FuNGI

U5HJH8

Protein Details

Accession

U5HJH8

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-439	RRAAKEREQIRRERKKEREREMRMSNM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
215-237	RFKGKKIPRGPPSPPPPVLRSPP
414-432	RAAKEREQIRRERKKERER

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MATLLSSLPAPRHLVNADGDDADDVAKVPGVQGSSSSSVLTTTARVIPAYGQRKGWRPTQMTDFGDGGSYPECHVAQYPLEMGRKSKSNSGNTLALQVDADGNVRYDAIAQQGHRDGRLVQSSFKDLIPMVNRTDIKVRDMERPSEEEVQTTAERTKAALEKLVQGKIKAAQPNNVPNSQGEISFMRYTPQQGDGTQQRIIKMTEVVEDPLEPPRFKGKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRKVTAQDQKDWMIPPCVSNWKNNKGFTIPLDKRLAADGRGLQDVLINDRFAQFSEALYIADRHAREEVRQRSLMQQKIAQKEKEAKEEHLRMLAQRAREERSGIVSSHAPARVVAGAEGGSMPSALAGYGSDSDSDANSTTQSPPPRRIAADERSGEDSASEGESEGDENETEEDRRAAKEREQIRRERKKEREREMRMSNMGTEQRAKVLARATGRDISEKIALGLAKPTLSKEAMLDSRLFNQEQLNTSFGDDDSYNIYDKPLFSGSSAAAAIYRPRGANIDDEGNDVSLEDGISKSMQNDRFGLGVAGRGFQGSDLAEVRDGPVAFEKDTADPFGVDAFLETAKAGNPKRGLDVKDDAARKRARD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.26
3	0.27
4	0.26
5	0.22
6	0.22
7	0.18
8	0.17
9	0.14
10	0.11
11	0.09
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.09
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.15
21	0.17
22	0.18
23	0.17
24	0.15
25	0.15
26	0.16
27	0.16
28	0.12
29	0.12
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.15
34	0.19
35	0.28
36	0.33
37	0.33
38	0.36
39	0.41
40	0.49
41	0.52
42	0.55
43	0.55
44	0.53
45	0.55
46	0.58
47	0.6
48	0.55
49	0.54
50	0.48
51	0.38
52	0.34
53	0.29
54	0.22
55	0.15
56	0.13
57	0.11
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.15
62	0.16
63	0.15
64	0.16
65	0.18
66	0.2
67	0.24
68	0.24
69	0.25
70	0.27
71	0.32
72	0.33
73	0.38
74	0.41
75	0.45
76	0.49
77	0.52
78	0.53
79	0.47
80	0.48
81	0.4
82	0.32
83	0.25
84	0.2
85	0.15
86	0.11
87	0.12
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.08
94	0.08
95	0.11
96	0.14
97	0.13
98	0.18
99	0.23
100	0.24
101	0.24
102	0.24
103	0.21
104	0.24
105	0.3
106	0.27
107	0.26
108	0.27
109	0.31
110	0.31
111	0.3
112	0.26
113	0.19
114	0.24
115	0.24
116	0.25
117	0.22
118	0.28
119	0.28
120	0.28
121	0.35
122	0.31
123	0.29
124	0.32
125	0.33
126	0.35
127	0.38
128	0.4
129	0.37
130	0.39
131	0.41
132	0.42
133	0.39
134	0.31
135	0.28
136	0.28
137	0.25
138	0.23
139	0.19
140	0.14
141	0.14
142	0.13
143	0.17
144	0.17
145	0.18
146	0.2
147	0.2
148	0.27
149	0.31
150	0.36
151	0.32
152	0.29
153	0.3
154	0.3
155	0.35
156	0.34
157	0.31
158	0.32
159	0.37
160	0.45
161	0.47
162	0.44
163	0.4
164	0.33
165	0.37
166	0.32
167	0.26
168	0.19
169	0.16
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.15
174	0.15
175	0.17
176	0.17
177	0.2
178	0.17
179	0.16
180	0.23
181	0.27
182	0.29
183	0.31
184	0.3
185	0.27
186	0.27
187	0.27
188	0.22
189	0.19
190	0.16
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.12
197	0.17
198	0.19
199	0.16
200	0.17
201	0.27
202	0.28
203	0.29
204	0.38
205	0.42
206	0.51
207	0.59
208	0.67
209	0.65
210	0.71
211	0.75
212	0.74
213	0.71
214	0.68
215	0.63
216	0.57
217	0.54
218	0.51
219	0.53
220	0.53
221	0.55
222	0.53
223	0.57
224	0.56
225	0.54
226	0.51
227	0.54
228	0.55
229	0.52
230	0.49
231	0.45
232	0.43
233	0.43
234	0.42
235	0.34
236	0.26
237	0.2
238	0.18
239	0.17
240	0.24
241	0.23
242	0.3
243	0.36
244	0.42
245	0.46
246	0.47
247	0.46
248	0.39
249	0.39
250	0.34
251	0.38
252	0.3
253	0.31
254	0.32
255	0.3
256	0.29
257	0.3
258	0.28
259	0.18
260	0.19
261	0.16
262	0.15
263	0.15
264	0.14
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.13
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.11
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.1
285	0.1
286	0.09
287	0.11
288	0.12
289	0.14
290	0.22
291	0.27
292	0.28
293	0.29
294	0.29
295	0.35
296	0.41
297	0.42
298	0.35
299	0.35
300	0.37
301	0.43
302	0.47
303	0.4
304	0.36
305	0.42
306	0.43
307	0.46
308	0.42
309	0.38
310	0.4
311	0.43
312	0.41
313	0.35
314	0.32
315	0.25
316	0.3
317	0.28
318	0.22
319	0.22
320	0.24
321	0.25
322	0.25
323	0.26
324	0.2
325	0.22
326	0.22
327	0.18
328	0.17
329	0.15
330	0.15
331	0.17
332	0.17
333	0.13
334	0.11
335	0.12
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.02
350	0.02
351	0.02
352	0.03
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.14
366	0.21
367	0.24
368	0.29
369	0.33
370	0.35
371	0.34
372	0.38
373	0.41
374	0.39
375	0.44
376	0.4
377	0.38
378	0.39
379	0.38
380	0.32
381	0.24
382	0.19
383	0.12
384	0.11
385	0.09
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.1
400	0.12
401	0.16
402	0.17
403	0.21
404	0.29
405	0.37
406	0.46
407	0.51
408	0.59
409	0.66
410	0.74
411	0.76
412	0.79
413	0.81
414	0.82
415	0.86
416	0.87
417	0.87
418	0.84
419	0.86
420	0.82
421	0.77
422	0.69
423	0.6
424	0.5
425	0.44
426	0.38
427	0.31
428	0.28
429	0.22
430	0.21
431	0.23
432	0.22
433	0.19
434	0.2
435	0.22
436	0.22
437	0.24
438	0.26
439	0.28
440	0.29
441	0.29
442	0.26
443	0.25
444	0.24
445	0.22
446	0.18
447	0.16
448	0.15
449	0.13
450	0.14
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.18
460	0.19
461	0.21
462	0.21
463	0.19
464	0.24
465	0.26
466	0.26
467	0.21
468	0.22
469	0.24
470	0.26
471	0.27
472	0.23
473	0.21
474	0.21
475	0.2
476	0.17
477	0.16
478	0.12
479	0.11
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.16
488	0.15
489	0.14
490	0.14
491	0.16
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.12
496	0.11
497	0.11
498	0.13
499	0.14
500	0.16
501	0.14
502	0.15
503	0.17
504	0.18
505	0.21
506	0.22
507	0.25
508	0.23
509	0.25
510	0.25
511	0.22
512	0.21
513	0.17
514	0.14
515	0.08
516	0.08
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.08
522	0.1
523	0.18
524	0.22
525	0.24
526	0.26
527	0.26
528	0.26
529	0.26
530	0.25
531	0.17
532	0.17
533	0.15
534	0.14
535	0.13
536	0.13
537	0.12
538	0.11
539	0.12
540	0.08
541	0.1
542	0.11
543	0.12
544	0.12
545	0.13
546	0.14
547	0.16
548	0.16
549	0.14
550	0.19
551	0.2
552	0.2
553	0.22
554	0.23
555	0.21
556	0.23
557	0.24
558	0.19
559	0.17
560	0.16
561	0.16
562	0.13
563	0.11
564	0.1
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.1
571	0.18
572	0.19
573	0.25
574	0.29
575	0.31
576	0.39
577	0.45
578	0.45
579	0.44
580	0.49
581	0.48
582	0.52
583	0.56
584	0.51
585	0.53

U5HJH8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer