Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HD46

Protein Details
Accession U5HD46    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-490FYIDRSRWRTQRRAQRQREQEADDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MYGGGPPPGFRPPPGFGAPPSAAAGASPRAGGSYGPAGGNPNPNYAPSPPPVGGPMNRYPPRHAGIGSAPPGFHHHQPQGSPNSFQGGQHQQQQQQQQQQQQQYPPPPGFPHDPGMMGGGGPPPGFVPQLSQERFKLFVGKIAEMSDGWLNKLLEIAGPVLSVTRPARPMAFVEYGDPEVVLRALEVLNGAAISYPSGKSDALLIKTDDKVRARLDEYEKTRVNDNSQADLLEQAKNDLRVIADRIKKGESPSAARAPLGDSAEPDDDGIPAHLRDLAPEDLPEHHREAITSEIAMFREIAFKKAAEKKAVQLKREQEAVTNRILAERRSVPTGPARSNSHPSLAGASSSAPPSASSKSAPGPTDAPSDDPQSYNKPVTFVSEGTGLDDAQKERERAERAYRDAEALFHERERRFEQRERQRINNYDRERARERAEEEREARERDVMLDRLARWDDEAEVERGRELFYIDRSRWRTQRRAQRQREQEADDLDRQREKEEYEAAAKQGDAFLDQLGFLAPPSGLDVKLKLEPTVIKAAIKPAKPATSLLGLADDDEEGKTKRALIPLVYDDDGGGGAEDGKSSKERKEDLEARIPRSKDEVFAWPIYWSGLSEALITKELVPFTTSMIVESLGFEEEELLSAVMTHIRRHAAPHALIEELEPVLDEETSEFVVKFWRELILRTELSKKGGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.35
4 0.41
5 0.39
6 0.35
7 0.33
8 0.27
9 0.22
10 0.19
11 0.21
12 0.15
13 0.15
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.19
25 0.22
26 0.3
27 0.29
28 0.3
29 0.28
30 0.3
31 0.33
32 0.32
33 0.34
34 0.28
35 0.33
36 0.28
37 0.29
38 0.31
39 0.33
40 0.33
41 0.35
42 0.39
43 0.44
44 0.49
45 0.51
46 0.52
47 0.53
48 0.53
49 0.5
50 0.43
51 0.37
52 0.37
53 0.42
54 0.4
55 0.35
56 0.31
57 0.29
58 0.34
59 0.34
60 0.32
61 0.32
62 0.34
63 0.37
64 0.4
65 0.47
66 0.51
67 0.5
68 0.48
69 0.41
70 0.41
71 0.37
72 0.35
73 0.35
74 0.35
75 0.35
76 0.42
77 0.47
78 0.47
79 0.52
80 0.61
81 0.61
82 0.61
83 0.64
84 0.64
85 0.66
86 0.69
87 0.69
88 0.67
89 0.67
90 0.63
91 0.64
92 0.57
93 0.53
94 0.47
95 0.46
96 0.45
97 0.4
98 0.39
99 0.33
100 0.32
101 0.29
102 0.28
103 0.23
104 0.17
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.09
114 0.11
115 0.16
116 0.26
117 0.28
118 0.31
119 0.32
120 0.34
121 0.36
122 0.33
123 0.34
124 0.25
125 0.28
126 0.28
127 0.28
128 0.26
129 0.25
130 0.25
131 0.18
132 0.2
133 0.18
134 0.14
135 0.14
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.2
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.17
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.13
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.24
194 0.27
195 0.27
196 0.25
197 0.27
198 0.27
199 0.29
200 0.28
201 0.32
202 0.36
203 0.39
204 0.41
205 0.45
206 0.46
207 0.44
208 0.46
209 0.41
210 0.39
211 0.37
212 0.35
213 0.3
214 0.28
215 0.27
216 0.23
217 0.23
218 0.21
219 0.16
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.15
229 0.2
230 0.24
231 0.25
232 0.27
233 0.28
234 0.29
235 0.3
236 0.31
237 0.27
238 0.26
239 0.3
240 0.32
241 0.31
242 0.29
243 0.27
244 0.24
245 0.23
246 0.2
247 0.15
248 0.11
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.16
270 0.18
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.06
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.2
291 0.28
292 0.31
293 0.28
294 0.29
295 0.33
296 0.42
297 0.46
298 0.41
299 0.4
300 0.41
301 0.4
302 0.42
303 0.37
304 0.31
305 0.32
306 0.33
307 0.28
308 0.24
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.17
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.23
320 0.27
321 0.25
322 0.26
323 0.29
324 0.29
325 0.34
326 0.33
327 0.29
328 0.25
329 0.23
330 0.21
331 0.17
332 0.14
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.14
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.2
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.19
356 0.18
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.2
362 0.19
363 0.18
364 0.17
365 0.2
366 0.19
367 0.16
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.1
374 0.09
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.2
382 0.22
383 0.24
384 0.32
385 0.33
386 0.34
387 0.36
388 0.35
389 0.32
390 0.29
391 0.26
392 0.21
393 0.19
394 0.17
395 0.16
396 0.22
397 0.21
398 0.24
399 0.29
400 0.32
401 0.35
402 0.41
403 0.5
404 0.55
405 0.64
406 0.66
407 0.68
408 0.69
409 0.71
410 0.71
411 0.7
412 0.63
413 0.62
414 0.59
415 0.58
416 0.55
417 0.51
418 0.47
419 0.43
420 0.42
421 0.43
422 0.45
423 0.45
424 0.42
425 0.45
426 0.44
427 0.42
428 0.39
429 0.31
430 0.27
431 0.23
432 0.25
433 0.2
434 0.18
435 0.19
436 0.18
437 0.2
438 0.21
439 0.18
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.13
444 0.15
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.14
455 0.2
456 0.21
457 0.29
458 0.34
459 0.4
460 0.47
461 0.52
462 0.57
463 0.59
464 0.7
465 0.73
466 0.78
467 0.82
468 0.84
469 0.86
470 0.85
471 0.83
472 0.76
473 0.68
474 0.61
475 0.55
476 0.51
477 0.45
478 0.39
479 0.35
480 0.31
481 0.29
482 0.27
483 0.24
484 0.21
485 0.21
486 0.21
487 0.22
488 0.23
489 0.23
490 0.21
491 0.2
492 0.17
493 0.14
494 0.12
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.07
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.11
512 0.13
513 0.17
514 0.18
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.21
519 0.26
520 0.24
521 0.22
522 0.22
523 0.3
524 0.34
525 0.33
526 0.34
527 0.32
528 0.34
529 0.34
530 0.34
531 0.29
532 0.26
533 0.26
534 0.22
535 0.19
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.11
540 0.08
541 0.08
542 0.1
543 0.09
544 0.11
545 0.11
546 0.13
547 0.16
548 0.19
549 0.21
550 0.2
551 0.24
552 0.26
553 0.3
554 0.28
555 0.25
556 0.21
557 0.19
558 0.17
559 0.12
560 0.09
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.07
567 0.11
568 0.14
569 0.18
570 0.24
571 0.27
572 0.31
573 0.41
574 0.47
575 0.5
576 0.58
577 0.59
578 0.59
579 0.63
580 0.59
581 0.51
582 0.49
583 0.43
584 0.36
585 0.34
586 0.35
587 0.33
588 0.34
589 0.33
590 0.27
591 0.26
592 0.24
593 0.21
594 0.14
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.11
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.14
603 0.13
604 0.14
605 0.14
606 0.14
607 0.13
608 0.12
609 0.13
610 0.18
611 0.16
612 0.15
613 0.15
614 0.15
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.09
619 0.09
620 0.08
621 0.09
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.07
629 0.11
630 0.12
631 0.13
632 0.16
633 0.19
634 0.2
635 0.24
636 0.3
637 0.33
638 0.34
639 0.37
640 0.36
641 0.33
642 0.33
643 0.29
644 0.25
645 0.17
646 0.14
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.1
655 0.11
656 0.1
657 0.1
658 0.16
659 0.17
660 0.17
661 0.16
662 0.21
663 0.21
664 0.23
665 0.28
666 0.3
667 0.31
668 0.34
669 0.39
670 0.36
671 0.39