FuNGI

U5HCE1

Protein Details

Accession

U5HCE1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-275	DSEPTQTTRRQPNRQKQRQVMIDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
449-462	RAMKSEKKGKKKGN
586-638	PPGRGGKRGRGRGEGGGGRGHDRSSRGGGGRGRGAPNEGRGRGRGRGRGAHNP
819-833	PGAGRGRGRGRGRGA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MEPETQFVDLTGANEEPQVSSGVANRSSSETKQPGETEMGEIIDLITPTASTAEADNEMIVVVVESEAQAATDGVHAASTTASTTDSSGSTLTAAEAPVQSNSSNPTSATASPTNNNLTSLPNDITHILQLGVADPDPPESTTDYAQLVKDLKAKVMQSRNPNKAKNFNTAITVDDDSSMREEGEEREEELAQVENEMKEQGVERDEPEQGSNATQVNAAADESSEAEEEAGEESSSEESSSDDDSSSSSFDSEPTQTTRRQPNRQKQRQVMIDSDQSDLSDSEDPNPSGCSKKVPKTEHELDEDTSVPSLPEIESLPETVDIVRFGVVQNLIENVVVIRADTTGSYRVLDQGTIVCWEDRKIAGTIFDTFGSVLQPFYSLRFPATSPPDPATFTASRPLCYAPTSAHFVFTRELQAQKGSDASNVWDEEVGEGEIEFSDDEAEQEYKRAMKSEKKGKKKGNASVGGAKASTLGSSLDGFKSLPQKPSGPLPEIDEEGPYNLVQRPKGLHLMGTAPPNGPEGRQMFERDTGRTVEGEKEFEFSDNDEEDGGVVKNEGGSEEGGDRHDDEEMDDAKQAELARIMAGPPGRGGKRGRGRGEGGGGRGHDRSSRGGGGRGRGAPNEGRGRGRGRGRGAHNPLSRSDRPPQPGGGDGDDQRRQVAPLPNRAPMGLPMRPMVMGEFGAPSPMGLPQNFAFGLPTNHHLPAPPQQQMFNFAPQAPMMPSSPIPGMYNPYFQPQPTGPHPNLPGLSYAHPQPSFTPDFGAGAQGAYNPQFFAYGPPPLNAMMGGSGQGSKGAGMMMGTGPYGYVPPSPQGQGPGGPGAGRGRGRGRGRGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.12
4	0.12
5	0.13
6	0.1
7	0.11
8	0.16
9	0.2
10	0.22
11	0.22
12	0.23
13	0.27
14	0.3
15	0.32
16	0.37
17	0.37
18	0.37
19	0.41
20	0.41
21	0.39
22	0.39
23	0.37
24	0.3
25	0.26
26	0.24
27	0.19
28	0.18
29	0.15
30	0.12
31	0.11
32	0.08
33	0.07
34	0.06
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.06
39	0.07
40	0.09
41	0.11
42	0.11
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.08
48	0.05
49	0.04
50	0.04
51	0.04
52	0.04
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.05
58	0.05
59	0.06
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.13
89	0.17
90	0.17
91	0.17
92	0.16
93	0.18
94	0.2
95	0.21
96	0.26
97	0.26
98	0.27
99	0.28
100	0.32
101	0.34
102	0.31
103	0.31
104	0.26
105	0.25
106	0.24
107	0.26
108	0.23
109	0.19
110	0.2
111	0.2
112	0.19
113	0.17
114	0.16
115	0.12
116	0.11
117	0.1
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.08
123	0.1
124	0.1
125	0.11
126	0.12
127	0.13
128	0.15
129	0.15
130	0.17
131	0.17
132	0.18
133	0.17
134	0.19
135	0.19
136	0.19
137	0.24
138	0.23
139	0.23
140	0.25
141	0.28
142	0.33
143	0.4
144	0.44
145	0.49
146	0.58
147	0.66
148	0.7
149	0.74
150	0.72
151	0.73
152	0.71
153	0.69
154	0.64
155	0.56
156	0.52
157	0.46
158	0.41
159	0.35
160	0.31
161	0.22
162	0.19
163	0.17
164	0.14
165	0.15
166	0.14
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.15
172	0.15
173	0.15
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.16
178	0.15
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.09
186	0.08
187	0.09
188	0.1
189	0.11
190	0.12
191	0.13
192	0.16
193	0.17
194	0.18
195	0.17
196	0.17
197	0.14
198	0.14
199	0.15
200	0.13
201	0.12
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.1
240	0.11
241	0.13
242	0.17
243	0.2
244	0.23
245	0.3
246	0.4
247	0.46
248	0.56
249	0.64
250	0.7
251	0.79
252	0.86
253	0.88
254	0.85
255	0.85
256	0.82
257	0.75
258	0.68
259	0.6
260	0.55
261	0.46
262	0.4
263	0.31
264	0.23
265	0.2
266	0.17
267	0.15
268	0.13
269	0.12
270	0.13
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.22
279	0.25
280	0.33
281	0.41
282	0.44
283	0.47
284	0.54
285	0.6
286	0.56
287	0.54
288	0.49
289	0.41
290	0.38
291	0.35
292	0.26
293	0.19
294	0.15
295	0.1
296	0.07
297	0.07
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.06
331	0.07
332	0.08
333	0.09
334	0.08
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.1
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.15
372	0.21
373	0.21
374	0.22
375	0.24
376	0.24
377	0.24
378	0.24
379	0.25
380	0.19
381	0.18
382	0.23
383	0.21
384	0.21
385	0.21
386	0.21
387	0.16
388	0.16
389	0.17
390	0.11
391	0.13
392	0.17
393	0.16
394	0.18
395	0.17
396	0.17
397	0.17
398	0.17
399	0.17
400	0.13
401	0.14
402	0.12
403	0.14
404	0.13
405	0.12
406	0.13
407	0.11
408	0.1
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.08
418	0.06
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.11
437	0.14
438	0.21
439	0.29
440	0.4
441	0.48
442	0.57
443	0.65
444	0.7
445	0.76
446	0.76
447	0.75
448	0.74
449	0.69
450	0.63
451	0.6
452	0.53
453	0.45
454	0.36
455	0.28
456	0.2
457	0.15
458	0.11
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.09
468	0.16
469	0.18
470	0.21
471	0.22
472	0.23
473	0.24
474	0.31
475	0.32
476	0.27
477	0.25
478	0.26
479	0.26
480	0.25
481	0.24
482	0.18
483	0.15
484	0.13
485	0.13
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.13
490	0.12
491	0.14
492	0.15
493	0.17
494	0.21
495	0.2
496	0.18
497	0.16
498	0.2
499	0.21
500	0.21
501	0.19
502	0.15
503	0.15
504	0.17
505	0.16
506	0.12
507	0.14
508	0.14
509	0.15
510	0.17
511	0.19
512	0.19
513	0.25
514	0.26
515	0.23
516	0.23
517	0.22
518	0.21
519	0.2
520	0.19
521	0.19
522	0.18
523	0.19
524	0.17
525	0.17
526	0.16
527	0.17
528	0.16
529	0.12
530	0.13
531	0.12
532	0.12
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.08
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.07
548	0.08
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.08
556	0.11
557	0.12
558	0.11
559	0.12
560	0.12
561	0.11
562	0.13
563	0.13
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.15
575	0.15
576	0.19
577	0.21
578	0.29
579	0.37
580	0.45
581	0.48
582	0.47
583	0.5
584	0.48
585	0.52
586	0.45
587	0.37
588	0.31
589	0.28
590	0.25
591	0.23
592	0.21
593	0.17
594	0.17
595	0.18
596	0.19
597	0.23
598	0.22
599	0.27
600	0.28
601	0.3
602	0.32
603	0.34
604	0.32
605	0.28
606	0.31
607	0.28
608	0.32
609	0.36
610	0.33
611	0.31
612	0.33
613	0.36
614	0.4
615	0.44
616	0.43
617	0.41
618	0.46
619	0.5
620	0.56
621	0.6
622	0.62
623	0.6
624	0.56
625	0.55
626	0.55
627	0.53
628	0.48
629	0.49
630	0.47
631	0.48
632	0.49
633	0.47
634	0.41
635	0.42
636	0.4
637	0.35
638	0.31
639	0.29
640	0.33
641	0.34
642	0.32
643	0.29
644	0.26
645	0.24
646	0.27
647	0.33
648	0.33
649	0.4
650	0.44
651	0.46
652	0.46
653	0.45
654	0.39
655	0.36
656	0.36
657	0.27
658	0.26
659	0.23
660	0.23
661	0.23
662	0.22
663	0.18
664	0.13
665	0.11
666	0.1
667	0.1
668	0.09
669	0.1
670	0.09
671	0.08
672	0.07
673	0.11
674	0.13
675	0.11
676	0.15
677	0.14
678	0.18
679	0.18
680	0.18
681	0.15
682	0.14
683	0.17
684	0.16
685	0.2
686	0.2
687	0.21
688	0.21
689	0.21
690	0.23
691	0.3
692	0.34
693	0.36
694	0.34
695	0.36
696	0.37
697	0.43
698	0.42
699	0.37
700	0.33
701	0.28
702	0.27
703	0.24
704	0.25
705	0.2
706	0.19
707	0.15
708	0.15
709	0.15
710	0.17
711	0.17
712	0.17
713	0.18
714	0.17
715	0.23
716	0.22
717	0.26
718	0.25
719	0.29
720	0.29
721	0.28
722	0.32
723	0.28
724	0.32
725	0.35
726	0.43
727	0.39
728	0.44
729	0.46
730	0.46
731	0.45
732	0.39
733	0.35
734	0.29
735	0.31
736	0.27
737	0.29
738	0.3
739	0.29
740	0.3
741	0.29
742	0.33
743	0.33
744	0.3
745	0.3
746	0.24
747	0.25
748	0.24
749	0.24
750	0.17
751	0.13
752	0.13
753	0.1
754	0.12
755	0.12
756	0.12
757	0.1
758	0.1
759	0.11
760	0.11
761	0.16
762	0.17
763	0.23
764	0.24
765	0.24
766	0.26
767	0.25
768	0.26
769	0.2
770	0.17
771	0.11
772	0.1
773	0.1
774	0.09
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.09
794	0.11
795	0.14
796	0.18
797	0.2
798	0.21
799	0.25
800	0.26
801	0.26
802	0.27
803	0.27
804	0.24
805	0.22
806	0.23
807	0.21
808	0.25
809	0.24
810	0.26
811	0.29
812	0.37
813	0.42

U5HCE1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer