FuNGI

U5GZ71

Protein Details

Accession

U5GZ71

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
285-307	LQDGLVKRSKRKQKKKAAGEATS	Hydrophilic
417-442	RNVHKANQKICKRRKKVYPSLIKIYN	Hydrophilic
582-610	ASSGTASKALKKRKISRKKKVPFYDIAFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
291-303	KRSKRKQKKKAAG
589-601	KALKKRKISRKKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MADSAPIDFPVLKIINEARSTYGLRHQDFDRYQSHCSTKVHHLRRKLGLTQVAGKQKKYTKKDVTSMTITGSKHLQLVLFDTERAWAQSQHIQSTLSQSTNPATTKHHLLKRLSRSILRAAHLVSLVESLASRISPNQRAQTIAYHLVLQGQLAFTKQSHSQGLDTLSVAWVLLNDVANNAPAATDEALTNEMIDDVEPMLRFCAYSLQLDTSKGVAPTAQIIATDQLKHRFVPGYADLIEQVKKEAGQSEREKLDLSWRGNQIECRSPELVEVMLKVHSAIKTLQDGLVKRSKRKQKKKAAGEATSSEVNRAKKDAIGARRISTFDKALSVMSDAEGIARQAVEDNKIVLSKSHSPRFEASSSPLQLAHSYIVYQLLSVRTLRDVLLIKESSSKLAARETKMHRKEQDFIERTNGRNVHKANQKICKRRKKVYPSLIKIYNGIIYSLEQVRDLEDVERDGQLATKVEAQIAFVRASRCLYLSRTYALINEFASALALNARAKLYAREARSTLSTLDDEDMDHVDEIDFLAESLPLRESHFAALDASLNQDYDRFANDWFNATGGRIHEPEDLPVGAMSLEASSGTASKALKKRKISRKKKVPFYDIAFSYVTAYDMDEIARRAGLLGPVEEGVTSPTADAMDQGEAEEAEEEEEMEEEEEEKPVKAKKSGWGFGSLFGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.28
3	0.3
4	0.31
5	0.26
6	0.29
7	0.31
8	0.3
9	0.34
10	0.37
11	0.36
12	0.39
13	0.38
14	0.44
15	0.45
16	0.47
17	0.45
18	0.41
19	0.42
20	0.46
21	0.48
22	0.44
23	0.44
24	0.45
25	0.49
26	0.56
27	0.63
28	0.63
29	0.68
30	0.71
31	0.77
32	0.78
33	0.72
34	0.7
35	0.66
36	0.63
37	0.61
38	0.59
39	0.61
40	0.57
41	0.54
42	0.54
43	0.55
44	0.61
45	0.61
46	0.65
47	0.65
48	0.7
49	0.76
50	0.76
51	0.74
52	0.69
53	0.63
54	0.56
55	0.51
56	0.42
57	0.37
58	0.32
59	0.26
60	0.22
61	0.22
62	0.19
63	0.15
64	0.18
65	0.22
66	0.2
67	0.19
68	0.18
69	0.19
70	0.18
71	0.2
72	0.18
73	0.14
74	0.17
75	0.23
76	0.26
77	0.27
78	0.27
79	0.26
80	0.25
81	0.3
82	0.3
83	0.24
84	0.22
85	0.21
86	0.22
87	0.26
88	0.26
89	0.21
90	0.24
91	0.26
92	0.35
93	0.42
94	0.45
95	0.48
96	0.54
97	0.61
98	0.65
99	0.7
100	0.67
101	0.62
102	0.6
103	0.61
104	0.59
105	0.51
106	0.44
107	0.36
108	0.33
109	0.3
110	0.26
111	0.18
112	0.14
113	0.11
114	0.09
115	0.08
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.11
121	0.18
122	0.24
123	0.29
124	0.34
125	0.35
126	0.37
127	0.39
128	0.38
129	0.36
130	0.33
131	0.29
132	0.24
133	0.23
134	0.23
135	0.21
136	0.16
137	0.12
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.08
143	0.11
144	0.13
145	0.16
146	0.18
147	0.2
148	0.2
149	0.22
150	0.24
151	0.22
152	0.2
153	0.16
154	0.14
155	0.12
156	0.11
157	0.08
158	0.06
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.14
195	0.17
196	0.18
197	0.19
198	0.19
199	0.16
200	0.16
201	0.14
202	0.13
203	0.1
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.12
212	0.13
213	0.14
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.21
218	0.2
219	0.19
220	0.22
221	0.21
222	0.2
223	0.19
224	0.19
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.14
229	0.13
230	0.1
231	0.09
232	0.1
233	0.14
234	0.14
235	0.21
236	0.25
237	0.29
238	0.3
239	0.3
240	0.3
241	0.25
242	0.31
243	0.3
244	0.29
245	0.3
246	0.32
247	0.33
248	0.34
249	0.37
250	0.32
251	0.33
252	0.31
253	0.29
254	0.28
255	0.26
256	0.25
257	0.23
258	0.2
259	0.13
260	0.12
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.09
266	0.08
267	0.09
268	0.1
269	0.11
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.15
274	0.16
275	0.19
276	0.25
277	0.26
278	0.29
279	0.38
280	0.46
281	0.54
282	0.64
283	0.71
284	0.75
285	0.83
286	0.88
287	0.89
288	0.87
289	0.8
290	0.72
291	0.63
292	0.54
293	0.46
294	0.36
295	0.28
296	0.24
297	0.21
298	0.18
299	0.18
300	0.16
301	0.14
302	0.19
303	0.22
304	0.24
305	0.29
306	0.29
307	0.29
308	0.3
309	0.31
310	0.28
311	0.24
312	0.2
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.03
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.11
339	0.18
340	0.24
341	0.29
342	0.29
343	0.31
344	0.33
345	0.37
346	0.34
347	0.27
348	0.26
349	0.25
350	0.26
351	0.24
352	0.22
353	0.19
354	0.18
355	0.17
356	0.13
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.15
375	0.15
376	0.15
377	0.19
378	0.19
379	0.16
380	0.16
381	0.16
382	0.13
383	0.19
384	0.22
385	0.21
386	0.29
387	0.35
388	0.44
389	0.49
390	0.54
391	0.53
392	0.52
393	0.55
394	0.54
395	0.57
396	0.49
397	0.46
398	0.48
399	0.46
400	0.44
401	0.45
402	0.42
403	0.33
404	0.37
405	0.38
406	0.37
407	0.41
408	0.47
409	0.47
410	0.53
411	0.6
412	0.64
413	0.72
414	0.75
415	0.75
416	0.78
417	0.81
418	0.82
419	0.84
420	0.84
421	0.84
422	0.8
423	0.8
424	0.75
425	0.66
426	0.56
427	0.46
428	0.39
429	0.28
430	0.22
431	0.15
432	0.11
433	0.13
434	0.14
435	0.13
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.09
442	0.08
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.09
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.14
458	0.15
459	0.15
460	0.14
461	0.14
462	0.14
463	0.16
464	0.15
465	0.13
466	0.14
467	0.16
468	0.18
469	0.19
470	0.19
471	0.19
472	0.19
473	0.2
474	0.19
475	0.17
476	0.14
477	0.12
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.18
492	0.23
493	0.25
494	0.28
495	0.29
496	0.3
497	0.31
498	0.31
499	0.24
500	0.21
501	0.18
502	0.16
503	0.16
504	0.14
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.1
509	0.1
510	0.09
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.05
516	0.04
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.07
522	0.08
523	0.1
524	0.12
525	0.12
526	0.14
527	0.15
528	0.14
529	0.13
530	0.13
531	0.13
532	0.11
533	0.13
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.11
539	0.1
540	0.13
541	0.11
542	0.12
543	0.16
544	0.17
545	0.2
546	0.19
547	0.19
548	0.16
549	0.16
550	0.18
551	0.15
552	0.19
553	0.16
554	0.18
555	0.22
556	0.22
557	0.23
558	0.23
559	0.21
560	0.17
561	0.17
562	0.14
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.08
574	0.09
575	0.18
576	0.25
577	0.35
578	0.43
579	0.52
580	0.63
581	0.71
582	0.82
583	0.85
584	0.89
585	0.9
586	0.93
587	0.94
588	0.93
589	0.89
590	0.87
591	0.82
592	0.79
593	0.69
594	0.62
595	0.52
596	0.42
597	0.36
598	0.28
599	0.21
600	0.13
601	0.12
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.11
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.14
613	0.14
614	0.13
615	0.14
616	0.14
617	0.14
618	0.13
619	0.12
620	0.1
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.1
633	0.09
634	0.1
635	0.09
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.1
648	0.11
649	0.12
650	0.15
651	0.21
652	0.25
653	0.29
654	0.33
655	0.4
656	0.49
657	0.54
658	0.52
659	0.55
660	0.51
661	0.52

U5GZ71

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer