Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PPJ2

Protein Details
Accession A0A1D8PPJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-591LQWYGKCYNQHNIKPKKKKKSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
584-593KXPKKKKKSL
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0034967  C:Set3 complex  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0030447  P:filamentous growth  
GO:0044182  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:1900429  P:negative regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C601220CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSLTSKELNYLIWRYLQESGYDLSAYALDQQSQCSEYENNPTTQELIQKIKPGCLVDLIQKGILYMAAEQEATDSTTNLSLYGALIQDDLNNLKDNNNISNGSNGSRFALKSEIETNGEQKDSEKQTNNDKDNQDIEMTDALNKEVQQQEIIEFETQLLSPQLKFAPSLTCDWHPTTEVFAYGKDDGTATINAIQDGKIIETRTLTHPNLLNIKNQINIVSWSPQGSLIITCGANSELRAWSPDGKLKNIASTIVDEAISLENTKLISIISSLSWSPTGKFLLSIDSSNQVCIWDGTTISLIKQIKNLEINDDSVVCSCWLSEDKFAVTTNTNGIKIYDILQPPSSHFGNQLDVQPIGLLNGHEHNISLMKLNPVTKLLATCSDFDYSIKVWSSSSSQECLDLNINPEKKYTLKLHAAPMIGLIWLPDSNSNERSLLLSVSMEGILNIWDAKTSENIKSSELFNNKDNFTNELKDDDNNNDNNNNDTTIKDVLVFNAVLSPDGKYLALGDDYCRVTIWDVDTTHYLNEPKDLIRCKAVYKPEISAEDKLKATIGICDMKWDHESKXNMCFLQWYGKCYNQHNIKXPKKKKKSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.3
4 0.25
5 0.24
6 0.24
7 0.21
8 0.2
9 0.17
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.14
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.17
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.2
23 0.2
24 0.3
25 0.32
26 0.31
27 0.32
28 0.32
29 0.31
30 0.31
31 0.33
32 0.29
33 0.31
34 0.32
35 0.38
36 0.39
37 0.39
38 0.41
39 0.37
40 0.33
41 0.3
42 0.3
43 0.29
44 0.33
45 0.31
46 0.28
47 0.26
48 0.25
49 0.21
50 0.19
51 0.13
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.18
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.25
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.21
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.17
96 0.19
97 0.17
98 0.19
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.24
106 0.21
107 0.19
108 0.24
109 0.27
110 0.33
111 0.36
112 0.37
113 0.48
114 0.57
115 0.6
116 0.6
117 0.55
118 0.52
119 0.48
120 0.46
121 0.36
122 0.27
123 0.24
124 0.18
125 0.17
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.18
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.15
154 0.16
155 0.19
156 0.21
157 0.22
158 0.25
159 0.26
160 0.26
161 0.23
162 0.21
163 0.22
164 0.18
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.13
190 0.17
191 0.23
192 0.22
193 0.24
194 0.25
195 0.28
196 0.34
197 0.33
198 0.32
199 0.3
200 0.31
201 0.28
202 0.27
203 0.24
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.15
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.24
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.04
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.18
297 0.19
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.11
302 0.11
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.21
332 0.19
333 0.14
334 0.16
335 0.15
336 0.16
337 0.17
338 0.19
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.12
344 0.09
345 0.09
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.17
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.15
381 0.17
382 0.19
383 0.18
384 0.17
385 0.19
386 0.19
387 0.2
388 0.19
389 0.15
390 0.17
391 0.22
392 0.24
393 0.23
394 0.23
395 0.23
396 0.22
397 0.27
398 0.28
399 0.28
400 0.33
401 0.36
402 0.4
403 0.42
404 0.41
405 0.35
406 0.31
407 0.24
408 0.17
409 0.14
410 0.09
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.11
416 0.15
417 0.17
418 0.18
419 0.18
420 0.18
421 0.19
422 0.17
423 0.14
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.11
440 0.14
441 0.17
442 0.21
443 0.23
444 0.24
445 0.25
446 0.27
447 0.31
448 0.32
449 0.32
450 0.33
451 0.37
452 0.37
453 0.4
454 0.38
455 0.35
456 0.34
457 0.34
458 0.3
459 0.28
460 0.28
461 0.26
462 0.27
463 0.28
464 0.3
465 0.29
466 0.3
467 0.3
468 0.29
469 0.3
470 0.28
471 0.25
472 0.2
473 0.18
474 0.19
475 0.18
476 0.18
477 0.16
478 0.16
479 0.14
480 0.16
481 0.15
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.08
492 0.09
493 0.1
494 0.12
495 0.11
496 0.12
497 0.16
498 0.18
499 0.18
500 0.17
501 0.16
502 0.15
503 0.18
504 0.19
505 0.19
506 0.18
507 0.21
508 0.23
509 0.23
510 0.23
511 0.24
512 0.23
513 0.18
514 0.21
515 0.21
516 0.21
517 0.27
518 0.31
519 0.3
520 0.34
521 0.36
522 0.37
523 0.42
524 0.48
525 0.47
526 0.45
527 0.46
528 0.45
529 0.49
530 0.5
531 0.48
532 0.44
533 0.43
534 0.4
535 0.37
536 0.31
537 0.27
538 0.23
539 0.21
540 0.22
541 0.21
542 0.21
543 0.26
544 0.27
545 0.29
546 0.32
547 0.31
548 0.28
549 0.31
550 0.37
551 0.34
552 0.43
553 0.4
554 0.37
555 0.35
556 0.35
557 0.38
558 0.37
559 0.41
560 0.36
561 0.42
562 0.47
563 0.51
564 0.59
565 0.59
566 0.63
567 0.68
568 0.74
569 0.78
570 0.84
571 0.9