0.04
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.04
770	0.06
771	0.07
772	0.11
773	0.12
774	0.13
775	0.22
776	0.29
777	0.39
778	0.48
779	0.58
780	0.64
781	0.73
782	0.82
783	0.85
784	0.88
785	0.86
786	0.86
787	0.85
788	0.81
789	0.78
790	0.73
791	0.69
792	0.58
793	0.52
794	0.43
795	0.34
796	0.29
797	0.21
798	0.17
799	0.11
800	0.11

U5HCV3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer