Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H0P1

Protein Details
Accession U5H0P1    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-157QGRIERAQGEKNRKRKRPRLGDKTGKTSIRBasic
475-513RRTMVEARKKKEENRRKHAPKGIDREKLRPKPAKKAVIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-151AQGEKNRKRKRPRLGDKT
481-509ARKKKEENRRKHAPKGIDREKLRPKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MVKIKTLHRSLEEHLPSSSSSTAPVSRNLDPSLHPFSRSREYTRAVTASKLERMFAKPFVGALEGHGDGLYCMTKDEAGALPRIASGSGDGEVRVWDLATRQSVWYATDAHRGMVKALAFSHPAAGEQGRIERAQGEKNRKRKRPRLGDKTGKTSIRHGADTDDESDDQDQDDEIVRSVSRGSPRLLTCGVDKTVKLWDVTAHKGNDVKPLQTYVGKSGFNSISHHRYDPVFATASHSIDIWDETKTAPLSTLKFHSTSNLSTGEHIVCVAFNKSETSVLASSGSDRTVCLYDLRSGKAVGRVSMTMRVNQLVFNPLQPPVLLCASEDHNLYTFDMRNLSITTQMYKGHVGAVMSCDWAPTGREFVSGSYDRTVRLWTAGEGKSRDTYHTKRMQRVFTSLYTLDNRFVLSGSDDSNLRIWKARASDKLGVIDKREQARKEYRDGLRDKWGSVGDVAKLERQRFMPKSIHNAETLRRTMVEARKKKEENRRKHAPKGIDREKLRPKPAKKAVIEQVES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.33
4 0.32
5 0.29
6 0.19
7 0.17
8 0.19
9 0.23
10 0.24
11 0.3
12 0.32
13 0.34
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.34
18 0.38
19 0.41
20 0.37
21 0.36
22 0.35
23 0.39
24 0.46
25 0.48
26 0.49
27 0.47
28 0.5
29 0.51
30 0.54
31 0.53
32 0.45
33 0.43
34 0.43
35 0.4
36 0.42
37 0.39
38 0.34
39 0.33
40 0.37
41 0.38
42 0.35
43 0.32
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.22
48 0.17
49 0.15
50 0.16
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.12
57 0.11
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.1
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.13
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.24
96 0.24
97 0.23
98 0.25
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.2
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.24
122 0.31
123 0.39
124 0.46
125 0.56
126 0.66
127 0.73
128 0.81
129 0.83
130 0.86
131 0.86
132 0.89
133 0.89
134 0.9
135 0.92
136 0.87
137 0.85
138 0.81
139 0.73
140 0.64
141 0.58
142 0.54
143 0.47
144 0.42
145 0.34
146 0.3
147 0.28
148 0.28
149 0.26
150 0.2
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.15
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.13
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.22
172 0.25
173 0.25
174 0.23
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.19
179 0.19
180 0.16
181 0.19
182 0.19
183 0.18
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.23
188 0.27
189 0.24
190 0.24
191 0.27
192 0.27
193 0.32
194 0.29
195 0.26
196 0.21
197 0.22
198 0.23
199 0.22
200 0.22
201 0.18
202 0.21
203 0.2
204 0.19
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.23
211 0.24
212 0.25
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.14
219 0.13
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.15
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.16
246 0.17
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.14
280 0.16
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.21
286 0.2
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.22
292 0.21
293 0.18
294 0.19
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.13
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.18
354 0.18
355 0.19
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.2
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.19
366 0.21
367 0.25
368 0.25
369 0.27
370 0.29
371 0.29
372 0.32
373 0.33
374 0.35
375 0.4
376 0.48
377 0.52
378 0.57
379 0.63
380 0.66
381 0.61
382 0.61
383 0.56
384 0.48
385 0.47
386 0.39
387 0.36
388 0.33
389 0.31
390 0.27
391 0.23
392 0.22
393 0.16
394 0.16
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.17
403 0.17
404 0.16
405 0.19
406 0.18
407 0.21
408 0.27
409 0.33
410 0.36
411 0.42
412 0.47
413 0.45
414 0.51
415 0.52
416 0.48
417 0.46
418 0.46
419 0.45
420 0.47
421 0.51
422 0.46
423 0.48
424 0.56
425 0.57
426 0.57
427 0.61
428 0.59
429 0.61
430 0.64
431 0.6
432 0.6
433 0.57
434 0.51
435 0.45
436 0.4
437 0.33
438 0.31
439 0.29
440 0.2
441 0.22
442 0.23
443 0.24
444 0.28
445 0.29
446 0.3
447 0.31
448 0.39
449 0.39
450 0.44
451 0.46
452 0.46
453 0.55
454 0.57
455 0.56
456 0.51
457 0.51
458 0.5
459 0.5
460 0.47
461 0.39
462 0.33
463 0.34
464 0.38
465 0.44
466 0.49
467 0.5
468 0.55
469 0.63
470 0.69
471 0.75
472 0.78
473 0.8
474 0.8
475 0.81
476 0.85
477 0.84
478 0.87
479 0.87
480 0.86
481 0.86
482 0.86
483 0.86
484 0.84
485 0.8
486 0.8
487 0.83
488 0.81
489 0.81
490 0.8
491 0.77
492 0.79
493 0.84
494 0.84
495 0.78
496 0.79
497 0.78