Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H004

Protein Details
Accession U5H004    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-99RPFPTKQTKATKQHLKRQALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-193KGAKGKEKLTAKKRS
234-247TRSKEGQGRKKGAK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MPRPTQQRRSLPGHSKAASSRKGAPRSTVLDDDLMGLSAGDQLMRPRDTRQTSFDAESRNDDDEAQDEDPALPSTITPGRPFPTKQTKATKQHLKRQALLDKITSSQQPYSKSHARRMKRASKPENNLVADLRQVEQALPPTSLTTTTLMGDALGMQHGEEVEEDVDVGMEEGVVPGLKGAKGKEKLTAKKRSRVLESEASRLPAVLTNKDFKKDAFAAIRLHMMNQIKAEKETRSKEGQGRKKGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.62
3 0.62
4 0.63
5 0.58
6 0.52
7 0.54
8 0.54
9 0.59
10 0.57
11 0.55
12 0.53
13 0.54
14 0.55
15 0.48
16 0.4
17 0.34
18 0.33
19 0.29
20 0.23
21 0.17
22 0.12
23 0.09
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.05
28 0.06
29 0.08
30 0.13
31 0.15
32 0.16
33 0.18
34 0.28
35 0.34
36 0.37
37 0.4
38 0.41
39 0.43
40 0.45
41 0.45
42 0.4
43 0.36
44 0.36
45 0.34
46 0.3
47 0.27
48 0.23
49 0.21
50 0.18
51 0.2
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.07
60 0.06
61 0.1
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.19
67 0.23
68 0.24
69 0.29
70 0.37
71 0.41
72 0.47
73 0.54
74 0.61
75 0.66
76 0.75
77 0.77
78 0.73
79 0.78
80 0.8
81 0.74
82 0.69
83 0.68
84 0.64
85 0.58
86 0.52
87 0.43
88 0.35
89 0.32
90 0.29
91 0.23
92 0.19
93 0.18
94 0.19
95 0.22
96 0.24
97 0.29
98 0.35
99 0.38
100 0.45
101 0.5
102 0.51
103 0.55
104 0.61
105 0.65
106 0.66
107 0.72
108 0.73
109 0.73
110 0.75
111 0.73
112 0.71
113 0.61
114 0.54
115 0.44
116 0.35
117 0.27
118 0.22
119 0.16
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.02
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.07
167 0.09
168 0.17
169 0.22
170 0.23
171 0.31
172 0.39
173 0.48
174 0.55
175 0.65
176 0.63
177 0.67
178 0.73
179 0.71
180 0.69
181 0.64
182 0.62
183 0.61
184 0.57
185 0.55
186 0.5
187 0.45
188 0.38
189 0.34
190 0.27
191 0.23
192 0.22
193 0.22
194 0.25
195 0.3
196 0.33
197 0.36
198 0.37
199 0.32
200 0.37
201 0.33
202 0.36
203 0.34
204 0.35
205 0.34
206 0.35
207 0.39
208 0.32
209 0.31
210 0.3
211 0.27
212 0.26
213 0.27
214 0.3
215 0.27
216 0.3
217 0.32
218 0.33
219 0.39
220 0.42
221 0.44
222 0.46
223 0.52
224 0.57
225 0.64
226 0.68
227 0.7