FuNGI

U5HA18

Protein Details

Accession

U5HA18

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
355-378	STSTSHKSKSSRRRSKTPSESETD	Hydrophilic
380-405	DSSQDARHRRRPSKLSSSKPKKSGLD	Hydrophilic
461-481	REEEERERRRKEEKERRRKRG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
54-60	RRRRERL
366-367	RR
386-401	RHRRRPSKLSSSKPKK
461-481	REEEERERRRKEEKERRRKRG

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013256 Chromatin_SPT2
Pfam	View protein in Pfam PF08243 SPT2

Amino Acid Sequences

MNSSFKALLAQATKDTAKSQLELTQTLQKRQLAAEEAERSNLQKERQRQAEIERRRRERLARETEVEERTRLRPLPKTRNLTELKMERRKRGLNEDGRDDWILNKLEAGNPVSAPDVPTSKAKIPGQSLKQLMAVASKIPPSAMRTNPKPSSSSSSSSIKPVPTNEQKLAKKRDALFREEDDEGLGSGSMALARQRGVYEERERESSPRASTSTLALGSGSKPISAKQIIRANTGSNGSAKTSSRPTNGTLLSSAHGKPLKKGSKNVPGFDPSQFVKLNTEKRDTRTIEEIERDMRVRKLAKGVGVGGVKGKSADEFGILEVKATTGGTKRKTEGGHPTTSSTSNPAKKSKASTSTSTSHKSKSSRRRSKTPSESETDSDSSQDARHRRRPSKLSSSKPKKSGLDDSVRSEIWRLMGRDRSKDLARPFDLSDSEEEGMEVDGEELEREERRAERISRLEEREEEERERRRKEEKERRRKRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.27
4	0.26
5	0.25
6	0.25
7	0.26
8	0.29
9	0.3
10	0.32
11	0.36
12	0.37
13	0.41
14	0.44
15	0.41
16	0.4
17	0.39
18	0.4
19	0.35
20	0.35
21	0.37
22	0.37
23	0.36
24	0.37
25	0.36
26	0.33
27	0.33
28	0.34
29	0.34
30	0.35
31	0.43
32	0.5
33	0.56
34	0.6
35	0.59
36	0.64
37	0.68
38	0.72
39	0.73
40	0.74
41	0.73
42	0.74
43	0.77
44	0.76
45	0.75
46	0.75
47	0.74
48	0.7
49	0.68
50	0.67
51	0.66
52	0.63
53	0.54
54	0.46
55	0.4
56	0.35
57	0.37
58	0.36
59	0.36
60	0.4
61	0.49
62	0.57
63	0.63
64	0.7
65	0.66
66	0.72
67	0.7
68	0.65
69	0.63
70	0.61
71	0.62
72	0.64
73	0.67
74	0.64
75	0.68
76	0.7
77	0.67
78	0.67
79	0.68
80	0.67
81	0.67
82	0.67
83	0.62
84	0.58
85	0.53
86	0.44
87	0.35
88	0.31
89	0.26
90	0.19
91	0.18
92	0.16
93	0.17
94	0.2
95	0.21
96	0.16
97	0.15
98	0.16
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.16
106	0.19
107	0.21
108	0.28
109	0.29
110	0.32
111	0.36
112	0.43
113	0.45
114	0.48
115	0.46
116	0.4
117	0.39
118	0.35
119	0.29
120	0.22
121	0.18
122	0.13
123	0.13
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.12
128	0.16
129	0.22
130	0.27
131	0.33
132	0.38
133	0.47
134	0.51
135	0.51
136	0.48
137	0.45
138	0.46
139	0.43
140	0.42
141	0.37
142	0.37
143	0.36
144	0.38
145	0.37
146	0.31
147	0.29
148	0.28
149	0.32
150	0.36
151	0.41
152	0.42
153	0.48
154	0.52
155	0.58
156	0.63
157	0.58
158	0.56
159	0.56
160	0.6
161	0.55
162	0.54
163	0.5
164	0.45
165	0.45
166	0.38
167	0.33
168	0.24
169	0.21
170	0.16
171	0.11
172	0.09
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.03
177	0.03
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.08
184	0.11
185	0.16
186	0.21
187	0.25
188	0.27
189	0.29
190	0.3
191	0.29
192	0.31
193	0.3
194	0.25
195	0.23
196	0.22
197	0.21
198	0.21
199	0.2
200	0.18
201	0.14
202	0.12
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.11
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.13
212	0.15
213	0.16
214	0.2
215	0.25
216	0.26
217	0.29
218	0.29
219	0.26
220	0.25
221	0.25
222	0.19
223	0.14
224	0.13
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.16
230	0.18
231	0.19
232	0.21
233	0.22
234	0.25
235	0.25
236	0.23
237	0.19
238	0.17
239	0.16
240	0.17
241	0.15
242	0.15
243	0.17
244	0.17
245	0.19
246	0.27
247	0.34
248	0.35
249	0.41
250	0.44
251	0.52
252	0.55
253	0.55
254	0.48
255	0.43
256	0.42
257	0.37
258	0.32
259	0.23
260	0.22
261	0.21
262	0.18
263	0.2
264	0.23
265	0.3
266	0.3
267	0.36
268	0.35
269	0.38
270	0.46
271	0.43
272	0.41
273	0.4
274	0.38
275	0.35
276	0.35
277	0.33
278	0.26
279	0.25
280	0.23
281	0.19
282	0.18
283	0.2
284	0.2
285	0.2
286	0.24
287	0.24
288	0.25
289	0.24
290	0.24
291	0.24
292	0.22
293	0.2
294	0.17
295	0.15
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.16
315	0.2
316	0.23
317	0.25
318	0.3
319	0.31
320	0.36
321	0.42
322	0.41
323	0.42
324	0.4
325	0.42
326	0.39
327	0.39
328	0.34
329	0.29
330	0.31
331	0.32
332	0.36
333	0.38
334	0.4
335	0.42
336	0.48
337	0.5
338	0.51
339	0.49
340	0.49
341	0.5
342	0.52
343	0.53
344	0.54
345	0.49
346	0.44
347	0.45
348	0.48
349	0.52
350	0.58
351	0.64
352	0.68
353	0.73
354	0.8
355	0.83
356	0.86
357	0.87
358	0.86
359	0.8
360	0.75
361	0.71
362	0.63
363	0.59
364	0.5
365	0.4
366	0.31
367	0.26
368	0.21
369	0.19
370	0.24
371	0.28
372	0.34
373	0.42
374	0.52
375	0.59
376	0.67
377	0.73
378	0.76
379	0.79
380	0.8
381	0.82
382	0.83
383	0.87
384	0.86
385	0.84
386	0.82
387	0.75
388	0.72
389	0.71
390	0.68
391	0.67
392	0.62
393	0.61
394	0.57
395	0.53
396	0.46
397	0.38
398	0.31
399	0.25
400	0.27
401	0.23
402	0.26
403	0.34
404	0.39
405	0.43
406	0.46
407	0.48
408	0.46
409	0.51
410	0.51
411	0.52
412	0.5
413	0.47
414	0.45
415	0.43
416	0.41
417	0.36
418	0.33
419	0.28
420	0.26
421	0.22
422	0.2
423	0.16
424	0.15
425	0.13
426	0.1
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.14
436	0.15
437	0.2
438	0.27
439	0.3
440	0.36
441	0.43
442	0.5
443	0.55
444	0.58
445	0.59
446	0.55
447	0.57
448	0.54
449	0.51
450	0.5
451	0.5
452	0.55
453	0.58
454	0.61
455	0.62
456	0.65
457	0.7
458	0.75
459	0.78
460	0.79
461	0.82

U5HA18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer