FuNGI

U5HCN5

Protein Details

Accession

U5HCN5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
491-510	RPNDRRCKPLVCRRRMREDD	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR007275 YTH_domain IPR045168 YTH_prot
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF04146 YTH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50882 YTH
CDD	cd00590 RRM_SF cd21134 YTH

Amino Acid Sequences

MTNPHPGSADTTCTPRYPADGTENSTSVRTAAFDASTNGFTTATSLEPWQDAFPWSPFDRGAASSRAFPGRAEAELNSEWSSSFPSLGSTTPSRPLQQPRGSYASADLGSARSHDFSSRDSSASSSYVAVDHPPSTAPPLTAHSVFDPWASETSNGPNRLSSARTALAPRIQDRNASRYISQVAILASTPHADPPPPPILSSYAFSNHPRIDLLSPVPLGDSTFSAPAGSQQSAYASSLTPSSNAPLLTRNSDLRPSSAPWSVAGGSPSAPPHAAMGIHMPLPPIRPADWSAPLLPPTQAIQGGSTRSQSPHELSLTRESYETSPYALFPRSWYRAPLGTSPAHLESDRSGARAASPAMVTISGPPQLLHLRSANEQLPPLPLSRSNSDSATVSAPVPVTASSRPGETRLRSGLPDRSTWAMWCGNIPSDATEAELLDFFAVRGVSAATAADLYGVESIHLIARSNCAFVNYSSEFLMQQAITRSNGVSLRPNDRRCKPLVCRRRMREDDAKSGVGAQRGAGLHLSYIAAQALDLGKKGVRTTNDSRAIDEESGDSSGDSTASTRSSFFSEYFPKRFFVLKAKESEHLQESIRSGLWSTQGHNEDVLDQAFRTSLEGVFLFFSANRSGGFAGYARMIGPIFTPPRDRTGSRHFSPHLAEADKVIIVAEGGTPFPVQWLSTRHLPFTRTRSILNSFNNHREVKISRDGTEIEPNAGLALLRLWD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.27
3	0.29
4	0.27
5	0.29
6	0.33
7	0.35
8	0.39
9	0.41
10	0.41
11	0.38
12	0.36
13	0.31
14	0.23
15	0.19
16	0.15
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.14
21	0.17
22	0.2
23	0.2
24	0.2
25	0.18
26	0.16
27	0.14
28	0.15
29	0.14
30	0.12
31	0.12
32	0.12
33	0.13
34	0.14
35	0.16
36	0.15
37	0.15
38	0.16
39	0.18
40	0.18
41	0.23
42	0.23
43	0.24
44	0.23
45	0.23
46	0.23
47	0.23
48	0.25
49	0.24
50	0.24
51	0.26
52	0.3
53	0.31
54	0.29
55	0.26
56	0.28
57	0.25
58	0.25
59	0.24
60	0.21
61	0.23
62	0.23
63	0.26
64	0.21
65	0.19
66	0.17
67	0.16
68	0.19
69	0.14
70	0.14
71	0.11
72	0.13
73	0.14
74	0.15
75	0.19
76	0.19
77	0.21
78	0.27
79	0.3
80	0.31
81	0.37
82	0.46
83	0.51
84	0.54
85	0.56
86	0.56
87	0.59
88	0.56
89	0.49
90	0.42
91	0.37
92	0.29
93	0.25
94	0.2
95	0.15
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.11
100	0.12
101	0.14
102	0.15
103	0.17
104	0.23
105	0.24
106	0.24
107	0.23
108	0.24
109	0.23
110	0.22
111	0.21
112	0.14
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.15
126	0.18
127	0.22
128	0.22
129	0.23
130	0.2
131	0.2
132	0.19
133	0.18
134	0.16
135	0.13
136	0.14
137	0.14
138	0.13
139	0.14
140	0.21
141	0.28
142	0.28
143	0.27
144	0.26
145	0.27
146	0.29
147	0.29
148	0.23
149	0.21
150	0.2
151	0.22
152	0.24
153	0.25
154	0.26
155	0.28
156	0.29
157	0.31
158	0.3
159	0.35
160	0.36
161	0.38
162	0.38
163	0.37
164	0.34
165	0.31
166	0.33
167	0.27
168	0.24
169	0.2
170	0.16
171	0.14
172	0.13
173	0.11
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.1
181	0.15
182	0.21
183	0.2
184	0.2
185	0.2
186	0.23
187	0.25
188	0.26
189	0.21
190	0.18
191	0.21
192	0.23
193	0.26
194	0.23
195	0.22
196	0.21
197	0.21
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.16
202	0.16
203	0.15
204	0.15
205	0.13
206	0.12
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.11
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.13
221	0.14
222	0.12
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.14
234	0.16
235	0.18
236	0.2
237	0.21
238	0.21
239	0.25
240	0.25
241	0.23
242	0.24
243	0.23
244	0.25
245	0.25
246	0.23
247	0.19
248	0.21
249	0.19
250	0.18
251	0.16
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.08
262	0.07
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.15
275	0.18
276	0.2
277	0.2
278	0.2
279	0.2
280	0.21
281	0.2
282	0.17
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.11
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.15
296	0.15
297	0.16
298	0.17
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.24
303	0.24
304	0.22
305	0.2
306	0.19
307	0.17
308	0.19
309	0.17
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.13
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.18
318	0.2
319	0.21
320	0.22
321	0.22
322	0.23
323	0.25
324	0.25
325	0.23
326	0.2
327	0.2
328	0.21
329	0.2
330	0.18
331	0.16
332	0.14
333	0.11
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.11
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.12
357	0.13
358	0.13
359	0.14
360	0.18
361	0.17
362	0.16
363	0.16
364	0.14
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.11
369	0.12
370	0.14
371	0.16
372	0.19
373	0.19
374	0.18
375	0.19
376	0.18
377	0.17
378	0.15
379	0.13
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.08
387	0.07
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.14
393	0.19
394	0.18
395	0.22
396	0.22
397	0.23
398	0.23
399	0.26
400	0.29
401	0.26
402	0.26
403	0.24
404	0.23
405	0.22
406	0.21
407	0.21
408	0.16
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.03
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.12
456	0.11
457	0.18
458	0.16
459	0.16
460	0.16
461	0.17
462	0.15
463	0.14
464	0.16
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.12
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.14
473	0.15
474	0.15
475	0.2
476	0.22
477	0.3
478	0.38
479	0.45
480	0.5
481	0.53
482	0.56
483	0.53
484	0.58
485	0.59
486	0.62
487	0.66
488	0.68
489	0.74
490	0.75
491	0.82
492	0.79
493	0.77
494	0.76
495	0.72
496	0.7
497	0.63
498	0.57
499	0.46
500	0.44
501	0.38
502	0.3
503	0.24
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.16
508	0.13
509	0.11
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.1
525	0.12
526	0.15
527	0.16
528	0.23
529	0.3
530	0.38
531	0.47
532	0.46
533	0.46
534	0.44
535	0.45
536	0.37
537	0.31
538	0.23
539	0.15
540	0.15
541	0.13
542	0.11
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.11
553	0.13
554	0.15
555	0.15
556	0.2
557	0.28
558	0.34
559	0.38
560	0.38
561	0.37
562	0.37
563	0.39
564	0.37
565	0.37
566	0.39
567	0.4
568	0.45
569	0.47
570	0.48
571	0.47
572	0.48
573	0.41
574	0.35
575	0.31
576	0.27
577	0.26
578	0.25
579	0.23
580	0.19
581	0.16
582	0.16
583	0.2
584	0.18
585	0.19
586	0.25
587	0.27
588	0.27
589	0.27
590	0.25
591	0.21
592	0.21
593	0.2
594	0.13
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.09
599	0.1
600	0.09
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.11
614	0.12
615	0.11
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.15
627	0.18
628	0.2
629	0.26
630	0.27
631	0.33
632	0.38
633	0.4
634	0.4
635	0.47
636	0.54
637	0.51
638	0.57
639	0.53
640	0.52
641	0.53
642	0.52
643	0.47
644	0.4
645	0.37
646	0.3
647	0.3
648	0.25
649	0.21
650	0.16
651	0.1
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.07
656	0.07
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.09
661	0.1
662	0.09
663	0.12
664	0.17
665	0.21
666	0.3
667	0.32
668	0.36
669	0.39
670	0.42
671	0.45
672	0.48
673	0.52
674	0.46
675	0.47
676	0.48
677	0.5
678	0.55
679	0.54
680	0.56
681	0.54
682	0.59
683	0.63
684	0.58
685	0.53
686	0.51
687	0.46
688	0.44
689	0.47
690	0.43
691	0.38
692	0.41
693	0.43
694	0.41
695	0.47
696	0.41
697	0.33
698	0.3
699	0.28
700	0.25
701	0.22
702	0.17
703	0.08

U5HCN5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer