Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H1D0

Protein Details
Accession U5H1D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-533VKQWEDKKANPSPRKKKEPVKTVPVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-113KPNWKRGKRIGGGGPGFGNTKK
514-527KKANPSPRKKKEPV
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10, nucl 5.5, E.R. 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGVPTFWKELEAAEERDTIMGIATTKFQSSPGVRGFRLGIDASLWLFHIRKVAAMDASEVGANADVRTFFFRIVELLSQGCLLIFVFDGPGKPNWKRGKRIGGGGPGFGNTKKKEDVLIRRLIDLFGMRRRIAPGEAEAELAAMAVRGEIDAVLTDDVDALLFGAPLVIRNPPKTGKLAGPTQSKAEESAVEEPSLRKVKPSTTSTTTSKDARRIYSSLNILDTLELDQESLILVALLSGGDYHPQGVAFVGAKIACALARCGFGRSLLRCLELHRDGSAEQKRAFADWRAKVAEELRTDSRKFLARKAPKLSQQLPGQTDFPNPEIVRHYTSPNVSSGLDPPVWDTPVNLKQLVLYCSENFEWSNADVRARFRSLVYKPLLMLEIRRRALYDDRNADRSVPEAPYRSEYEGPLFAEVRDLKNADSTQNVLSYRVRLDPLPFSTLINEALPAVDPYPRTEVSEGDFDTDGSVIKQRRAPKDYGDSITPFMHWVPVAYVEAHPDGREAVKQWEDKKANPSPRKKKEPVKTVPVVAATKGKGAPNTLMFKATKEGVAKAQVGSKGKENKKEENFDRFKTFLSPTTSPIKTKMRRTLFTVGDDPESEPFVIDDEEEEPFVCDNEDDSDGDLPDPKTVGAVPRVPHKVIGTAEHLESPKKIKVAPPPTLLVVDDDEGSEGSGGEELEVRELRNMPPSLSKGRALKREARDEERWGKCEVLEVSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.25
4 0.24
5 0.17
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.15
15 0.21
16 0.23
17 0.29
18 0.34
19 0.39
20 0.38
21 0.4
22 0.41
23 0.35
24 0.35
25 0.28
26 0.21
27 0.16
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.17
36 0.16
37 0.18
38 0.2
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.22
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.14
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.1
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.11
77 0.16
78 0.22
79 0.24
80 0.33
81 0.42
82 0.5
83 0.58
84 0.64
85 0.7
86 0.69
87 0.75
88 0.73
89 0.71
90 0.65
91 0.58
92 0.49
93 0.4
94 0.37
95 0.31
96 0.31
97 0.24
98 0.27
99 0.28
100 0.28
101 0.32
102 0.4
103 0.48
104 0.48
105 0.55
106 0.51
107 0.51
108 0.51
109 0.45
110 0.37
111 0.31
112 0.28
113 0.26
114 0.29
115 0.27
116 0.28
117 0.31
118 0.31
119 0.29
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.11
129 0.08
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.11
156 0.14
157 0.16
158 0.2
159 0.23
160 0.26
161 0.28
162 0.3
163 0.3
164 0.32
165 0.37
166 0.4
167 0.43
168 0.42
169 0.41
170 0.4
171 0.35
172 0.32
173 0.26
174 0.2
175 0.17
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.17
181 0.23
182 0.26
183 0.23
184 0.21
185 0.22
186 0.27
187 0.34
188 0.39
189 0.39
190 0.4
191 0.46
192 0.46
193 0.49
194 0.47
195 0.45
196 0.44
197 0.44
198 0.42
199 0.41
200 0.41
201 0.39
202 0.39
203 0.39
204 0.38
205 0.33
206 0.3
207 0.26
208 0.22
209 0.2
210 0.17
211 0.11
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.03
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.14
252 0.18
253 0.19
254 0.21
255 0.2
256 0.22
257 0.21
258 0.23
259 0.27
260 0.25
261 0.24
262 0.2
263 0.2
264 0.18
265 0.27
266 0.3
267 0.27
268 0.25
269 0.26
270 0.26
271 0.26
272 0.28
273 0.25
274 0.28
275 0.26
276 0.29
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.28
281 0.29
282 0.22
283 0.23
284 0.24
285 0.27
286 0.27
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.3
292 0.36
293 0.41
294 0.47
295 0.53
296 0.56
297 0.56
298 0.63
299 0.59
300 0.56
301 0.52
302 0.5
303 0.46
304 0.42
305 0.37
306 0.3
307 0.28
308 0.23
309 0.2
310 0.2
311 0.17
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.22
317 0.22
318 0.2
319 0.21
320 0.21
321 0.18
322 0.18
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.14
335 0.18
336 0.2
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.2
341 0.21
342 0.17
343 0.14
344 0.12
345 0.14
346 0.15
347 0.14
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.12
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.13
361 0.2
362 0.2
363 0.26
364 0.26
365 0.24
366 0.23
367 0.24
368 0.24
369 0.17
370 0.19
371 0.19
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.23
376 0.24
377 0.3
378 0.32
379 0.32
380 0.33
381 0.35
382 0.37
383 0.37
384 0.36
385 0.3
386 0.25
387 0.2
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.17
393 0.19
394 0.21
395 0.2
396 0.18
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.14
402 0.11
403 0.14
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.16
410 0.17
411 0.14
412 0.13
413 0.14
414 0.13
415 0.16
416 0.16
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.16
425 0.18
426 0.19
427 0.21
428 0.19
429 0.18
430 0.18
431 0.18
432 0.17
433 0.13
434 0.11
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.09
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.2
450 0.18
451 0.16
452 0.16
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.1
457 0.07
458 0.12
459 0.11
460 0.14
461 0.19
462 0.26
463 0.34
464 0.38
465 0.4
466 0.41
467 0.48
468 0.5
469 0.49
470 0.44
471 0.38
472 0.36
473 0.34
474 0.28
475 0.2
476 0.15
477 0.14
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.11
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.14
495 0.2
496 0.24
497 0.26
498 0.35
499 0.37
500 0.39
501 0.46
502 0.49
503 0.55
504 0.6
505 0.68
506 0.7
507 0.77
508 0.84
509 0.84
510 0.86
511 0.85
512 0.87
513 0.84
514 0.82
515 0.76
516 0.68
517 0.62
518 0.56
519 0.47
520 0.38
521 0.34
522 0.25
523 0.23
524 0.24
525 0.23
526 0.2
527 0.21
528 0.23
529 0.24
530 0.28
531 0.26
532 0.28
533 0.26
534 0.26
535 0.27
536 0.25
537 0.22
538 0.19
539 0.2
540 0.2
541 0.23
542 0.23
543 0.22
544 0.25
545 0.26
546 0.27
547 0.27
548 0.32
549 0.38
550 0.42
551 0.51
552 0.52
553 0.58
554 0.63
555 0.7
556 0.69
557 0.7
558 0.7
559 0.65
560 0.64
561 0.55
562 0.49
563 0.44
564 0.4
565 0.35
566 0.36
567 0.34
568 0.32
569 0.39
570 0.4
571 0.37
572 0.42
573 0.46
574 0.46
575 0.54
576 0.6
577 0.61
578 0.61
579 0.67
580 0.68
581 0.62
582 0.59
583 0.54
584 0.46
585 0.4
586 0.38
587 0.33
588 0.25
589 0.23
590 0.18
591 0.14
592 0.12
593 0.11
594 0.1
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.12
609 0.11
610 0.13
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.18
615 0.15
616 0.15
617 0.15
618 0.13
619 0.12
620 0.13
621 0.18
622 0.19
623 0.23
624 0.24
625 0.33
626 0.38
627 0.38
628 0.39
629 0.36
630 0.36
631 0.33
632 0.35
633 0.31
634 0.29
635 0.29
636 0.31
637 0.31
638 0.27
639 0.28
640 0.29
641 0.28
642 0.27
643 0.28
644 0.3
645 0.39
646 0.47
647 0.52
648 0.51
649 0.51
650 0.5
651 0.49
652 0.44
653 0.36
654 0.28
655 0.22
656 0.18
657 0.15
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.09
662 0.07
663 0.06
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.08
668 0.08
669 0.13
670 0.14
671 0.14
672 0.17
673 0.19
674 0.2
675 0.26
676 0.27
677 0.25
678 0.31
679 0.36
680 0.4
681 0.42
682 0.46
683 0.47
684 0.54
685 0.6
686 0.6
687 0.64
688 0.66
689 0.73
690 0.75
691 0.74
692 0.71
693 0.72
694 0.75
695 0.73
696 0.66
697 0.58
698 0.51
699 0.43
700 0.45