Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HCA4

Protein Details
Accession U5HCA4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-121GQKGKGKSKGKSKGKGKNRTRSKTGKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-118KGKGKSKGKSKGKGKNRTRSKT
Subcellular Location(s) mito 6, cyto 5.5, extr 5, cyto_nucl 4.5, golg 4, nucl 2.5, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15859  SNARE_SYN8  
Amino Acid Sequences MAPPSSTIPSAARLSSLATSTLSQILELTRAAQLSLPSTSLSSTISKNLSQLYRGIELLDGQDSESPQVMTELKSQYQRLIKLVEPLGVEVEFDGQKGKGKSKGKSKGKGKNRTRSKTGKLVDAGNDGSDEPFGLGDDGDSDDERSDDQGDDDDDDDDDDDDDGALSPNQSGVALHTLSSARNPHVAIKFPPNPESELEQMEEDEETLRRANAEVVQMQKRMIEDQDETLNSLSSAIARQHSLSQHISSELELQSGLLDETDSAIDRTQIGLRRASGRLNQFTRKAKETGSTGLIIGLVVLLLILIIAFKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.15
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.22
35 0.26
36 0.25
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.25
41 0.24
42 0.23
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.11
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.16
59 0.19
60 0.21
61 0.25
62 0.26
63 0.3
64 0.34
65 0.34
66 0.31
67 0.31
68 0.29
69 0.31
70 0.32
71 0.28
72 0.24
73 0.22
74 0.21
75 0.17
76 0.16
77 0.09
78 0.11
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.24
87 0.3
88 0.36
89 0.46
90 0.56
91 0.61
92 0.69
93 0.75
94 0.77
95 0.82
96 0.86
97 0.85
98 0.85
99 0.87
100 0.84
101 0.82
102 0.81
103 0.76
104 0.75
105 0.67
106 0.62
107 0.54
108 0.49
109 0.42
110 0.36
111 0.31
112 0.21
113 0.19
114 0.13
115 0.11
116 0.09
117 0.07
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.17
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.28
176 0.33
177 0.33
178 0.35
179 0.31
180 0.31
181 0.31
182 0.31
183 0.25
184 0.21
185 0.2
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.15
202 0.2
203 0.23
204 0.24
205 0.24
206 0.23
207 0.21
208 0.2
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.16
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.16
228 0.18
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.18
236 0.21
237 0.17
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.14
256 0.19
257 0.21
258 0.24
259 0.26
260 0.31
261 0.32
262 0.35
263 0.38
264 0.4
265 0.47
266 0.51
267 0.55
268 0.58
269 0.65
270 0.66
271 0.64
272 0.58
273 0.51
274 0.51
275 0.48
276 0.45
277 0.39
278 0.34
279 0.29
280 0.27
281 0.25
282 0.18
283 0.14
284 0.09
285 0.05
286 0.03
287 0.03
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.02