FuNGI

U5H374

Protein Details

Accession

U5H374

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
566-585	VKEQRSARRAEKKSTKDEFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
558-579	DKRARKSAVKEQRSARRAEKKS

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 8, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSLWRKPGTRTFQLVHRSQRDPLINDPEASDRVLKEVGAKQRPKGNAAGPPASDLELTVDRAPPSIEGDAAAYGVYFDDTQYDYMQHLRRVGDVGESYLVEAPSKKGKRPVGNKDVRSSEGVVVKDSPSTELELPEEALPSHPLDEVSYVEATISRTETKGLQPDLDPNIREVLEALDDDDYALDAEGDSEDEDDFFNSIVQGGEVIGSHGWHRPNLDEEPGSDRKERDPLARGMRELALTTHGDGNDEVGDSLEARVARFKATSANAPSSELSDEDGFSEGGDTIAELKAGSARRPPRRGASAVGSHFSMSSSAMFRNQGLQTLDERFDQIEKLYEDDSDDESWGEHSDGPGEDDNAQPRATPLGQPREDLDQILEEFLSRYEILGGKMRHRAEGDDGDLAHMGELDRLRSELASLDIAGSSAATDSVTVARQLEKDSILAAVERQRKEARARKGNESIDIDERPKERWDCETVLSTYSNISNHPRLLRVKGGPTSRASRIRLDEKTGFPIVGSAVRAGLRAGSGETIGDAEDEDEGDDEAPRVETIKRPRDETAEDKRARKSAVKEQRSARRAEKKSTKDEFSQEMTRQKRVAGRAVADGAAADVRVGQGARRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.67
3	0.65
4	0.61
5	0.57
6	0.62
7	0.61
8	0.56
9	0.56
10	0.55
11	0.5
12	0.47
13	0.46
14	0.42
15	0.36
16	0.34
17	0.29
18	0.2
19	0.21
20	0.21
21	0.19
22	0.21
23	0.27
24	0.35
25	0.42
26	0.46
27	0.48
28	0.55
29	0.58
30	0.56
31	0.55
32	0.51
33	0.48
34	0.51
35	0.51
36	0.44
37	0.43
38	0.41
39	0.36
40	0.29
41	0.22
42	0.19
43	0.16
44	0.18
45	0.17
46	0.19
47	0.18
48	0.19
49	0.19
50	0.16
51	0.17
52	0.16
53	0.14
54	0.12
55	0.13
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.05
64	0.05
65	0.07
66	0.08
67	0.1
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.19
72	0.23
73	0.24
74	0.26
75	0.26
76	0.26
77	0.27
78	0.27
79	0.24
80	0.21
81	0.2
82	0.17
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.16
87	0.12
88	0.13
89	0.14
90	0.22
91	0.26
92	0.29
93	0.35
94	0.44
95	0.53
96	0.62
97	0.7
98	0.72
99	0.78
100	0.78
101	0.77
102	0.73
103	0.65
104	0.58
105	0.5
106	0.43
107	0.38
108	0.34
109	0.29
110	0.26
111	0.24
112	0.22
113	0.2
114	0.17
115	0.13
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.16
120	0.15
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.11
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.11
142	0.1
143	0.11
144	0.12
145	0.15
146	0.17
147	0.23
148	0.23
149	0.23
150	0.23
151	0.27
152	0.32
153	0.33
154	0.29
155	0.24
156	0.25
157	0.23
158	0.22
159	0.18
160	0.13
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.04
172	0.03
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.05
194	0.04
195	0.05
196	0.06
197	0.09
198	0.1
199	0.11
200	0.12
201	0.13
202	0.17
203	0.19
204	0.21
205	0.18
206	0.18
207	0.25
208	0.27
209	0.28
210	0.27
211	0.26
212	0.25
213	0.3
214	0.31
215	0.28
216	0.3
217	0.34
218	0.4
219	0.4
220	0.39
221	0.35
222	0.34
223	0.29
224	0.25
225	0.19
226	0.13
227	0.11
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.09
235	0.08
236	0.07
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.09
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.13
250	0.14
251	0.19
252	0.2
253	0.22
254	0.22
255	0.23
256	0.23
257	0.19
258	0.18
259	0.14
260	0.12
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.05
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.15
281	0.23
282	0.31
283	0.34
284	0.37
285	0.39
286	0.43
287	0.44
288	0.4
289	0.37
290	0.35
291	0.33
292	0.31
293	0.26
294	0.22
295	0.2
296	0.17
297	0.12
298	0.07
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.13
306	0.13
307	0.15
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.19
313	0.14
314	0.15
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.09
319	0.1
320	0.09
321	0.11
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.13
327	0.1
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.08
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.11
343	0.13
344	0.12
345	0.12
346	0.1
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.15
351	0.19
352	0.27
353	0.28
354	0.29
355	0.3
356	0.32
357	0.31
358	0.27
359	0.21
360	0.14
361	0.13
362	0.13
363	0.11
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.1
373	0.15
374	0.17
375	0.19
376	0.25
377	0.26
378	0.26
379	0.26
380	0.26
381	0.25
382	0.26
383	0.24
384	0.19
385	0.19
386	0.17
387	0.16
388	0.15
389	0.1
390	0.08
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.05
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.15
431	0.22
432	0.22
433	0.26
434	0.28
435	0.32
436	0.42
437	0.48
438	0.51
439	0.54
440	0.58
441	0.62
442	0.68
443	0.66
444	0.62
445	0.58
446	0.51
447	0.45
448	0.43
449	0.37
450	0.32
451	0.31
452	0.28
453	0.3
454	0.29
455	0.27
456	0.29
457	0.33
458	0.31
459	0.33
460	0.35
461	0.31
462	0.3
463	0.29
464	0.24
465	0.2
466	0.19
467	0.17
468	0.15
469	0.2
470	0.21
471	0.25
472	0.26
473	0.31
474	0.32
475	0.36
476	0.4
477	0.39
478	0.41
479	0.44
480	0.46
481	0.44
482	0.45
483	0.46
484	0.47
485	0.5
486	0.47
487	0.46
488	0.49
489	0.53
490	0.52
491	0.54
492	0.52
493	0.47
494	0.5
495	0.45
496	0.38
497	0.29
498	0.27
499	0.21
500	0.18
501	0.16
502	0.11
503	0.11
504	0.12
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.09
532	0.1
533	0.18
534	0.27
535	0.37
536	0.4
537	0.43
538	0.46
539	0.51
540	0.56
541	0.58
542	0.58
543	0.59
544	0.62
545	0.63
546	0.65
547	0.63
548	0.6
549	0.58
550	0.55
551	0.55
552	0.6
553	0.63
554	0.66
555	0.71
556	0.77
557	0.75
558	0.74
559	0.73
560	0.73
561	0.71
562	0.74
563	0.75
564	0.73
565	0.79
566	0.8
567	0.76
568	0.71
569	0.71
570	0.66
571	0.62
572	0.61
573	0.56
574	0.57
575	0.56
576	0.55
577	0.51
578	0.5
579	0.5
580	0.48
581	0.51
582	0.48
583	0.46
584	0.46
585	0.47
586	0.42
587	0.35
588	0.3
589	0.22
590	0.16
591	0.13
592	0.08
593	0.06
594	0.06
595	0.08
596	0.08
597	0.08

U5H374

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer