FuNGI

U5HH62

Protein Details

Accession

U5HH62

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
575-597	GDAFRKRKGKRAAGRAEIQRRLE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
293-309	GRRKDKAQGGGRKKKGK
579-590	RKRKGKRAAGRA

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 4, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028884 Trm82 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0036265 P:RNA (guanine-N7)-methylation GO:0030488 P:tRNA methylation
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MSHHPLQATAFPSDAEAHFFVLASGNRLSVVSTEGMAITATAQDHQGLIRLVACHGTRYIVSTGEDKMLNVYEYQAKTVPSEEDQDEEKEQEVTDSKMEETSAPKGKLELRSSRELVKRANAMQVTEKGEIIVGDKFGDVYVYPLFAHPVDPTATTATTTEKTNPKSPKAQPILGHVSMLNALVHVPAAPDYGLPHDLIVTGDRDEHVRVSRYPQGHIIDKFLWGSQKFVTALLYIPATLAFPTSLIISGGGDSTLQVWNLASGKLLNRFGIQDLLEKYIVVGPELPTPVPAGRRKDKAQGGGRKKKGKQVEQEEGQGEAEEDVLVVNEDEQVEVVEGTEQTEAAQTGGVQLPTGLGVTHLEFVGGHSHRAGPGVIVAAAGCTALLYIPVELLLGQPTQRTTQIVDYSHPVLALCGRPNEDEHPSSLAKTDFHVTIDLTRPEKYESSTLDGEDAEEETERCALQQASYELVPDQPEGSFSGGMELIWDQALVRTAREAALPTTTKDRAPDVSSLYPVLSLLHHPDTNFEVLAAAGGKNMEAEGDTNGKSVSVWKSVARGWGQKKGADAEGDAEEGDAFRKRKGKRAAGRAEIQRRLELEQERLKNLQTGAEGENKAMEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.17
4	0.17
5	0.17
6	0.16
7	0.15
8	0.17
9	0.17
10	0.16
11	0.16
12	0.15
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.11
17	0.13
18	0.1
19	0.1
20	0.11
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.09
25	0.07
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.13
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.18
40	0.19
41	0.17
42	0.17
43	0.18
44	0.16
45	0.19
46	0.2
47	0.17
48	0.19
49	0.19
50	0.2
51	0.22
52	0.22
53	0.18
54	0.19
55	0.18
56	0.17
57	0.15
58	0.16
59	0.2
60	0.2
61	0.22
62	0.22
63	0.22
64	0.22
65	0.24
66	0.24
67	0.19
68	0.23
69	0.22
70	0.22
71	0.24
72	0.26
73	0.26
74	0.24
75	0.22
76	0.18
77	0.17
78	0.17
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.16
88	0.22
89	0.28
90	0.27
91	0.27
92	0.29
93	0.35
94	0.4
95	0.44
96	0.46
97	0.44
98	0.5
99	0.52
100	0.57
101	0.57
102	0.53
103	0.5
104	0.47
105	0.47
106	0.42
107	0.46
108	0.4
109	0.36
110	0.37
111	0.38
112	0.37
113	0.32
114	0.3
115	0.23
116	0.22
117	0.2
118	0.17
119	0.13
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.06
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.09
136	0.1
137	0.11
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.16
147	0.21
148	0.25
149	0.3
150	0.37
151	0.43
152	0.45
153	0.52
154	0.56
155	0.6
156	0.6
157	0.61
158	0.55
159	0.56
160	0.58
161	0.49
162	0.44
163	0.34
164	0.28
165	0.23
166	0.22
167	0.14
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.08
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.09
192	0.09
193	0.11
194	0.13
195	0.14
196	0.15
197	0.19
198	0.25
199	0.26
200	0.27
201	0.3
202	0.31
203	0.34
204	0.34
205	0.33
206	0.27
207	0.27
208	0.26
209	0.21
210	0.22
211	0.17
212	0.18
213	0.14
214	0.17
215	0.16
216	0.16
217	0.15
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.09
252	0.12
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.14
258	0.15
259	0.13
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.15
264	0.14
265	0.13
266	0.13
267	0.12
268	0.09
269	0.09
270	0.07
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.08
275	0.09
276	0.11
277	0.15
278	0.19
279	0.23
280	0.28
281	0.33
282	0.35
283	0.42
284	0.44
285	0.48
286	0.51
287	0.55
288	0.6
289	0.65
290	0.7
291	0.7
292	0.69
293	0.67
294	0.67
295	0.65
296	0.63
297	0.62
298	0.62
299	0.56
300	0.57
301	0.5
302	0.43
303	0.35
304	0.26
305	0.18
306	0.1
307	0.08
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.05
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.04
343	0.03
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.12
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.02
370	0.02
371	0.02
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.16
390	0.2
391	0.2
392	0.21
393	0.22
394	0.23
395	0.22
396	0.21
397	0.16
398	0.12
399	0.13
400	0.14
401	0.13
402	0.13
403	0.15
404	0.15
405	0.18
406	0.21
407	0.23
408	0.22
409	0.21
410	0.23
411	0.22
412	0.22
413	0.22
414	0.19
415	0.15
416	0.16
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.15
421	0.13
422	0.15
423	0.19
424	0.21
425	0.2
426	0.21
427	0.21
428	0.23
429	0.23
430	0.23
431	0.22
432	0.21
433	0.25
434	0.25
435	0.24
436	0.22
437	0.21
438	0.19
439	0.15
440	0.13
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.12
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.16
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.12
460	0.11
461	0.09
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.1
466	0.09
467	0.11
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.05
476	0.06
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.11
482	0.12
483	0.13
484	0.14
485	0.11
486	0.17
487	0.18
488	0.19
489	0.24
490	0.25
491	0.25
492	0.26
493	0.28
494	0.26
495	0.27
496	0.29
497	0.29
498	0.29
499	0.3
500	0.28
501	0.25
502	0.21
503	0.18
504	0.16
505	0.11
506	0.11
507	0.14
508	0.18
509	0.19
510	0.19
511	0.21
512	0.23
513	0.24
514	0.22
515	0.17
516	0.13
517	0.11
518	0.12
519	0.11
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.06
529	0.08
530	0.12
531	0.12
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.12
536	0.17
537	0.18
538	0.19
539	0.21
540	0.21
541	0.25
542	0.27
543	0.34
544	0.34
545	0.39
546	0.41
547	0.48
548	0.5
549	0.48
550	0.49
551	0.47
552	0.44
553	0.37
554	0.32
555	0.26
556	0.24
557	0.22
558	0.19
559	0.15
560	0.12
561	0.1
562	0.12
563	0.14
564	0.14
565	0.19
566	0.27
567	0.3
568	0.39
569	0.5
570	0.59
571	0.63
572	0.73
573	0.78
574	0.78
575	0.84
576	0.85
577	0.84
578	0.8
579	0.73
580	0.66
581	0.58
582	0.52
583	0.51
584	0.45
585	0.44
586	0.46
587	0.48
588	0.48
589	0.48
590	0.47
591	0.44
592	0.4
593	0.36
594	0.28
595	0.28
596	0.27
597	0.33
598	0.32
599	0.28

U5HH62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer