FuNGI

U5HJH0

Protein Details

Accession

U5HJH0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MARWRSCRSPRPVRRSLPPNHCHDT	Hydrophilic
97-117	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MARWRSCRSPRPVRRSLPPNHCHDTFLQPIDTSGANPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPDGKPAPKTEQDMMHEVFLYTERVVAMVRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAAEAKVKEEERIKAIEEWEAMGKEVSDEMRGEKGWDSNAITPGTPFMDLLAKSLRYWVAKKLNEDPGWAGLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRSHSSHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFRVLREDVFAQDSKKPRGCHTCGQPGHHSSQCTGKPKDPPLEGRADQLVKPSPLKPFIFLDVSILREYLAVELSAPVHSFPFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLMTIWKNSLESMGGYLAQHGKVNLERAQLILEQLASREDEIFRKRREAEERQDRNVKQRKLENDQRNHGKGGQASGQVGVNWQMQREQDQMKSMSQAALSNGLSENGQHKALSSNGGLPSKPTWVDPGSLPAPSKGDVASMVGSNASIVANRKAIRMANLSARDMIKAEMQASNGGTEEAQKERSGSPTASKKNLSAAELLKKQMMGGDEEEAAEQQEEAEKADEENVEMAATEPEVVDEKKDEAPQVDGEAFAIDGDVDASETSPRGTKRKVEDVEPESAEVTELEDDDDESSEDTSIVVPGGVHKVKVAPLKHMGNNVVEQDDMVKLWEPGYKERYYRQKFGVELSDLEFRKSIVKSYVEGLCWVLEYYYQGTPSWQWYYPHHFSPFASDFVDMKDLNINFTLGQPFRPYEQLMGVFPAASRFHLPEAFQPLMTESESPIIDFYPEEFEVDMNGKKMLWQGVALLPFIDPDRLLTAMGTKYPLLSDFENHRNQMGHDSLFVMQDHPLYDYLEGLYTKRRIQEPAALDTKRSKGLAGLVLPESTCIPGAIYDSPLPSLPDIQSDRSISAEYKFPEQKTPHRSILLPGVKVARPVLSQHDRDGVRRGGGEQRYEGNNGFHAQRRNEQTGPGFHKRDQGLRGQQGYQQGGYQQGGGGGGGYQQQQRPGGYQGQPQQDGYGGYGGAQGYYAQQSVAAGYGGYQPPVVQAGYGGYQPPPQAGGVYGGRGGAPHAPAGYYPPPPIARPQTTYAALPPGMGTAYGGARPAPNAGYQGYQPPTHGRGPPGAPPAAAAYGGYGASAPPPSGAASGWRPGQPPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.86
3	0.86
4	0.85
5	0.82
6	0.81
7	0.78
8	0.71
9	0.64
10	0.58
11	0.55
12	0.51
13	0.46
14	0.4
15	0.33
16	0.32
17	0.32
18	0.28
19	0.23
20	0.22
21	0.23
22	0.21
23	0.21
24	0.21
25	0.22
26	0.22
27	0.21
28	0.17
29	0.16
30	0.16
31	0.16
32	0.16
33	0.13
34	0.13
35	0.12
36	0.1
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.1
42	0.13
43	0.17
44	0.2
45	0.21
46	0.27
47	0.35
48	0.43
49	0.51
50	0.53
51	0.55
52	0.57
53	0.62
54	0.6
55	0.58
56	0.53
57	0.52
58	0.48
59	0.43
60	0.37
61	0.32
62	0.27
63	0.21
64	0.19
65	0.13
66	0.12
67	0.1
68	0.1
69	0.11
70	0.13
71	0.22
72	0.28
73	0.3
74	0.32
75	0.33
76	0.34
77	0.35
78	0.35
79	0.28
80	0.26
81	0.24
82	0.21
83	0.22
84	0.21
85	0.21
86	0.18
87	0.16
88	0.11
89	0.14
90	0.2
91	0.27
92	0.37
93	0.46
94	0.56
95	0.66
96	0.75
97	0.81
98	0.81
99	0.77
100	0.7
101	0.7
102	0.69
103	0.68
104	0.69
105	0.62
106	0.58
107	0.61
108	0.59
109	0.53
110	0.49
111	0.43
112	0.36
113	0.35
114	0.35
115	0.31
116	0.31
117	0.3
118	0.25
119	0.23
120	0.23
121	0.21
122	0.19
123	0.16
124	0.14
125	0.12
126	0.13
127	0.12
128	0.1
129	0.11
130	0.12
131	0.15
132	0.15
133	0.16
134	0.16
135	0.18
136	0.18
137	0.2
138	0.22
139	0.23
140	0.27
141	0.26
142	0.24
143	0.22
144	0.23
145	0.21
146	0.17
147	0.13
148	0.1
149	0.14
150	0.14
151	0.17
152	0.19
153	0.19
154	0.19
155	0.22
156	0.24
157	0.24
158	0.26
159	0.33
160	0.38
161	0.41
162	0.46
163	0.51
164	0.57
165	0.53
166	0.54
167	0.47
168	0.4
169	0.37
170	0.32
171	0.24
172	0.15
173	0.14
174	0.12
175	0.1
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.05
184	0.07
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.08
189	0.1
190	0.11
191	0.16
192	0.21
193	0.28
194	0.38
195	0.41
196	0.44
197	0.52
198	0.56
199	0.59
200	0.63
201	0.64
202	0.63
203	0.7
204	0.69
205	0.65
206	0.67
207	0.59
208	0.49
209	0.41
210	0.33
211	0.25
212	0.25
213	0.21
214	0.15
215	0.14
216	0.14
217	0.11
218	0.1
219	0.08
220	0.04
221	0.03
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.07
228	0.1
229	0.12
230	0.12
231	0.16
232	0.16
233	0.18
234	0.2
235	0.21
236	0.19
237	0.21
238	0.22
239	0.2
240	0.26
241	0.3
242	0.35
243	0.39
244	0.39
245	0.43
246	0.51
247	0.55
248	0.57
249	0.6
250	0.63
251	0.62
252	0.65
253	0.65
254	0.59
255	0.59
256	0.54
257	0.46
258	0.37
259	0.41
260	0.42
261	0.43
262	0.43
263	0.42
264	0.47
265	0.53
266	0.59
267	0.55
268	0.55
269	0.51
270	0.55
271	0.51
272	0.46
273	0.44
274	0.39
275	0.34
276	0.33
277	0.32
278	0.27
279	0.29
280	0.29
281	0.28
282	0.33
283	0.33
284	0.31
285	0.3
286	0.31
287	0.3
288	0.27
289	0.27
290	0.22
291	0.23
292	0.2
293	0.18
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.09
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.12
315	0.13
316	0.14
317	0.13
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.08
322	0.06
323	0.06
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.12
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.11
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.12
369	0.16
370	0.17
371	0.17
372	0.17
373	0.16
374	0.18
375	0.16
376	0.15
377	0.11
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.09
386	0.13
387	0.2
388	0.26
389	0.27
390	0.32
391	0.34
392	0.39
393	0.47
394	0.5
395	0.55
396	0.59
397	0.63
398	0.64
399	0.71
400	0.65
401	0.67
402	0.68
403	0.61
404	0.56
405	0.56
406	0.57
407	0.58
408	0.67
409	0.67
410	0.65
411	0.7
412	0.72
413	0.68
414	0.62
415	0.54
416	0.47
417	0.38
418	0.33
419	0.28
420	0.21
421	0.19
422	0.18
423	0.17
424	0.14
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.12
429	0.12
430	0.13
431	0.13
432	0.16
433	0.2
434	0.21
435	0.19
436	0.22
437	0.24
438	0.22
439	0.23
440	0.21
441	0.18
442	0.15
443	0.15
444	0.12
445	0.13
446	0.13
447	0.12
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.09
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.13
460	0.11
461	0.13
462	0.16
463	0.17
464	0.16
465	0.16
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.13
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.14
474	0.18
475	0.17
476	0.17
477	0.17
478	0.15
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.1
483	0.09
484	0.08
485	0.09
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.06
496	0.07
497	0.11
498	0.12
499	0.12
500	0.14
501	0.14
502	0.16
503	0.18
504	0.18
505	0.21
506	0.22
507	0.23
508	0.23
509	0.23
510	0.2
511	0.18
512	0.16
513	0.11
514	0.1
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.08
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.11
530	0.11
531	0.14
532	0.14
533	0.13
534	0.18
535	0.25
536	0.29
537	0.31
538	0.31
539	0.29
540	0.33
541	0.33
542	0.29
543	0.24
544	0.23
545	0.25
546	0.26
547	0.26
548	0.22
549	0.2
550	0.19
551	0.17
552	0.15
553	0.1
554	0.09
555	0.1
556	0.09
557	0.1
558	0.1
559	0.08
560	0.07
561	0.06
562	0.05
563	0.03
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.03
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.11
591	0.1
592	0.12
593	0.11
594	0.12
595	0.1
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.06
600	0.04
601	0.04
602	0.03
603	0.02
604	0.02
605	0.02
606	0.02
607	0.02
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.07
613	0.09
614	0.13
615	0.15
616	0.21
617	0.26
618	0.35
619	0.37
620	0.37
621	0.43
622	0.43
623	0.45
624	0.39
625	0.34
626	0.25
627	0.23
628	0.2
629	0.12
630	0.09
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.04
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.09
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.14
656	0.19
657	0.19
658	0.18
659	0.24
660	0.28
661	0.3
662	0.32
663	0.3
664	0.26
665	0.27
666	0.24
667	0.18
668	0.14
669	0.12
670	0.1
671	0.09
672	0.07
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.09
678	0.1
679	0.14
680	0.19
681	0.21
682	0.22
683	0.28
684	0.39
685	0.42
686	0.45
687	0.45
688	0.44
689	0.42
690	0.43
691	0.41
692	0.31
693	0.27
694	0.25
695	0.27
696	0.23
697	0.23
698	0.2
699	0.16
700	0.19
701	0.18
702	0.18
703	0.16
704	0.17
705	0.17
706	0.21
707	0.23
708	0.19
709	0.19
710	0.18
711	0.14
712	0.12
713	0.11
714	0.08
715	0.06
716	0.07
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.09
721	0.1
722	0.11
723	0.15
724	0.17
725	0.17
726	0.18
727	0.21
728	0.3
729	0.33
730	0.36
731	0.35
732	0.32
733	0.3
734	0.36
735	0.34
736	0.27
737	0.24
738	0.2
739	0.18
740	0.19
741	0.22
742	0.14
743	0.12
744	0.15
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.14
749	0.11
750	0.13
751	0.16
752	0.12
753	0.13
754	0.14
755	0.14
756	0.15
757	0.17
758	0.17
759	0.14
760	0.16
761	0.17
762	0.15
763	0.16
764	0.14
765	0.12
766	0.11
767	0.13
768	0.1
769	0.1
770	0.11
771	0.11
772	0.12
773	0.14
774	0.15
775	0.16
776	0.22
777	0.22
778	0.2
779	0.19
780	0.19
781	0.19
782	0.18
783	0.15
784	0.09
785	0.11
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.08
793	0.1
794	0.1
795	0.11
796	0.1
797	0.1
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.1
802	0.1
803	0.09
804	0.1
805	0.13
806	0.13
807	0.11
808	0.11
809	0.12
810	0.15
811	0.16
812	0.15
813	0.13
814	0.11
815	0.11
816	0.11
817	0.09
818	0.06
819	0.06
820	0.08
821	0.08
822	0.08
823	0.08
824	0.11
825	0.11
826	0.12
827	0.12
828	0.1
829	0.1
830	0.11
831	0.12
832	0.11
833	0.11
834	0.14
835	0.19
836	0.27
837	0.31
838	0.31
839	0.31
840	0.29
841	0.29
842	0.31
843	0.27
844	0.2
845	0.17
846	0.18
847	0.17
848	0.18
849	0.17
850	0.13
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.11
855	0.11
856	0.1
857	0.1
858	0.1
859	0.09
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.15
864	0.17
865	0.19
866	0.23
867	0.25
868	0.27
869	0.3
870	0.37
871	0.35
872	0.39
873	0.44
874	0.4
875	0.39
876	0.41
877	0.4
878	0.35
879	0.31
880	0.24
881	0.19
882	0.23
883	0.25
884	0.22
885	0.22
886	0.2
887	0.2
888	0.19
889	0.18
890	0.15
891	0.11
892	0.1
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.09
897	0.09
898	0.11
899	0.12
900	0.12
901	0.13
902	0.14
903	0.14
904	0.12
905	0.14
906	0.12
907	0.18
908	0.2
909	0.21
910	0.24
911	0.25
912	0.25
913	0.23
914	0.24
915	0.19
916	0.18
917	0.2
918	0.18
919	0.25
920	0.29
921	0.3
922	0.37
923	0.41
924	0.48
925	0.51
926	0.57
927	0.54
928	0.52
929	0.51
930	0.46
931	0.52
932	0.49
933	0.41
934	0.36
935	0.36
936	0.33
937	0.34
938	0.31
939	0.23
940	0.18
941	0.2
942	0.27
943	0.3
944	0.31
945	0.32
946	0.39
947	0.38
948	0.39
949	0.43
950	0.36
951	0.3
952	0.29
953	0.3
954	0.3
955	0.33
956	0.34
957	0.29
958	0.32
959	0.32
960	0.34
961	0.33
962	0.26
963	0.24
964	0.24
965	0.25
966	0.25
967	0.3
968	0.31
969	0.37
970	0.43
971	0.47
972	0.46
973	0.48
974	0.47
975	0.49
976	0.54
977	0.55
978	0.52
979	0.48
980	0.54
981	0.52
982	0.54
983	0.48
984	0.49
985	0.5
986	0.53
987	0.55
988	0.49
989	0.49
990	0.5
991	0.48
992	0.4
993	0.31
994	0.25
995	0.25
996	0.24
997	0.21
998	0.14
999	0.12
1000	0.12
1001	0.1
1002	0.09
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.08
1006	0.11
1007	0.14
1008	0.16
1009	0.2
1010	0.22
1011	0.23
1012	0.25
1013	0.27
1014	0.32
1015	0.32
1016	0.38
1017	0.42
1018	0.47
1019	0.48
1020	0.45
1021	0.42
1022	0.35
1023	0.32
1024	0.26
1025	0.2
1026	0.12
1027	0.11
1028	0.13
1029	0.12
1030	0.1
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.09
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.07
1042	0.05
1043	0.06
1044	0.13
1045	0.13
1046	0.13
1047	0.13
1048	0.12
1049	0.13
1050	0.16
1051	0.14
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.1
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.11
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.17
1067	0.15
1068	0.16
1069	0.16
1070	0.14
1071	0.14
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.12
1077	0.12
1078	0.13
1079	0.13
1080	0.19
1081	0.22
1082	0.21
1083	0.22
1084	0.26
1085	0.28
1086	0.29
1087	0.38
1088	0.41
1089	0.42
1090	0.44
1091	0.47
1092	0.48
1093	0.48
1094	0.48
1095	0.42
1096	0.38
1097	0.32
1098	0.27
1099	0.23
1100	0.18
1101	0.16
1102	0.14
1103	0.11
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.12
1110	0.12
1111	0.14
1112	0.14
1113	0.14
1114	0.16
1115	0.17
1116	0.18
1117	0.19
1118	0.26
1119	0.27
1120	0.27
1121	0.27
1122	0.31
1123	0.34
1124	0.38
1125	0.4
1126	0.36
1127	0.39
1128	0.42
1129	0.47
1130	0.47
1131	0.43
1132	0.37
1133	0.34
1134	0.34
1135	0.28
1136	0.24
1137	0.17
1138	0.12
1139	0.12
1140	0.12
1141	0.11
1142	0.08
1143	0.07
1144	0.09
1145	0.1
1146	0.09
1147	0.08
1148	0.09
1149	0.1
1150	0.11
1151	0.12
1152	0.15
1153	0.19
1154	0.23
1155	0.27
1156	0.29
1157	0.31

U5HJH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer