Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GZJ6

Protein Details
Accession U5GZJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-153AQQGETKPKKRNARSKKGARRPRTDAEBasic
181-203ASGERKRASRARKSKKKTTTTDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-149KPKKRNARSKKGARRPR
184-197ERKRASRARKSKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 13.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSAAPITEAIQANSAQEVGHKVFAGNLSFQTKDADLEQAFAVHGKVTEAQVIMRGQRSRGYGFVTFASETDATAAVAALDKSDLQGRQINVELAKPPTESTAGRATREAAQKATDKGLGEDEDAGEAQQGETKPKKRNARSKKGARRPRTDAETEEAGDAPLEGATGENGELVAGTDDAAASGERKRASRARKSKKKTTTTDGEATYATNEDGAANEGDSTRPARTPRRRGPPEGSPSKTLLFFSNLSFSTTDESLKEALKDFDVVSAVVIKRPYGPTAGRSKGFAFVDFKDEKSQQRALEEVQGRDIEGRNVSVKVAIQEEKKEEAAQAMPTDEGVAPAQEQEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.1
3 0.11
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.18
10 0.21
11 0.21
12 0.18
13 0.2
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.23
18 0.2
19 0.2
20 0.19
21 0.21
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.1
33 0.1
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.22
41 0.23
42 0.22
43 0.26
44 0.29
45 0.27
46 0.28
47 0.29
48 0.25
49 0.26
50 0.26
51 0.24
52 0.21
53 0.19
54 0.21
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.22
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.17
86 0.15
87 0.16
88 0.24
89 0.24
90 0.25
91 0.25
92 0.25
93 0.29
94 0.34
95 0.32
96 0.24
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.29
101 0.24
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.17
106 0.15
107 0.13
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.13
118 0.19
119 0.25
120 0.32
121 0.4
122 0.5
123 0.56
124 0.67
125 0.73
126 0.78
127 0.82
128 0.86
129 0.89
130 0.9
131 0.91
132 0.89
133 0.86
134 0.82
135 0.78
136 0.72
137 0.64
138 0.55
139 0.49
140 0.42
141 0.35
142 0.28
143 0.21
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.06
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.02
158 0.02
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.05
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.15
174 0.21
175 0.29
176 0.39
177 0.49
178 0.58
179 0.67
180 0.75
181 0.81
182 0.84
183 0.85
184 0.81
185 0.77
186 0.73
187 0.69
188 0.65
189 0.56
190 0.47
191 0.38
192 0.32
193 0.25
194 0.18
195 0.12
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.11
210 0.15
211 0.26
212 0.35
213 0.46
214 0.54
215 0.64
216 0.69
217 0.73
218 0.75
219 0.74
220 0.74
221 0.72
222 0.66
223 0.58
224 0.54
225 0.49
226 0.44
227 0.35
228 0.27
229 0.22
230 0.19
231 0.17
232 0.19
233 0.18
234 0.19
235 0.18
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.16
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.21
264 0.25
265 0.34
266 0.39
267 0.36
268 0.37
269 0.37
270 0.38
271 0.37
272 0.34
273 0.29
274 0.25
275 0.31
276 0.3
277 0.3
278 0.3
279 0.33
280 0.35
281 0.37
282 0.41
283 0.36
284 0.37
285 0.37
286 0.33
287 0.39
288 0.39
289 0.34
290 0.33
291 0.31
292 0.29
293 0.29
294 0.29
295 0.22
296 0.19
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.21
305 0.24
306 0.25
307 0.3
308 0.33
309 0.35
310 0.35
311 0.33
312 0.29
313 0.28
314 0.26
315 0.24
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.11
325 0.1