Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HCT3

Protein Details
Accession U5HCT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-204GYEGREERRARRQQRRPRQRPRRGGAIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-201ERRARRQQRRPRQRPRRGG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036224  GINS_bundle-like_dom_sf  
IPR005339  GINS_Psf1  
Gene Ontology GO:0000811  C:GINS complex  
GO:0006260  P:DNA replication  
CDD cd21696  GINS_B_Psf1  
Amino Acid Sequences MLGDHANLLVLDSHRSIQTRTLQRYAEPTLRALIRECHHLADPVERAVRMYDPSQASPNAIPEMPQDVFAEMRLLSLALQRNRRALEVYALQRIEILKTRYWEMGGNLGKAFGTGTEVRGHMVVVDEAFAKGYADLCLKFKTGLYNDPDDDEDDDEQEDGDEQDEEGNLELDEEEDGYEGREERRARRQQRRPRQRPRRGGAIAGDPTSLMDAIDLLGGGIDQEPPKDLFLSVRVLKDVGDVETLSGARLSLTKGSQYFLPREDVEQMVVLGEVEVID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.2
4 0.23
5 0.32
6 0.39
7 0.44
8 0.48
9 0.47
10 0.48
11 0.52
12 0.52
13 0.49
14 0.41
15 0.36
16 0.35
17 0.35
18 0.34
19 0.3
20 0.31
21 0.27
22 0.32
23 0.32
24 0.29
25 0.29
26 0.31
27 0.3
28 0.29
29 0.29
30 0.27
31 0.27
32 0.24
33 0.24
34 0.22
35 0.22
36 0.19
37 0.18
38 0.21
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.26
46 0.21
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.2
51 0.17
52 0.18
53 0.16
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.1
64 0.17
65 0.2
66 0.26
67 0.28
68 0.32
69 0.33
70 0.33
71 0.31
72 0.26
73 0.25
74 0.26
75 0.27
76 0.28
77 0.27
78 0.26
79 0.25
80 0.24
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.17
85 0.18
86 0.21
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.16
91 0.22
92 0.21
93 0.21
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.06
100 0.08
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.13
129 0.13
130 0.18
131 0.2
132 0.22
133 0.22
134 0.22
135 0.23
136 0.19
137 0.18
138 0.15
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.12
169 0.14
170 0.19
171 0.29
172 0.39
173 0.49
174 0.59
175 0.69
176 0.75
177 0.85
178 0.91
179 0.92
180 0.94
181 0.95
182 0.95
183 0.95
184 0.89
185 0.88
186 0.79
187 0.71
188 0.63
189 0.59
190 0.5
191 0.4
192 0.34
193 0.24
194 0.21
195 0.18
196 0.15
197 0.07
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.22
225 0.2
226 0.15
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.12
239 0.13
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.25
244 0.29
245 0.31
246 0.29
247 0.33
248 0.29
249 0.31
250 0.33
251 0.3
252 0.26
253 0.23
254 0.21
255 0.16
256 0.14
257 0.12
258 0.08