Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HIP1

Protein Details
Accession U5HIP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-78MLLRRAPVRSHSCRGRKRHDRRVSPGHDDKHEHRCDPHPKRKHKETDDKHRHNGDKAKHRNDHRHRHHVSQNRGBasic
89-109HSDTHTHKKHDQKHGKVHASVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-70RGRKRHDRRVSPGHDDKHEHRCDPHPKRKHKETDDKHRHNGDKAKHRNDHRHR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036749  Expansin_CBD_sf  
IPR036908  RlpA-like_sf  
CDD cd22272  DPBB_EXLX1-like  
Amino Acid Sequences MNEGMLLRRAPVRSHSCRGRKRHDRRVSPGHDDKHEHRCDPHPKRKHKETDDKHRHNGDKAKHRNDHRHRHHVSQNRGPYASSTLSSQHSDTHTHKKHDQKHGKVHASVPDPTTGSGDKGKSGTQGPQSKQPQQPVGSTQKDSPPATRQPTPALLKAGKAGVITTFQGTMQGPATFYATADDGRGNCLLPVREDNMFAAINDLAWAGSAQCGMCVRVETLDGSKSTTVMITNREPEPVEGAIDLSLEAFTALAREEVGRLAVNWTPVDCVKAGLVTSQSPSVVWKNGSTEYWFGLQVRESALPLAQVSIRITSPGNTTSTPLDPGFSPWSLLNRTDYNFWLASSGIEDGKGGKSVGPFDIKVQYQDESEILFPAIKLNSEVLKQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.61
3 0.67
4 0.74
5 0.82
6 0.84
7 0.86
8 0.88
9 0.9
10 0.9
11 0.9
12 0.9
13 0.91
14 0.88
15 0.87
16 0.85
17 0.8
18 0.76
19 0.73
20 0.69
21 0.69
22 0.67
23 0.59
24 0.55
25 0.58
26 0.63
27 0.67
28 0.71
29 0.71
30 0.77
31 0.84
32 0.9
33 0.91
34 0.91
35 0.91
36 0.91
37 0.92
38 0.93
39 0.91
40 0.89
41 0.87
42 0.81
43 0.78
44 0.76
45 0.74
46 0.73
47 0.75
48 0.76
49 0.76
50 0.8
51 0.83
52 0.85
53 0.87
54 0.86
55 0.86
56 0.81
57 0.82
58 0.82
59 0.8
60 0.79
61 0.77
62 0.75
63 0.69
64 0.64
65 0.56
66 0.49
67 0.44
68 0.37
69 0.28
70 0.21
71 0.2
72 0.22
73 0.23
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.26
78 0.29
79 0.37
80 0.41
81 0.45
82 0.51
83 0.57
84 0.65
85 0.71
86 0.76
87 0.74
88 0.78
89 0.82
90 0.81
91 0.74
92 0.68
93 0.64
94 0.57
95 0.5
96 0.41
97 0.33
98 0.28
99 0.26
100 0.25
101 0.19
102 0.17
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.22
111 0.27
112 0.34
113 0.34
114 0.43
115 0.48
116 0.54
117 0.56
118 0.57
119 0.54
120 0.48
121 0.49
122 0.46
123 0.49
124 0.44
125 0.41
126 0.38
127 0.36
128 0.4
129 0.39
130 0.35
131 0.33
132 0.36
133 0.39
134 0.41
135 0.38
136 0.36
137 0.42
138 0.42
139 0.38
140 0.36
141 0.31
142 0.28
143 0.27
144 0.24
145 0.18
146 0.15
147 0.12
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.12
217 0.13
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.19
224 0.15
225 0.13
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.19
273 0.21
274 0.22
275 0.21
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.19
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.16
302 0.18
303 0.17
304 0.19
305 0.21
306 0.22
307 0.23
308 0.21
309 0.2
310 0.17
311 0.21
312 0.23
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.23
317 0.25
318 0.26
319 0.26
320 0.26
321 0.28
322 0.29
323 0.29
324 0.29
325 0.27
326 0.25
327 0.21
328 0.18
329 0.16
330 0.14
331 0.15
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.16
342 0.21
343 0.23
344 0.22
345 0.24
346 0.31
347 0.3
348 0.31
349 0.31
350 0.28
351 0.25
352 0.26
353 0.24
354 0.19
355 0.18
356 0.16
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.15
361 0.15
362 0.13
363 0.15
364 0.16
365 0.19